Encabezado Facultad de Ciencias
Presentación

Biología (plan 1997) 2024-2

Sexto Semestre, Taller Nivel 2

Grupo 5493 10 alumnos.
Diversidad y evolución animal en ecosistemas de agua dulce
Profesor Claudia Patricia Ornelas García
Profesor Karla Natividad García Cabello
Profesor Jesús Alberto Díaz Cruz
Profesor Eloisa Torres Hernández
Profesor Carlos Salvador Pedraza Lara

 
Evolución biológica
Selección Natural y Variación

Ridely 2004. Evolution. Inrtoduction. 1-71.

Especiación, extinción y tasas de diversificación. - Factores que impulsan la macroevolución. -
Ejemplos macroevolutivos: explosión cámbrico, extinciones masivas

1. Title, P. O., & Rabosky, D. L. (2019). Tip rates, phylogenies and diversification: what are we estimating, and how good are the estimates?. Methods in Ecology and Evolution, 10(6), 821-834. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13153

2. Bond, D. P., & Grasby, S. E. (2017). On the causes of mass extinctions. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 478, 3-29. https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2016.11.005

3. Futuyma, D.J. & Kirkpatrick, M. (2017)- Unidad 4-(cap. 16-17) en: Evolution. sinauer Associates.
Sistemática filogenética

1. Scornavacca, C., Delsuc, F., & Galtier, N. (2020). Phylogenetics in the genomic era. capítulo 1
2. Phylogeny: The unity and diversity of life. Futuyma, D. J., & Kirkpatrick, M. (2013). Evolution. Sunderland, MA. capítulo 16
Análisis de caracteres: matrices de datos y métodos de codificación

1. Brazeau, M. D. (2011). Problematic character coding methods in morphology and their effects. Biological Journal of the Linnean Society, 104(3), 489-498.

2. Simões, T. R., Caldwell, M. W., Palci, A., & Nydam, R. L. (2017). Giant taxon‐character matrices: quality of character constructions remains critical regardless of size. Cladistics, 33(2), 198-219. https://doi.org/10.1111/cla.12163
Inferencia filogenética y criterios de optimización: parsimonia, y mapeo de caracteres

1. Goloboff, P. 2022. Refining Phylogenetic Analyses Phylogenetic Analysis of
Morphological Data: Volume 2.
Inferencia filogenética y criterios de optimización: máxima verosimilitud y probabilidad posterior (inferencia Bayesiana)

1. Wiley E.O. and Lieberman B.S. 2011. Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetic Systematics, Second Edition

Unidad 2: Microevolución
- Fundamentos en estudios de macro- y microevolución Futuyma, D. J., & Kirkpatrick, M. (2013). Evolution. Sunderland, MA.
- Mecanismos evolutivos (mutación, deriva génica, miración, SN) Ridely 2004. Evolution. Introduction.
- Generalidades de poblaciones e introducción a los procesos evolutivos Allendorf FW, Funk WC, Aitken SN, Byrne M., Luikart G. 2022 "Conservation and the genomics of populations.
- Estimación de la diversidad genética Frankham, R., Briscoe, D. A., & Ballou, J. D. (2002). Introduction to conservation genetics. Cambridge university press.
- El principio de Hardy-Weinberg Frankham, R., Briscoe, D. A., & Ballou, J. D. (2002). Introduction to conservation genetics. Cambridge university press.
- Factores que determinan la diversidad genética en poblaciones naturales y en cautiverio. Allendorf FW, Funk WC, Aitken SN, Byrne M., Luikart G. 2022 "Conservation and the genomics of populations.

Unidad 3: Evolución morfológica
- Introducción, conceptos de la morfometría geométrica

Zelditch, M., Donald, S., and Sheets. D.S. 2012.Geometric morphometrics for biologists: a primer. academic press,
- Historia de la morfometría geométrica

Adams, D. C., Rohlf, F. J., & Slice, D. E. (2004). Geometric morphometrics: ten years of progress following the ‘revolution’. Italian journal of zoology, 71(1), 5-16. https://doi.org/10.1080/11250000409356545

Adams, D. C., Rohlf, F. J., & Slice, D. E. (2013). A field comes of age: geometric morphometrics in the 21st century. Hystrix 24: 7–14. https://doi.org/10.4404/hystrix-24.1-6283

Mitteroecker, P., & Schaefer, K. (2022). Thirty years of geometric morphometrics: Achievements, challenges, and the ongoing quest for biological meaningfulness. American Journal of Biological Anthropology, 178, 181-210. https://doi.org/10.1002/ajpa.24531
- Concepto y tipos de landmarks

Webster, M. A. R. K., & Sheets, H. D. (2010). A practical introduction to landmark-based geometric morphometrics. The paleontological society papers, 16, 163-188.
- Forma, tamaño y concepto del tamaño del centroide

Klingenberg, C. P. (2016). Size, shape, and form: concepts of allometry in geometric morphometrics. Development genes and evolution, 226(3), 113-137. https://doi.org/10.1007/s00427-016-0539-2
- Introducción a los programas estadísticos usados en la adquisición de los landmarks y análisis de la forma: familia TPS, MorphoJ y geomorph.

Crispo, Erika, "The Undergraduate Student’s Guide to Geometric Morphometrics" (2020). Open Educational Resources. 4.
https://digitalcommons.pace.edu/oer/4
Klingenberg, C. P. (2011). MorphoJ: an integrated software package for geometric morphometrics. Molecular ecology resources, 11(2), 353-357. https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02924.x

Adams, D. C., & Otárola‐Castillo, E. (2013). geomorph: an R package for the collection and analysis of geometric morphometric shape data. Methods in ecology and evolution, 4(4), 393-399. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12035

 


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