Biología (plan 2025) 2025-1

Primer Semestre, Métodos básicos de biología

Profesores: César N. Cortés Rubio y Ma. Magdalena López Ramírez

Horario: Lunes y Jueves 11:30 am a 14:30 pm.

Que el alumnado adquiera los conocimientos teóricos sobre las metodologías empleadas en las ciencias biológicas, así como las habilidades prácticas básicas sobre el desarrollo del trabajo en el laboratorio y de gabinete, que incluye: el manejo de muestras biológicas, instrumentos y materiales, con conocimiento, responsabilidad, equidad bajo valores éticos y bioéticos que regulan la práctica científica.

Objetivos particulares:

Que el alumnado:
1. Adquiera conocimientos, los aprenda y aplique con principios éticos, bioéticos y legales vigentes, para una buena praxis científica.
2. Adquiera conocimientos, los aprenda y aplique con principios éticos, bioéticos y legales vigentes, para el manejo responsable de los modelos de estudio biológico.
3. Adquiera conocimientos sobre los principios de física y química que sustentan el trabajo en un laboratorio de ciencias biológicas.
4. Desarrolle habilidades teórico-prácticas para el manejo del equipo, instrumental y técnicas básicas de las actividades experimentales de biología, con responsabilidad ética y bioética.
5. Se introduzca en las prácticas de observación, medición y diseño experimental en el laboratorio.
6. Adquiera habilidades para describir y reportar fenómenos biológicos, en términos cuantitativos y cualitativos.

Evaluación:

• 50% Teoría
• 50% Laboratorio.

Evaluación:

• Asistencia a clases teóricas.
• Trabajo de laboratorio.
• Reporte de prácticas
• Ejercios en clase y tareas.

Evidencias de evaluación:

• Ensayos.
• Tareas de investigación o análisis.
• Fichas de trabajo.
• Seminarios.
• Exámenes.
• Cuestionarios.
• Reportes (prácticas en laboratorio): El cual contendrá el esquema básico de Portada (Titulo de la práctica, integrantes del equipo, asignatura, escudo de la Institución), Introducción breve, Objetivo, Materiales, Metodología (diagrama de flujo o mapa conceptual), Resultados (HR), Discusión de resultados, Conclusiones y Bibliografía.

Trabajo en el aula-laboratorio

• De forma anticipada se comunicará previamente lo que se espera realizar para lo cual tendrán que asistir con algunos materiales necesarios para realizar la práctica.
• La asistencia es obligatoria (tolerancia 10 min) para contar con la participación en la actividad sea cual sea lo que esté planeado.
• Se solicitará leer con anticipación sobre el tema de clase; ya que se aplicarán cuestionarios cortos - 3 preguntas.
• Las actividades prácticas se realizarán en el laboratorio por lo que es imprescindible contar con una bata blanca de algodón de su talla y que siempre esté limpia. El alumnado asistirá con bata de algodón obligatoria, una franela o trapo, portas y cubreobjetos, o algún otro material solicitado.
• Muchas actividades se realizarán de manera colaborativa; por lo que deberán organizarse en 5 equipos de 5 integrantes.

Material básico de laboratorio por equipo :

1) 10 cajas de petri (60x15mm) Peq.
2) 1 caja de Portas y cubreobjetos
3) 1 paquete de algodón.
4) 1 L de alcohol al 96% (se diluira al 70%).
5) caja de papel aluminio.
6) 200g de papel estraza.
7) Plumón indeleble (negro o azul).
8) Masking tape.
9) 500 mL de cloro.
10) Guantes de latex o nitrilo

11) Cubrebocas.

12) googles.

TEMARIO DE METODOS BASICOS DE BIOLOGIA (2025-1)

UNIDAD 1. Medidas de prevención y códigos de riesgo: 1h; 5 AGOSTO; MMLR
2.1. Medidas generales de seguridad y de bioseguridad
2.2. Clasificación de sustancias: código CRETIB
2.3. Residuos peligrosos biológico-infecciosos (RPBI)

UNIDAD 2. Tipos de estudios: 2h; 12 AGOSTO; MMLR
1.1. Descriptivo, comparativo (de causa a efecto y de efecto a causa)
1.2. Prospectivo, retrospectivo, retrospectivo parcial
1.3. Longitudinal, transversal
1.4. Observacional, experimental, pseudoexperimental (cuasiexperimental)
1.5. Trabajo de campo y gabinete. Normatividad vigente

UNIDAD 3. Definición del problema y selección del modelo biológico: 3h; 19 AGOSTO; MMLR
3.1. Niveles de organización y unidad mínima de estudio
3.2. Modelos biológicos y organismos modelo
3.3. Alternativas bioéticas y pedagógicamente equivalentes
3.4. Cultivo de células y tejidos. Incubación, refrigeración y liofilización

UNIDAD 4. Diseño experimental: 2h; 29 AGOSTO; CNCR
4.1. Variable de interés (Planteamiento de objetivo e hipótesis)
4.2. Variable de respuesta y factor
4.3. Datos cualitativos, cuantitativos, incertidumbre y errores
4.4. Criterios de inclusión, exclusión y eliminación
4.5. Registro y contraste de resultados
4.6. Importancia del análisis estadístico

UNIDAD 5. Bases físicas de la medición en biología: 2h; 5 SEPTIEMBRE; CNCR
5.1. Medidas y cuantificación (unidades y conversión de unidades)
5.2. Longitud, área y volumen
5.3. Masa y peso
5.4. Luz, calor y energía
5.5. Concentración, densidad y osmolaridad
5.6. Presión

UNIDAD 6. Bases químicas de la medición en biología: 2h; 12 SEPTIEMBRE; CNCR
6.1. Estereoquímica e isomería. Manipulación de modelos estructurales
6.2. Soluciones (Porcentuales, Molares, Molales, PPM, Normales)
6.3. Equilibrio ácido-base
6.4. Equilibrio redox

UNIDAD 7. Separación de componentes: 4h; 23 SEPTIEMBRE; MMLR
7.1. Centrifugación
7.2. Densidad, viscosidad y sedimentación
7.3. Fuerza gravitacional y fuerza centrífuga
7.4. Tipos de centrífugas
7.5. Microscópicos y macroscópicos (tamizaje)

UNIDAD 8. Aplicaciones de la espectrofotometría en biología: 4h; 3 OCTUBRE; CNCR
8.1. El espectro electromagnético y las propiedades de la luz
8.2. Ley de Lambert-Beer (absortividad molar de las especies absorbentes)
8.3. Componentes y tipos de espectrofotómetros
8.4. Aplicación como método cualitativo (cuantificación colorimétrica de biomoléculas)
8.5. Aplicación como método cuantitativo (determinación de pigmentos, cuantificación de ácidos nucleicos y de proteínas)

UNIDAD 9. Principios de microscopía: 6h; 14 OCTUBRE Y 17 OCTUBRE; MMLR
9.1. Fundamentos de electromagnetismo
9.2. Lentes y óptica geométrica
9.3. Resolución
9.4. Tipos de microscopía

UNIDAD 10. Análisis de moléculas informacionales: 6h; 4 Y 7 NOVIEMBRE; CNCR
10.1. Métodos de análisis de la expresión genética (cualitativos y cuantitativos)
10.2. Aislamiento, purificación y secuenciación de las moléculas informacionales
10.3. Sistemática molecular
10.4. Ciencia forense
10.5. Biotecnología
10.6. Nanociencias y nanotecnología

PRACTICAS DE LABORATORIO SUGERIDAS

https://drive.google.com/file/d/1NGuHwHl7D2eHoRavkYucrY_FGTyRmZ3a/view?usp=drive_link

BIBLIOGRAFIA POR UNIDAD:

Referencias UNIDAD 1:
-Gavilán Irma (2012). Guía técnica de acción para residuos biológicos. Comité asesor de salud, protección civil y manejo ambiental. Facultad de Química-UNAM.
-Gavilán Irma (2012). Guía técnica de acción para residuos quimicos. Comité asesor de salud, protección civil y manejo ambiental. Facultad de Química-UNAM.
-Norma oficial mexicana que establece el sistema armonizado para la identificación y comunicación de peligros y riesgos por sustancias químicas peligrosas en los centros de trabajo (NOM-018-STPS-2000/2015).
-Sistema Globalmente Armonizado (SGA). https://ghs-sga.com/
-Norma oficial mexicana que establece las características, el procedimiento de identificación, clasificación y los listados de los residuos peligrosos. (NOM-052-SEMARNAT-2005).
-Norma oficial mexicana que establece las especificaciones técnicas para la producción, cuidado y uso de los animales de laboratorio (NOM-062-ZOO-1999).
-Norma oficial mexicana que establece la protección ambiental - Salud ambiental -Residuos peligrosos biológico-infecciosos - Clasificación y especificaciones de manejo (NOM-087-ECOL-SSA1-2002)

Referencias UNIDAD 2:
-Araujo M. (2011). Variables de un estudio. Medwave;11(03). doi: 10.5867/medwave.2011.03.4933
-Arigmón Pallás JM, Jiménez Villa J. (2004) Métodos de investigación clínica y epidemiológica. 3ª ed. Madrid: Elsevier.
-Gordis L. (2005). Epidemiologia. 3ª ed. Madrid: Elsevier.
-Méndez, I., D. Guerrero, L. Moreno & C. Sosa. (2014). El Protocolo de investigación. Lineamientos para su elaboración y análisis. Trillas, Ciudad de México.
-Szklo, M., Nieto, J. (2003). Epidemiología intermedia. Conceptos y aplicaciones. Madrid: Díaz de Santos.

Referencias UNIDAD 3:
-Aluja, M. & A. Birke (eds.). (2003). El papel de la ética en la investigación y la educación superior. Fondo de Cultura Económica, Ciudad de México.
-Beauchamp, T. L. & J. F. Childress. (1999). Principios de ética biomédica. Masson, Barcelona.
-Cabrera V., et al (2022). Biología celular y organismos modelo. UNSA. Facultad de Ciencias Biológicas. Escuela profesional de Biología.
-De Aluja, A. S. (2002). Animales de laboratorio y la Norma Oficial Mexicana (NOM-062-ZOO-1999). Gaceta Médica de México, 138(3): 295-298.
-González, J. & J. E. Linares (eds.). (2013). Diálogos de bioética. Nuevos saberes y valores de la vida. Fondo de Cultura Económica y Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México.
-Hans, J. (2004). Principio de responsabilidad. Herder, Barcelona.
-Kwiatkowska, T. & J. Issa (comps.). (1998). Los caminos de la ética ambiental. Una antología de textos contemporáneos. Plaza y Valdés-Conacyt, Ciudad de México.
-Ley de protección a los animales de la Ciudad de México. 2019. Publicada en la Gaceta Oficial del Distrito Federal el 26 de febrero de 2002 Ultima reforma publicada en la Gaceta Oficial de la Ciudad de México el 17 de diciembre de 2019. Particularmente, articulo y fracciones relacionados con experimentos con animales.
-Madigan, M. T., J. M. Martinko, K. S. Bender, D. H. Buckley & D. A. Stahl. (2015). Brock biology of microorganisms, 14th ed. Pearson, Boston.
-Norma Oficial Mexicana sobre las especificaciones técnicas para la producción, cuidado y uso de los animales de laboratorio (NOM-062-ZOO-1999).
-Regan, T. (1983). The case for animal rights. University of California Press, Berkeley.
-Rivero, P. (2004). Apología de la inmoralidad, pp. 46-50. Este País. https://archivo.estepais.com/inicio/historicos/161/9_salud_apologia_rivero.pdf
-Singer, P. (2011). Liberación animal. Taurus, Madrid.
-Spector, D., R. Goldmam & L. A. Leinwand. 1998. Cells a laboratory manual. Culture and biochemical analysis of cells, Vol. 1. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview.

otras referencias:
-Preparación de agar MRS: https://www.britanialab.com/back/public/upload/productos/upl_6092dd2543f1d.pdf
-Preparación de medios de cultivo casero para tejidos vegetales: https://www.youtube.com/watch?v=zJCEj2utHh0
-Preparación de probiotico: https://www.youtube.com/watch?v=-RMlILnt25Q

Referencias UNIDAD 4:
-Diggle, P. J. & A. G. Chetwynd. (2011). Statistics and scientific method. An introduction for students and researchers. Oxford University Press, Nueva York.
-Gallagher, S. R. & E. A. Wiley (eds.). (1999-2014). Current protocols essential laboratory techniques. Wiley-Blackwell, Hoboken.
-González, M. G. (1996). Técnicas en biología celular. Teoría y práctica. AGT Editor, Ciudad de México.
-Hernández, R., C. Fernández & P. Baptista. (1998). Metodología de la investigación, 2ª ed. McGraw-Hill, Ciudad de México.
-Mendez I., (1996). El protocolo de investigación: lineamientos para su elaboración y análisis. 2da ed. Trillas. México.
-Méndez, I., D. Guerrero, L. Moreno & C. Sosa. (2014). El Protocolo de investigación. Lineamientos para su elaboración y análisis. Trillas, Ciudad de México.
-Oda, B. (2005). Introducción al análisis gráfico de datos experimentales. Las Prensas de Ciencias, Ciudad de México.
-Triola M., (2018). Estadística. 12 ed. Pearson. México.

Referencias UNIDAD 5:
-Dutta, A. (2009). Experimental biology. A laboratory manual. Alpha Science International, Oxford.
-Ethier. C. R. & C. A. Simmons. (2012). Introductory biomechanics. From cells to organisms. Cambridge University Press, Cambridge.
-Gallagher, S. R. & E. A. Wiley (eds.). (1999-2014). Current protocols essential laboratory techniques. Wiley-Blackwell, Hoboken.
-Gavira, J. M. & A. Hernanz. (2011). Técnicas fisicoquímicas en medio ambiente. Universidad Nacional de Educación a Distancia, Madrid.
-González, M. G. (1996). Técnicas en biología celular. Teoría y práctica. AGT Editor, Ciudad de México.
-Haber-Schaim, U., J.B. Cross, G. L. Abegg, J.H. Dodge & J.A. Walter. (1979). Curso de introducción a las ciencias físicas, 3ª ed. Reverté, Ciudad de México.
-Lebesgue, H. (1995). La medida de las magnitudes. Serie Metrología Técnica. Limusa Noriega Editores, Ciudad de México.
-Phillips, R., J. Kondev, J. Theriot & H. G. Garcia. (2013). Physical biology of the cell, 2nd ed. Garland Science, Nueva York.

Referencias UNIDAD 6:
-Chang, R. (2015). Química, 11a ed. Mc Graw-Hill, Ciudad de México.
-Dutta, A. (2009). Experimental biology. A laboratory manual. Alpha Science International, Oxford.
-Gallagher, S. R. & E. A. Wiley (eds.). (1999-2014). Current protocols essential laboratory techniques. Wiley-Blackwell, Hoboken.
-Gavira, J. M. & A. Hernanz. (2011). Técnicas fisicoquímicas en medio ambiente. Universidad Nacional de Educación a Distancia, Madrid.
-Spector, D., R. Goldmam & L. A. Leinwand. (1998). Cells a laboratory manual. Culture and biochemical analysis of cells, Vol. 1. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview.

otras referencias:
-Construcción de modelos moleculares: https://biomodel.uah.es/
-Aplicaciones químicas de Biomodel: https://biomodel.uah.es/quimica/inicio.htm
-Estereoisomería: https://biomodel.uah.es/ejerci2j/inicio.html
-Simulador de molaridad: Molaridad: https://phet.colorado.edu/es/simulations/molarity
-Calculadoras para química y ciencias de la vida: https://www.sigmaaldrich.com/MX/es/support/calculators-and-apps
-Simulador de pH: https://phet.colorado.edu/sims/html/ph-scale/latest/ph-scale_all.html?locale=es

Referencias UNIDAD 7:
-Dutta, A. (2009). Experimental biology. A laboratory manual. Alpha Science International, Oxford.
-Gallagher, S. R. & E. A. Wiley (eds.). (1999-2014). Current protocols essential laboratory techniques. Wiley-Blackwell, Hoboken.

otras referencias:
-Introducción a la centrífuga: https://app.jove.com/v/5019/an-introduction-to-the-centrifuge
-Materiales y equipo durante la centrifugación: https://biomodel.uah.es/tecnicas/centrif/inicio.htm
-Colocación de tubos en el rotor de la centrifuga: https://biomodel.uah.es/tecnicas/centrif/carga_rotor.htm

Referencias UNIDAD 8:
-Dutta, A. (2009). Experimental biology. A laboratory manual. Alpha Science International, Oxford.
-Gallagher, S. R. & E. A. Wiley (eds.). (1999-2014). Current protocols essential laboratory techniques. Wiley-Blackwell, Hoboken.
-González, M. G. (1996). Técnicas en biología celular. Teoría y práctica. AGT Editor, Ciudad de México.
-Spector, D., R. Goldmam & L. A. Leinwand. (1998). Cells a laboratory manual. Culture and biochemical analysis of cells, Vol. 1. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview.

otras referencias:
-Introduction to the Spectrophotometer: https://www.jove.com/es/v/5038/spectrophotometer-principle-instrumentation-and-applications
-Espectro UV VIS virtual: https://biomodel.uah.es/lab/abs/espectro.htm


Referencias UNIDAD 9:
-Dutta, A. (2009). Experimental biology. A laboratory manual. Alpha Science International, Oxford.
-Gallagher, S. R. & E. A. Wiley (eds.). (1999-2014). Current protocols essential laboratory techniques. Wiley-Blackwell, Hoboken.
-Gasga JR. (2020). Breve reseña histórica de la microscopía electrónica en México y el mundo. Mundo Nano, 13(25): 79-100, https://doi.org/10.22201/ceiich.24485691e.2020.25.69610.
-González, M. G. (1996). Técnicas en biología celular. Teoría y práctica. AGT Editor, Ciudad de México.
-Jiménez-García LF, Segura Valdez ML. (2022). El microscopio electrónico de transmisión y la biología celular. +Ciencia, Revista de la Facultad de Ingeniería, Universidad Anáhuac México, Año 10, No. 29: 18-22. -Madigan, M. T., J. M. Martinko, K. S. Bender, D. H. Buckley & D. A. Stahl. (2015). Brock biology of microorganisms, 14th ed. Pearson, Boston.

-Spector, D., R. Goldmam & L. A. Leinwand. 1998. Cells a laboratory manual. Culture and biochemical analysis of cells, Vol. 1. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview.

Otras referencias:
-Introducción a la microscopia: https://www.jove.com/v/5041/introduction-to-light-microscopy
-Iluminación Kohler: https://www.youtube.com/watch?v=5MfZweoJ6A8
-Simulación de iluminación Kohler: https://www.microscopyu.com/tutorials/kohler
-Manejo de un microscopio virtual: https://www.ncbionetwork.org/iet/microscope/
-Simuladores de SEM, TEM, EDS, microscopía confocal y de fluorescencia: https://myscope.training/

Referencias UNIDAD 10:
-Alberts B., et al (2015). Molecular Biology of the Cell. Sixth edition. Garland Science. USA.
-Berg J., et al (2015). Biochemistry. Eighth edition. W. H. Freeman & Company. USA.
-Camargo A., (2020). Fundamentos y aplicaciones biomédicas de las principales tecnologías de secuenciación: una revisión de literatura. Revista Investigación en Salud. Universidad de Boyacá. Colombia. (7).2.
-Harilal D., (2020). SARS-Cov2 whole genome amplification and sequencing for effective population based surveillance and control of viral transmission. Clinical Chemistry. (66).11.
-Herraéz A. (2012). Texto ilustrado e Interactivo de Biología Molecular e Ingeniería Genética. Segunda edición. Elsevier. España.
-Herron J., and Freeman S. (2014). Evolutionary Analysis. Fifth edition. Pearson. USA.
-Jiménez L, y Merchant H. (2003). Biología Celular y Molecular. Prentice Hall. México.
-Krebs J., et al (2014). Lewin´s Genes XI. Jones & Bartlett learning. Eleventh edition. USA.
-Pevsner J., (2015). Bioinformatics and Functional Genomics. Wiley Blackwell. 3rd edition. UK.
-Renneberg R., et al (2023). Biotechnology for Beginners. Academic Press. 3rd edition.
-Nelson, D. et al (2019). Lehninger: princípios de Bioquímica. Séptima edición. Omega. España.

Manuales de consulta:

Manual de prácticas de laboratorio de microbiología general
https://uamenlinea.uam.mx/materiales/licenciatura/diversos/AQUIAHUATL_RAMOS_MARIA_DE_LOS_ANGELES_Manual_de_practicas_de.pdf

Manual de Laboratorio Microbiología General I - FES Zaragoza
https://www.zaragoza.unam.mx/wp-content/Portal2015/Licenciaturas/qfb/manuales/19Manual_Microbiologia_General1.pdf

Manual de Microbiología CULTIMED (PDF) - ICT, SL
http://www.ictsl.net/downloads/microbiologia.pdf

Manual de prácticas de laboratorio de Biología de procariontes. Facultad de Ciencias.UNAM.
https://procariontes.wordpress.com/practicas-laboratorio/

PP Manual de Bergey (Bergey ´s of Systematic Bacteriology
https://portal.uah.es/portal/page/portal/GP_EPD/PG-MA-ASIG/PG-ASIG-67023/TAB42351/Lecci%F3n%209%20grupo%20A.pdf


Bibliografía complementaria:

https://microbiologiabasica.files.wordpress.com/2011/03/ut120.pdf

Noticia sobre resistencia a antibióticos (España 2020)
https://www.elperiodico.com/es/sociedad/20190523/muertes-bacterias-resistentes-infecciones-antibiotico-7469469

Farmacéutica Marisa García Alonso que hace cultivo de distintas mascarillas
https://youtu.be/OCfFCLajhtY
https://youtu.be/7ercfpnOmsQ

Cultivo en Microbiología clínica (Dr Alejandro Macias)
https://youtu.be/30htD86TWzE

El Mundo de Beakman: Las bacterias (portugués)
https://youtu.be/veG1_eYbQ2w