Inicio
Contacto
Mapa del sitio
Directorio
Correo
Tienda Virtual
IngresarBiología (plan 1997) 2025-1
Séptimo Semestre, Taller Nivel 3
| Profesor | Angélica González Oliver |
| Profesor | Héctor Alessandro López Hernández |
| Profesor | Richell Maribet Ramírez Molina |
TEMARIO DEL TALLER DE
ANTROPOLOGÍA MOLECULAR Nivel III.
Semestre 2025-1. Grupo 5491. 18 créditos.
Facultad de Ciencias, UNAM.
IMPARTIDO POR LO PROFESORES
Dra. Angélica González Oliver
M. en C. Héctor Alessandro López Hernández
M. en C. Richell Maribet Ramírez Molina
Laboratorio Antropología Molecular. Facultad Ciencias, UNAM.
El objetivo general del curso es revisar los conceptos básicos de la Antropología Molecular, que es una línea de investigación relativamente reciente e interesante, y de interés para un amplio sector de la comunidad científica.
Objetivos particulares:
1. Adquirir experiencia en revisar artículos científicos relevantes, incluyendo los más recientes, ya que son las fuentes originales de la información científica.
2. Conocer el reglamento de seguridad del Laboratorio de Antropología Molecular y las medidas preventivas en el estudio del DNA moderno.
3. Aprender el funcionamiento del material y equipo de laboratorio.
4. Aprender las metodologías que se utilizan en el análisis del DNA mitocondrial y cromosoma “Y”.
Contenido Temático en las clases Teóricas:
1. Genética de Poblaciones y Evolución
1.1 Conceptos de Evolución.
1.2 Fuerzas evolutivas: mutación, migración, deriva génica y selección natural.
1.3 Teoría Neutral de la Evolución y Evolución Molecular.
1.4 Genética de Poblaciones: frecuencias alélicas (y haplotípicas), cambios de tamaño poblacional y estructura poblacional.
3. Diversidad genética del mtDNA en las poblaciones mexicanas
Se realizará lectura y discusión de artículos publicados en el grupo de investigación de Antropología Molecular.
SE REQUIEREN TRES DIAS A LA SEMANA CON TRES HORAS CADA UNO.
Horario Laboratorio: lunes 14:30 a 17:30, miércoles de 11:00 a 14:00 hrs.
Teoría: viernes de 11:00 a 14:00 hrs.
Temario en el Laboratorio
1.1. Método de extracción de DNA.
1.2. Método de la reacción en cadena de la polimerasa punto final y tiempo real.
1.3. Método de electroforesis en geles de poliacrilamida.
1.4. Método de análisis de restricción.
1.5. Método de cuantificación de DNA.
1.6. Método de purificación de productos de PCR.
1.7. Método de secuenciación de DNA.
PLAN DE TRABAJO A DESARROLLAR DEL LABORATORIO DEL 05 DE AGOSTO AL 20 DE NOVIEMBRE DEL 2024
30 CLASES PRÁCTICAS
|
Fecha |
Actividades en el Laboratorio de Antropología Molecular |
Espacio |
|
05-agosto |
1. Bienvenida. 2. Practicar pipeteo. |
Lab. de Productos. |
|
07-agosto |
3. Preparación de soluciones. 4. Esterilizar material. 5. Practicar pipeteo. |
Lab de DNA Moderno. |
|
12-agosto |
6. Extracción de DNA. 7. Diseño de los ensayos de PCR (A, B, C y D). |
Lab. DNA Moderno |
|
14-agosto |
8. PCR del haplogrupo A. 9. Preparación de 1 gel de poliacrilamida al 12 %. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
19-agosto |
10. Electroforesis de los productos de PCR-A. 11. Preparación de 1 gel de poliacrilamida al 12 %. 12. Restricción de los productos de A. |
Lab de Productos. |
|
21-agosto |
13. Electroforesis de la restricción de A. 14. PCR del haplogrupo C. 15. Preparación de 1 gel de poliacrilamida al 12 %. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
26-agosto |
16. Electroforesis de los productos de PCR-C. 17. Preparación de 1 gel de poliacrilamida al 12 %. 18. Restricción de los productos de C. |
Lab de Productos. |
|
28-agosto |
19. Electroforesis de la restricción de C. 20. PCR del haplogrupo D. 21. Preparación de 1 gel de poliacrilamida al 12 %. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
02-septiembre |
22. Electroforesis de los productos de PCR-D. 23. Preparación de 1 gel de poliacrilamida al 12 %. 24. Restricción de los productos de D. |
Lab de Productos. |
|
04-septiembre |
25. Electroforesis de la restricción de D. 26. PCR punto final del haplogrupo B. 27. Preparar un gel de poliacrilamida al 14 %. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
09-septiembre |
28. Cuantificación de DNA. 29. Electroforesis de los productos de PCR-B. 30. Diseño del PCR tiempo real. |
Lab de Productos. |
|
11-septiembre |
31. PCR tiempo real del haplogrupo B. 32. Discusión de los resultados de haplogrupos mitocondriales. 33. Diseño de los ensayos de PCR de la D-Loop. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
18-septiembre |
34. PCR de RHI. 35. Preparar un gel de poliacrilamida al 12 %. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
23-septiembre |
36. PCR de RHII-III. 37. Preparar un gel de poliacrilamida al 12 %. 38. Electroforesis de los productos de RHI. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
25-septiembre |
39. PCR de RHIII. 40. Preparar un gel de poliacrilamida al 12 %. 41. Electroforesis de los productos de RHII-III. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
30-septiembre |
42. Electroforesis de los productos de RHIII. 43. Purificación de los amplicones con ExoZap. 44. Diseño de las reacciones de secuenciación. |
Lab de Productos. |
|
02-octubre |
45. Reacción de secuenciación. 46. Llevar la secuenciación al Laboratorio de Secuenciación, Pabellón de la biodiversidad. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
07-octubre |
47. Análisis de los electroferogramas. |
Salón pendiente |
|
09-octubre |
48. Edición de secuencias. 49. Identificación de los haplotipos mitocondriales(mitomaster y haplogrep). |
Salón pendiente |
|
14-octubre |
50. Discusión de los resultados de haplotipos mitocondriales. 51. Diseño de los ensayos de cromosoma Y. |
Salón pendiente |
|
16-octubre |
52. PCR del haplogrupo Q-M3, cromosoma Y. 53. Preparar un gel de poliacrilamida al 12 %. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
21-octubre |
54. Electroforesis de los productos de Q-M3. 55. Restricción de los productos de PCR-Q-M3. |
Lab de Productos. |
|
23-octubre |
56. PCR del haplogrupo Q-M242, cromosoma Y. 57. Electroforesis de la restricción Q-M3. 58. Preparar un gel de poliacrilamida al 12 %. |
Lab. DNA Moderno → Lab de Productos. |
|
28-octubre |
59. Electroforesis de los productos de Q-M242. 60. Restricción de los productos de PCR-Q-M242. 61. Preparar un gel de poliacrilamida al 12 %. |
Lab de Productos. |
|
30-octubre |
62. Electroforesis de la restricción Q-M242. |
Lab de Productos. |
|
04-noviembre |
63. Discusión de resultados de cromosoma Y. |
Salón pendiente |
|
06-noviembre |
64. Pautas para los seminarios y revisión de las presentaciones. |
Salón pendente |
|
11-noviembre |
65. Seminario. |
Salón pendiente |
|
13-noviembre |
66. Seminario. |
Salón pendiente |
|
20-noviembre |
67. Salida de campo. |
Se propone una visita al museo Templo mayor el 18 de octubre.
Evaluación.
Asistencia obligatoria
Participación en clase 100%
Realización de tareas y ejercicios.
Literatura
1. Angélica González Oliver. INTRODUCCIÓN A LA ANTROPOGÍA MOLECULAR. Análisis molecular de DNA humano en el Laboratorio. 2023. Editorial Facultad de Ciencias, UNAM.
2. Álvarez-Sandoval, B. A., Manzanilla, L. R., González-Ruiz, M., Malgosa, A., & Montiel, R. 2015. Genetic evidence supports the multiethnic character of Teopancazco, a neighborhood center of Teotihuacan, Mexico (ad 200-600). PLoS ONE 10(7), e0132371.
3. Brown, M. D., Seyed H. Hosseine, Antonio Torroni, Hans-Jürgen Bandelt, Jon C. Allen, Theodore G. Schurr, Rosaria Scozzari, Fulvio Cruciani, and Douglas C. Wallace. MtDNA haplogroup X: An ancient link between Europe/Western Asia and North America?. Am. J. Hum. Genet. 63: 1852-1861, 1998.
4. De la Cruz-Laina, I., González-Oliver, A., Kemp B., Román, J.A., Smith, D.G., Torre-Blanco, A. 2008. Sex identification of children sacrificed to the ancient Aztec rain gods in Tlatelolco. Current Anthropology, 49(3), 519-526.
5. González-Martín, A. et al. 2015. Demographic history of indigenous populations in Mesoamerica based on mtDNA sequence data. PLoS One, 10.
6. González-Oliver, Angélica., Garfias-Morales, E., Jetzabel Bravo-López, M and De La Cruz Laina, M. I. 2022. Genetic Relationships Between Mesoamerican Ancient Populations And With American Greater Southwest And Caribbean Populations Close To Mesoamerican Borders. Human Biology v 93, no. 4.
7. González-Oliver, A., Garfias-Morales, E., David G. Smith, & Quinto-Sánchez, M. 2017. Mitochondrial DNA analysis of Mazahua and Otomi indigenous populations from Estado de México suggests a distant common ancestry. Human biology, 89(3), 195-216.
8. González‐Oliver, A., Márquez‐Morfín, L., Jiménez, J. C., & Torre‐Blanco, A. Founding Amerindian mitochondrial DNA lineages in ancient Maya from Xcaret, Quintana Roo. 2001. American Journal of Physical Anthropology, 116(3), 230-235.
9. González-Oliver, A., Pineda-Vázquez, D., Garfias-Morales, E., De La Cruz-Laina, I., Medrano-González, L., Márquez-Morfín, L. & Ortega-Muñoz, A. 2019. Genetic Overview of the Maya Populations: Mitochondrial DNA Haplogroups. Human biology, 90(4), 281-300.
10. Joseph G. Lorenz & David G. Smith. 1996.Distribution of four founding mtDNA haplogroups among Native North Americans. American Journal of physical anthropology, 101: 307-323.
11. Kemp, B., & Schurr, T. G. 2010. Ancient and Modern Genetic Variation in the Americas (1 ed.). Center of Archaeological Investigations. pp: 12-50.
12. Lehninger Albert, Nelson David and Michael Cox. Principles of Biochemistry. Worth Publishers. New York.
13. Ochoa-Lugo, de Lourdes Muñoz, Pérez-Ramírez, Beaty, López-Armenta, Cervini & Silva, … Romano-Pacheco. 2017. Genetic Affiliation of Pre-Hispanic and Contemporary Mayas through Maternal Linage. Human Biology, 88(2), 136.
14. Peñaloza-Espinosa, R.I. et al. 2007. Characterization of mtDNA Haplogroups in 14 Mexican Indigenous Populations. Hum. Biol. 79, 313–320.
15. Sandoval, K., Buentello-Malo, L., Peñaloza-Espinosa, R., Avelino, H., Salas, A., Calafell, F., & Comas, D. 2009. Linguistic and maternal genetic diversity are not correlated in Native Mexicans. Human Genetics, 126(4), 521–531.
16. Torroni, A; Theodore G. Shurr, Chi-Chuan Yang, Emöke J. E. Szathmary, Robert C. Williams, Moses S. Schanfield, Gary A. Troup, William C. Knowler, Dale N. Lawrence, Kenneth M. Weiss and Douglas C. Wallace. Native American Mitochondrial DNA Analysis indicates that the Amerind and the Nadene populations were founded by two independent migrations. Genetic 130: 153-162 , January 1992.
17. Torroni, A; Theodore Schurr, Margaret Cabell, Michael Brown, James Neel, Merethe Larsen, ... & Douglas Wallace. Asian affinities and continental radiation of the four founding Native American mtDNAs. American journal of human genetics, 53(3), 563. 1993
Literatura Complementaria
1. Héctor A. López Hernández. (2019). Análisis de marcadores genéticos del DNA mitocondrial en indígenas teenek que habitan la Huasteca Potosina, México. Tesis de Licenciatura. Universidad Nacional Autónoma de México.
2. Alexa Jazive Valdés Trujillo. (2024). Identificación de los haplotipos y subhaplotipos mitocondriales de la región hipervariable del DNA mitocondrial en indígenas nahuas y totonacas que habitan en el centro de México. Tesis de Licenciatura. Universidad Nacional Autónoma de México.
3. Guadalupe E. Alarcón González. (2017). Revisión histórica de la investigación del DNA mitocondrial humano en Sudamérica relacionada con el poblamiento de América. Seminario de Titulación. Universidad Nacional Autónoma de México.
4. Benjamín Cristian Corona Comunidad. (2014). ANÁLISIS DE LOS LINAJES DEL CROMOSOMA “Y” EN CUATRO POBLACIONES INDÍGENAS DE MESOAMÉRICA. Tesis de Licenciatura. Universidad Nacional Autónoma de México.
5. Dirce Pineda Vázquez. (2015). Estudio del DNA mitocondrial en poblaciones indígenas contemporáneas: Mixe, Mixteca y Maya del sureste de México. Tesis de Maestría. Universidad Nacional Autónoma de México.
Facebook
Twitter
Youtube