Biología (plan 1997) 2024-2

Cuarto Semestre, Biogeografía I

Se tendrá un grupo de Classroom para comunicación y envío de archivos. Una vez inscritos se les enviará un correo para el registro.

Comenzamos el lunes 29 de enero 2024

Compromiso de respeto e inclusión

Los profesores del curso estamos comprometidos a: evitar la arrogancia o actitudes de superioridad de cualquier persona sobre otra; eliminar los prejuicios, estereotipos y sesgos, conscientes e inconscientes, sobre otras personas. No se realizará ni permitirá ningún tipo de agresión, ni siquiera microagresiones verbales o físicas. Se respeta y promueve la diversidad de género, edad, orientación sexual, habilidad física y mental, experiencia, apariencia, estatus marital, ingresos, hábitos, religión, educación, vivienda, situación familiar, situación laboral y salud. Se aceptan sugerencias para mejorar la relación y la equidad de oportunidades de todas las personas que participamos en el curso. Solicitamos que los estudiantes nos hagan saber si no se está cumpliendo este compromiso y también tengan el mismo compromiso y así podamos tener una convivencia saludable.

Aprendizajes esperados. Los conocimientos y habilidades mínimas que adquirirán todos los alumnos que les servirá en su vida profesional. Al final del curso los alumnos serán capaces de:

• Reconocer patrones biogeográficos.
• Distinguir entre procesos históricos y ecológicos en biogeografía.
• Definir el concepto de área de distribución de los taxones.
• Reconocer las regiones biogeográficas.
• Describir los métodos para la búsqueda de patrones biogeográficos.
• Interpretar los índices para cuantificar la diversidad.
• Relacionar la historia de la tierra con la distribución de los taxones.

Resumen Formas de evaluación:

• Exámenes parciales
• Ejercicios en clase (Prácticas)
• Tareas
• Cuestionarios
• Reportes de lectura
• Presentaciones

Forma de trabajo y evaluación

• Los profesores presentaremos los temas y se realizarán prácticas individuales y por equipos en el salón de clases.
• Se enviarán lecturas o videos previos o complementarios, las cuales se discutirán en clase y se pedirá un reporte o responder un cuestionario.
• La comunicación adicional a las sesiones presenciales como el envió de archivos, avisos, asignación y entrega de tareas, se hará por la plataforma Classroom.
• Habrá foros de discusión en Classroom donde se podrán poner dudas o se harán preguntas específicas para promover la discusión grupal. La participación en las discusiones en el salón se considerará en la evaluación del curso.
• Se realizarán cuatro exámenes parciales.
• Al final del curso los estudiantes harán una presentación por equipos sobre la aplicación de la biogeografía en contextos económicos, sociales, médicos, agrícolas, conservación, etc.

Evaluación

• Ejercicios, tareas, cuestionarios, reportes de lecturas 40%
• Exámenes parciales 50%
• Presentaciones biogeografía aplicada 10%

Reglas del curso

• NP solo se asignará en el caso de haber presentado menos del 60% de las calificaciones, considerando tareas, ejercicios y exámenes.
• No se puede renunciar o modificar la calificación si se cumplió con 60% del curso.
• Examen final solo si el alumno lo solicita y debe haber presentado mínimo el 80% de las calificaciones (tareas, ejercicios, exámenes). El examen final abarca todos los temas y representa la calificación final.
• Se tiene derecho a una reposición de un examen parcial NO PRESENTADO.
• No se aceptan alumnos de otros grupos, ni que alumnos inscritos sean evaluados por otros profesores.
• No se permitirá plagio de materiales de internet, ni copia de tareas y exámenes entre estudiantes. Si se detecta que dos estudiantes entregan la misma evaluación se anularán ambas.
• Copiar y pegar texto de páginas web, o copiar textualmente secciones de artículos o libros es plagio. QUEDA ABSOLUTAMENTE PROHIBIDO. De notarlo la tarea tendrá calificación reprobatoria.

Escala de calificaciones:

• Promedio final de X.5 sube a la siguiente cifra.

TEMARIO

1. INTRODUCCIÓN A LA BIOGEOGRAFÍA

Se hace una breve exposición sobre el concepto de distribución de los seres en el espacio y el tiempo

1.1. Definición de la biogeografía y su campo de estudio.

1.2. Subdivisiones de la biogeografía según distintos puntos de vista: biogeografía descriptiva vs. causal, biogeografía ecológica vs. histórica.

1.3. Relación con otras ciencias.

1.4. La teoría de la tectónica de placas y su efecto en la distribución de la biota.

1.5. Panorama general de la biogeografía en la actualidad.

2. BREVE HISTORIA DE LA BIOGEOGRAFÍA

Se hace una breve introducción al estudio del desarrollo de esta disciplina.

2.1 Primeras explicaciones de la distribución geográfica: Linneo y el concepto de centro de origen, la ley de Buffon y las contribuciones de de Candolle y otros autores predarwinianos.

2.2 Influencia de la teoría evolutiva: contribuciones de Darwin y Wallace.

2.3 Desarrollo de las teorías holarticistas y el papel de la dispersión en la biogeografía tradicional.

2.4 El desarrollo de la biogeografía de islas y la teoría de refugios pleistocénicos.

2.5 El papel de la sistemática filogenética en la reconstrucción biogeográfica: biogeografía filogenética y biogeografía cladística.

2.6 El papel de la sistemática molecular en la biogeografía reciente: filogeografía y relojes moleculares.

3. AREOGRAFÍA

Comprender los conceptos y los diferentes métodos empleados para estudiar la distribución de los seres vivos.

3.1 Áreas de distribución.

3.2 Predicción de áreas: modelado de áreas de distribución.

3.3 Áreas de endemismo: definición y métodos para identificarlas.

3.4 Clasificación biogeográfica, regionalización y provincias bióticas.

3.5 Herramientas computacionales (páginas web y programas de computo) empleados en areografía.

4. BIOGEOGRAFÍA ECOLÓGICA

Reconocer la perspectiva ecológica en la biogeografía.

4.1 Fundamentos y métodos de la biogeografía del equilibrio insular.

4.2 Teoría de refugios pleistocénicos.

4.3 Biogeografía cuantitativa: métodos de ordenación y clasificación, índices de similitud biótica, análisis de agrupamientos y componentes principales.

4.4 Estimación de la riqueza de especies y diversidad alfa, beta y gama.

4.5 Reglas ecogeográficas y macroecología.

4.6 Herramientas computacionales (páginas web y programas de computo) empleados en biogeografía ecológica.

5. BIOGEOGRAFÍA DISPERSALISTA

Se presenta el método y el enfoque empleado por los iniciadores de esta escuela y sus aspectos actuales.

5.1 Conceptos de extinción, colonización, inmigración y su repercusión en biogeografía.

5.2 Conceptos de barreras, filtros 'sweepstake', corredores y dispersión.

5.3 Conceptos de endemismo, cosmopolitismo, fauna, flora, horofauna y cenocrón.

5.4 Criterios para la determinación de centros de origen.

5.5 Contribuciones de Matthew, Mayr, Simpson y Darlington.

5.6 La biogeografía filogenética de Hennig-Brundin: reglas de la progresión corológica y de la desviación.

6. PANBIOGEOGRAFÍA

Se presenta el método y el enfoque empleado por los iniciadores de esta escuela y sus propuestas nuevas.

6.1 Homología biogeográfica: Homología primaria y secundaria, reconocimiento de homología biogeográfica.

6.2 Conceptos básicos: trazo individual, línea de base, centro de masas, trazo generalizado y nodo.

6.3 Métodos panbiogeográficos cuantitativos.

6.4 Herramientas computacionales (páginas web y programas de cómputo) empleados en panbiogeografía.

7. BIOGEOGRAFÍA CLADÍSTICA

Se presenta el método y el enfoque empleado por los iniciadores de esta escuela y sus nuevas propuestas.

7.1 Conceptos básicos: cladograma taxonómico de áreas, cladograma resuelto de áreas y cladograma general de áreas.

7.2 Análisis de los componentes: supuestos 1 y 2.

7.3 Análisis de parsimonia de Brooks: supuesto 0.

7.4 Otros métodos cladísticos.

7.5 Herramientas computacionales (páginas web y programas de computo) empleados en biogeografía cladística.

8. BIOGEOGRAFÍA MOLECULAR

Se presentan los enfoques y métodos biogeográficos relacionados con la sistemática molecular.

8.1 Filogeografía: conceptos básicos.

8.2 Filogeografía intraespecífica y comparada.

8.3 Relojes moleculares.

8.4 Biogeografía de procesos y Biogeografía paramétrica

8.5 Herramientas computacionales (páginas web y programas de computo) empleados en filogeografía y Biogeografía paramétrica.

9. BIOGEOGRAFÍA DE LA CONSERVACIÓN

9.1 Priorización de áreas para la conservación: complementariedad y hotspots.

9.2 Aplicación de la regionalización biótica en la conservación.

9.3 Biogeografía de islas.

9.3 Atlas biogeográficos.

BIBLIOGRAFÍA BÁSICA

• Crisci, J. V., L. Katinas y P. Posadas. 2003. Historical biogeography: An Introduction. Harvard University Press, Cambridge y Londres.
• Espinosa, D., J.J. Morrone, J. Llorente y O. Flores. 2002. Introducción al análisis de patrones en Biogeografía Histórica. Las Prensas de Ciencias, UNAM. México, D.F.
• Llorente, J. y J.J. Morrone (eds.). 2001. Introducción a la biogeografía en América Latina: Teorías, conceptos, métodos y aplicaciones. Las Prensas de Ciencias, UNAM, México, D.F.
• Llorente, J. y J.J. Morrone (eds.). 2003. Una perspectiva latinoamericana de la biogeografía. Las Prensas de Ciencias, UNAM, México, D.F.
• Lomolino, M. V., Riddle, B. R. , Whittaker, R. J. & Brown, J. H. 2006. Biogeography–Fourth edition. Sinauer Associates Inc., Sunderland, Massachusetts.
• Luis Martínez, A., A. N. Castañeda Sortibrán, J. J. Morrone & J. Llorente Bousquets (eds.). 2008. Manual de prácticas de biogeografía. Las Prensas de Ciencias, UNAM, México, D.F.
• Morrone, J. J. 2009. Evolutionary biogeography: An integrative approach with case studies. Columbia University Press, Nueva York.
• Morrone, J. J. & T. Escalante. 2009. Diccionario de biogeografía. Las Prensas de Ciencias, UNAM, México, D.F.
• Zunino, M. y A. Zullini. 2003. Biogeografía: La dimensión espacial de la evolución. Fondo de Cultura Económica. Sección de Ciencia y Tecnología. México D.F.

1. INTRODUCCIÓN A LA BIOGEOGRAFÍA

• Espinosa, D. y J. Llorente. 1993. Fundamentos de biogeografía filogenéticas. UNAM-Conabio, México, D.F.
• Lomolino, M. V., Riddle, B. R. , Whittaker, R. J. & Brown, J. H. 2006. Biogeography–Fourth edition. Sinauer Associates Inc., Sunderland, Massachusetts.

2. BREVE HISTORIA DE LA BIOGEOGRAFÍA

• Llorente, J. (Ed.). 1991. Historia de la biogeografía: Centros de origen y vicarianza. Las Prensas de Ciencias, UNAM. México, D.F.
• Lomolino, M. V., Riddle, B. R. , Whittaker, R. J. & Brown, J. H. 2006. Biogeography–Fourth edition. Sinauer Associates Inc., Sunderland, Massachusetts.
• Nava, A. 1998. La inquieta superficie terrestre. La ciencia para todos, nro. 13, Fondo de Cultura Económica, México, D.F.
• Nelson, G. 1978. From Candolle to Croizat: Comments on the history of biogeography. J. Hist. Biol. 11: 269-305.
• Papavero, N., D. M. Teixeira, J. Llorente-Bousquets y A. Bueno, 2004, Historia de la biogeografía: I. El periodo preevolutivo. Fondo de Cultura Económica, México, D.F.

3. AREOGRAFÍA

• Antúnez, A. y A. L. Márquez. 1992. Las escalas en biogeografía. Monogr. Herpetol. 2: 31¬38.
• Elith, J. y J. R. Leathwick. 2009. Species distribution models: ecological explanation and prediction across space and time. Annu. Rev. Ecol. Evol. Syst. 40: 677-697.
• Escalante, T. 2009. Un ensayo sobre regionalización biogeográfica. Rev. Mex. Biodivers. 80: 551-560.
• Harold, A. S. y R. D. Mooi. 1994. Areas of endemism: Definition and recognition criteria. Syst. Biol. 43: 261-266.
• Morrone, J. J. 1994. On the identification of areas of endemism. Syst. Biol. 43: 438 441.
• Rapoport, E. H. 1975. Areografía: Estrategias geográficas de las especies. Fondo de Cultura Económica, México, D.F.
• Soberón, J. y T. Peterson. 2004. Biodiversity informatics: Managing and applying primary biodiversity data. Trans. R. Soc. 359: 689-698.
• Szumik, C. A., F. Cuezzo, P. A. Goloboff & A. E. Chalup. 2002. An optimality criterion to determine areas of endemism. Syst. Biol. 51: 806-816.

4. BIOGEOGRAFÍA ECOLÓGICA

• Brown, J. H. 2003. Macroecología. Fondo de Cultura Económica, México, D.F.
• Connor, E. F. 1986. The role of Pleistocene forest refugia in the evolution and biogeography of tropical biotas. TREE 1: 165-168
• Haffer, J. 1982. General aspects of the refuge theory. En: G. T. Prance (ed.), Biological diversification in the tropics, Columbia University Press, New York, pp. 6-24.
• Halffter, G. y C. E. Moreno. 2005. Significado biológico de las diversidades alfa, beta y gama. En: Sobre diversidad biológica: El significado de las diversidades alfa, beta y gama. Halffter, G., J. Soberón, P. Koleff y A. Melic (eds.), Monografía 3ercer Milenio, Vol. 4: 5-18.
• Jiménez-Valverde, A. & J. Hortal. 2003. Las curvas de acumulación de especies y la necesidad de evaluar la calidad de los inventarios biológicos. Rev. Ibér. Aracnol. 8: 151-161.
• Lomolino, M. V., Riddle, B. R. , Whittaker, R. J. & Brown, J. H. 2006. Biogeography–Fourth edition. Sinauer Associates Inc., Sunderland, Massachusetts.
• Pianka, E. R. 1966. Latitudinal gradients in species diversity: a review of concepts. Amer. Natur. 100: 33-46.
• Schroener, T. W. 1988. Ecological interactions. En A. A. Myers & P. S. Giller (ed). Analytical biogeography, an integrated approach to the study of animal and plant distributions. Chapman & Hall, Londres, pp. 256-297.

5. BIOGEOGRAFÍA DISPERSALISTA

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• Darlington, P. J. 1957. Zoogeography, the geographical distribution of animals. John Wiley and Sons, New York. I: 1-38.
• Darwin, C. 1859. El origen de las especies. Hay diferentes ediciones en español.
• Halffter, G. 1987. Biogeography of the montane entomofauna of Mexico and Central America. Annu. Rev. Entomol. 32: 95-114.
• Morrone, J. J. 2002. El espectro del dispersalismo: De los centros de origen a las áreas ancestrales. Rev. Soc. Entomol. Argent. 61:1-14.
• Müller, P. 1979. Introducción a la zoogeografía. Blume, Barcelona.
• Rzedowski, J. 1996. Diversidad y orígenes de la flora fanerogámica de México. Bol. Soc. Bot. Mex. 29: 27-40.
• Simpson, G. G. 1964. Evolución y geografía: Historia de la fauna de América Latina. Eudeba, Buenos Aires.

6. PANBIOGEOGRAFÍA

• Craw, R. C., J. Grehan y M. J. Heads. 1999. Panbiogeography: Tracking the history of life. Oxford Biogeography Series 11, Oxford University Press.
• Espinosa, D. y J. Llorente. 1993. Fundamentos de biogeografía filogenéticas. UNAM-Conabio, México, D.F.
• Morrone, J. J. 2004. Panbiogeografía, componentes bióticos y zonas de transición. Revta. Bras. Entomol. 48: 149-162.
• Morrone, J J. 2015. Track analysis beyond panbiogeography. Journal of Biogeography 42: 413-425.

7. BIOGEOGRAFÍA CLADÍSTICA

• Brooks, D. R. 2005. Historical biogeography in the age of complexity: Expansion and integration. Rev. Mex. Biodivers. 76: 79-94.
• Espinosa, D. y J. Llorente. 1993. Fundamentos de biogeografías filogenéticas. UNAM¬CONABIO, México, D.F.
• Goyenechea I., O Flores V., y J. J. Morrone. 2001. Introducción a los fundamentos y métodos de la biogeografía cladística. En: Llorente B. J. y J.J. Morrone (eds.) Introducción a la biogeografía en Latinoamérica: Teorías, conceptos, métodos y aplicaciones. Las Prensas de Ciencias, Facultad de Ciencias, UNAM. México D. F. pp. 225-243.
• Humphries, C. J. y L. R. Parenti. 1999. Cladistic biogeography: Interpreting patterns of plant and animal distributions. Oxford Biogeography Series 12, Oxford University Press.
• Morrone, J. J. 2004. Homología biogeográfica: Las coordenadas espaciales de la vida. Cuadernos del Instituto de Biología 37, México, D.F.
• Parenti, L. R. & M. C. Ebach. 2009. Comparative biogeography: Discovering and classifying biogeographical patterns of a dynamic Earth. University of California Press, Berkeley y Los Angeles.
• Ronquist, F. 1997.Dispersal-vicariance analysis: A new approach to the quantification of historical biogeography. Syst. Biol. 46: 195-203.

8. BIOGEOGRAFÍA MOLECULAR

• Avise, J. C. 2000. Phylogeography: The history and formation of species. Harvard University Press. Cambridge, Massachusetts.
• Buerki, S., F. Forest, N. Alvarez, J.A.A. Nylander, N. Arrigo y I. Sanmartin. 2010. An evaluation of new parsimony‐based versus parametric inference methods in biogeography: a case study using the globally distributed plant family Sapindaceae. Journal of Biogeography 38: 531-550.
• Lanteri, A. A. y V. A. Confaloneri. 2003. Filogeografía: Objetivos, métodos y ejemplos. En: Una perspectiva latinoamericana de la biogeografía. Morrone, J. J. y J. Llorente B. (eds). Facultad de Ciencias, UNAM, pp. 185-193.
• Ree, R.H. y I. Sanmartin. 2009. Prospects and challenges for parametric models in historical biogeographical inference. Journal of Biogeography 36: 1211-1220.
• Ronquist, F. y I. Sanmartín. 2011. Phylogenetic Methods in Biogeography. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 41: 441-464.
• Vázquez-Domínguez, E., S. Castañeda-Rico, T. Garrido-Garduño & T. A. Gutiérrez-García. 2009. Avances metodológicos para el estudio conjunto de la información genética, genealógica y geográfica en análisis evolutivos y de distribución. Rev. Chil. Hist. Nat. 82: 277-297.

9. BIOGEOGRAFÍA Y CONSERVACIÓN

• Ladle, R. J. y R. J. Whittaker (eds.). 2011. Conservation biogeography. Wiley-Blackwell, Oxford.
• Luna-Vega, I., J. J. Morrone & T. Escalante. 2010. Conservation biogeography: A viewpoint from evolutionary biogeography. En: Gailis, M. & S. Kalniņš (eds.), Biogeography, Nova-Science Publishers, Nueva York, pp. 229-240.
• Morrone, J. J. y J. V. Crisci. 1992. Aplicación de métodos filogenéticos y panbiogeográficos en la conservación de la diversidad biológica. Evol. Biol. (Bogotá) 6: 53-66.
• Pozo, C. y J. Llorente. 2001. La teoría del equilibrio insular en biogeografía y bioconservación. pp. 95-106. En Introducción a la biogeografía en Latinoamérica: Teorías, conceptos, métodos y aplicaciones. Las Prensas de Ciencias, UNAM, México, D.F.