Biología (plan 1997) 2024-2

Segundo Semestre, Sistemática I

Sistemática 1- Grupo 5109

Profesores:

Alina Katia Juárez Medina (akjm@ciencias.unam.mx)

Daniel Edwin Domínguez León (biologiaunamedwin@gmail.com)

Horario: Miércoles 18:00- 21:00 y viernes 19:00-21:00

Objetivos

Introducir a los estudiantes en los conocimientos generales teóricos y metodológicos de la sistemática , mediante la exposición, análisis y discusión de conceptos, métodos y aplicaciones.

Evaluación del curso

1. Exámenes parciales: 40% de la calificación total.

2. Tareas: 10% de la calificación total.

3. Prácticas: 30% de la calificación total.

4. Trabajo final: 20% de la calificación total.

Notas

1. Solo será posible reponer un examen parcial.

2. Solo se asienta NP en actas si el estudiante no realizó ninguna actividad práctica. NA no es equivalente ni intercambiable con NP.

3. No se aceptarán trabajos finales ni actividades extracurriculares para subir la calificación.

4. La calificación aprobatoria aceptada es a partir de 6, con un valor menor se asienta en el acta NA.

Temario (Sesiones)

1. Presentación del curso (evaluación, programas y bibliografía útil para el curso). (31 de enero).

2. Introducción a los conceptos básicos de la sistemática. (2 de febrero).

3. Historia de la sistemática y del concepto de homología. (7 de febrero).

4. Conceptos de especie. (9 de febrero).

5. Patrones de especiación. (14 de febrero).

6. Mecanismos de aislamiento reproductivo.(16 de febrero).

7. Sistemática evolutiva. (21 de febrero).

8. Fenética. (23 de febrero).

9. Examen parcial (28 de febrero).

10. Concepto de carácter y estado de carácter. Tipos de caracteres y codificación. (1 de marzo).

11. Homología. Definición de los términos homología, homoplasia,autapormorfia, sinapomorfia, simplesiomorfia, grupos monofiléticos, parafiléticos y polifiléticos. (6 de marzo).

12. Homología. Definición de los términos homología, homoplasia,autapormorfia, sinapomorfia, simplesiomorfia, grupos monofiléticos, parafiléticos y polifiléticos. (8 de marzo).

13. Cladismo. Reconstrucción filogenética con el principio de parsimonia. Métodos utilizando el principio de parsimonia. (13 de marzo).

14. Cladismo. Reconstrucción filogenética con el principio de parsimonia. Métodos utilizando el principio de parsimonia. (15 de marzo).

15. Examen parcial (20 de marzo).

16. Caracteres moleculares: Búsqueda de secuencias y alineamiento. (22 de marzo).

17. Caracteres moleculares: Búsqueda de secuencias y alineamiento. (3 de abril).

18. Reconstrucción filogenética con métodos probabilísticos. Inferencia filogenética por máxima verosimilitud y por probabilidad posterior (Bayesiana). (5 de abril).

19. Reconstrucción filogenética con métodos probabilísticos. Inferencia filogenética por máxima verosimilitud y por probabilidad posterior (Bayesiana). (10 de abril).

20. Examen parcial (12 de abril).

21. Taxonomía integrativa. (17 de abril).

22. Nomenclatura biológica. Sinonimia y homonimia. Tipificación. (19 de abril).

23. Nomenclatura biológica. Sinonimia y homonimia. Tipificación. (24 de abril).

24. La importancia de las colecciones biológicas como un acervo de información. (26 de abril).

25. Taxonomía aplicada a nivel profesional (ponencia). (3 de mayo).

26. Taxonomía aplicada a nivel profesional (ponencia). (8 de mayo).

27. Exposición del trabajo final. (17 de mayo).

28. Reposiciones y Calificaciones finales. (22 de mayo).

Consideraciones adicionales

Para el curso se utilizarán programas específicos para la parte práctica, sin embargo, no es necesariocontar con un equipo personal (laptop o PC) ya que se utilizará el equipo de laboratorio de cómputo y el trabajo en equipo que permita el desarrollo de las diferentes metodologías.

La calificación final se redondea a partir de 0.5 al siguiente valor.

No se pondrá NA ni NP si la calificación es aprobatoria.

Bibliografía básica

Chen, M. H., Kuo, L., & Lewis, P. O. (Eds.). (2014). Bayesian phylogenetics: methods, algorithms, and applications. CRC Press.

Hawkins, J. A. et al. (1997). Primary homology assessment, characters and character states. Cladistics 13, 275–283

Kitching, I. J. (1998). Cladistics: the theory and practice of parsimony analysis (No. 11). Oxford University Press, USA.

Morrone, J. J. (2013). Sistemática. Fundamentos, métodos, aplicaciones. Facultad de Ciencias, UNAM, Ciudad de México.