Biología (plan 2025) 2025-1

Primer Semestre, Bacteria y Archaea

¡Bienvenidxs al curso de Arquea y Bacteria!

Es un gusto para nosotras, Dafne Vaca y Thelma Arenas, formar parte de esta aventura académica junto a ustedes. Nos entusiasma enormemente compartir el apasionante mundo de las arqueas y bacterias.

La clase está coordinada por ambas profesoras, cada una aportando desde su experiencia en sesiones teóricas y prácticas. Las evaluaciones de ambas conformarán la totalidad de la calificación, asegurando una evaluación integral y equitativa.

Este curso está diseñado para que, a través de diversas sesiones interactivas y prácticas, podamos aplicar y consolidar los conocimientos adquiridos. Esperamos que disfruten al máximo de esta experiencia educativa.

¡Bienvenidxs de nuevo y que disfruten del curso!

EVALUACIÓN

50% Exámenes (cuatro parciales)

20% Participaciones, exposiciones, reportes de actividades prácticas

30% Trabajo final (Se requiere al menos el 80% de asistencia para poder presentarlo)

La escala de calificaciones va de 6 a 10.

Las calificaciones menores a 6 son reprobatorias SIN EXCEPCIÓN.

Solo se redondea la calificación final en Acta.

TEMARIO

1. Introducción

a.Autoperpetuación de los seres vivos

b.Sistematización de la diversidad biológica

c.Origen de la vida y último ancestro en común: LUCA y LECA

d.Ubicación de los procariontes en el árbol de la vida

e.Comparación entre procariontes, eucariontes y virus

2. Forma y función en procariontesa.

a. Morfología celular y niveles de organización del genoma procariontes: cromosoma, nucleoide y plásmidos

b.Estructuras celulares y niveles de organización

c.Estructuras celulares y su función

d.Mecanismos de movilidad

e.Metabolismo

3.Genética y división celular en procariontes

a.Estructura y organización del genoma procarionte

b.Flujo de la información genética, reparación y mutación

c.Transferencia horizontal de genes y dinámica de los genomas

d.División celular: fisión binaria, múltiple, esporulación y gemación

4.Filogenómica y clasificación

a.Clasificación con 16S RNA

b.Clasificación MLST

c.Clasificación filogenómica

d.Genoma y pangenómica, diversidad de los genes

5. Diversidad de Arquea

a.Euryarchaeota

b.Proteoarchaeota: Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota y Korarchaeota (TACK)

c.Asgard

d.Lokiarchaeota y eucariogénesis

6.Diversidad de Eubacteria y taxones modelo

a.Actinobacteria. Streptomyces coelicolor (metabolismo secundario, producción de antimicrobianos)

b.Firmicutes. Bacillus subtilis (esporulación)

c.Bacteroidetes

d.Spirochaetes

e.Proteobacteria. Rhizobium etli (infección simbiótica, fijación de N2)

f. Agrobacterium tumefaciens (infección patogénica, transferencia horizontal de genes a plantas)

g. Escherichia coli (interacción hospedero, de comensal a patógeno, genes esenciales)

h. Pseudomonas aeruginosa (patógeno, formación de biopelículas, resistencia antimicrobiana)

i. Vibrio fischeri (monitoreo de quorum)

j.Cyanobacteria. Prochlorococcus (fotosíntesis, la bacteria fotosintética más abundante del mundo)

k.Chlamydiae

7.Ecología e importancia de procariontes

a.Estilos de vida e interacciones con otros organismos

b.Ecosistemas y ciclos biogeoquímicos

c.Ambientes extremos y astrobiología

d.Cambio climático y microorganismos

e.Interacción con otros ambientes y microorganismos: microbiomas

f.Metagenómica y ecología microbiana

g.Biotecnología

8.Virus

a.Virus Definición

b.Diversidad morfológica

c.Sistemas de clasificación de virus

d.Diversidad de los virus

e.Importancia ecológica y evolutiva

f.Importancia en la salud y en la biosfera

Bibliografía recomendada

Baldauf, S. L., D. Bhattacharya, J. Cockrill, P. Hugenholtz, J. Pawlowski & A. G. B. Simpson. 2004. The tree of life: An Overview, pp. 43-75. En: Donoghue, M. J. & J. Cracraft (eds). Assembling the tree of life, Oxford University Press, Nueva York.

Black, J. & L. Black. 2017. Microbiology: Principles and explorations, 10th ed. J. Wiley, Hoboken.

Madigan, M., K. Bender, D. Buckley, M. Sattley & D. A. Stahl. 2018. Brock biology of microorganisms, 15th ed. Pearson Education, Nueva York.

Fundamentals of microbiology. Jones & Bartlett, Sudbury. Staley, J. T., R. P. Gunsalus, S. Lory & J. J. Perry. 2007. Microbial life.

Sinauer Associates, Sunderland. Wiley, J., L. Sherwood & C. Woolverton. 2017. Prescott´s microbiology, 10th ed. McGraw-Hill Science, Nueva York.

Whitman W. B. (Ed.). 2015. Bergey´s Manual of Systematic of Archaea and Bacteria. First Edition.

Mairer, R. M., I. L. Pepper, C. P. Gerba. 2000. Environmental Microbiology, Academic Press. California, USA.