Biología (plan 1997) 2024-2

Segundo Semestre, Sistemática I

Presentación del curso Sistemática I Grupo 5098

Profesoras: Itzel Sigala Regalado y Daniela T. Candia Ramírez

Evaluación:

La evaluación del curso consistirá en la entrega y evaluación continua de reportes de lectura, tareas, actividades en clase, cuestionarios y exposiciones. Todo lo realizado tendrá el mismo valor, por lo que al final sólo se promediarán el número de actividades realizadas a lo largo del curso.

Método de clase:

Sesiones teóricas y prácticas. Las prácticas se realizarán en computadora (métodos de reconstrucción filogenética) y en colecciones biológicas (Instituto de Biología). Al final del curso se realizarán sesiones donde los alumnos apliquen los conocimientos adquiridos en diferentes productos relacionados con la práctica de la Sistemática.

Temario:

1 INTRODUCCIÓN

1.1 La Sistemática como ciencia: Importancia de la Sistemática, Conceptos y definición, Posición dentro la biología y relación con otras áreas.

1.2 Áreas de la Sistemática y conceptos comunes: Taxonomía, clasificación, clave, sistemática, nomenclatura biológica, filogenia, naturalidad, clasificación artificial, taxón natural, taxón, determinación taxonómica, jerarquía, diagnosis, descripción, carácter, estado de carácter, categoría taxonómica.

2 HISTORIA DE LA SISTEMATICA

2.1 Sistemática folk y orígenes de la taxonomía.

2.2 Sistemática prelinneana.

2.3 Sistemática linneana (Linneo, el esencialismo y Adanson).

2.4 Sistemática, Paleontología y Evolución (Darwin).

2.5 La nueva Sistemática. Taxonomía Experimental y Biosistemática.

2.6 Orígenes del feneticismo y del Cladismo.

2.7 Taxonomía integrativa

2.8 La Sistemática y las tecnologías de la información

3 ESPECIES

3.1 Aspectos epistemológicos: el problema de las especies, existencia de las especies.

3.2 Conceptos de especie

3.3 El concepto general de linajes

3.4 Categorías infraespecíficas y variabilidad geográfica

4 PATRONES DE ESPECIACIÓN

4.1 Anagénesis y cladogénesis: polaridad y divergencia evolutiva, árboles filogenéticos, pensamiento en árbol.

4.2 Relaciones reproductivas y ontogenia.

4.3 Especiación geográfica: alopatría-vicarianza, parapatría-clinas, aloparapatría y peripatría.

4.4 Especiación simpátrica.

4.5 Hibridación e introgresión. Patrones de evolución reticulada.

4.6 Teoría coalescente

5 CARACTERES

5.1 Caracteres discretos y cuantitativos.

5.2 Caracteres morfológicos.

5.3 Caracteres moleculares.

5.3.1 Clasificación de marcadores

5.3.2 Métodos basados en secuencias:

5.3.3 Elección de marcadores, informatividad

5.4 Compatibilidad, congruencia y consenso en Taxonomía.

6 RECONSTRUCCIÓN FILOGENÉTICA

6.1 Conceptos: Holomorfología y semaforontes, Homología y homoplasia, Criterios de homología, Niveles de universalidad: apomorfía y plesiomorfía.

6.2 Dendrogramas y pensamiento en árbol. Grupo externo, monofilia, polifila y parafilia.

6.3 Conceptos de Cladística

6.4 Fenética/Sistemática numérica

6.5 Gradística/Sistemática evolutiva

6.6 Métodos de reconstrucción filogenética y técnicas asociadas: Métodos de distancias: NJ, UPGMA, etc., Parsimonia, Máxima Verosimilitud, Inferencia Bayesiana, Métodos coalescentes, Reloj Molecular, Métodos de reconstrucción de estados y áreas ancestrales

7 NOMENCLATURA Y CÓDIGOS

7.1 Estabilidad y comunicación. Universalidad de la clasificación. La importancia del latín en la clasificación. Etimologías comunes.

7.2 Prioridad, homonimia y sinonimia.

7.3 Tipos y ética en Sistemática.

7.4 Taxonomía alfa. Importancia. Perspectivas ante los métodos moleculares. Descripción de nuevas especies. Protólogos.

8 LITERATURA TAXONÓMICA, COLECCIONES Y BASES DE DATOS DE BIODIVERSIDAD

8.1 Monografías, revisiones, floras, claves, catálogos, guías, atlas, descripciones y notas.

8.2. Bancos de genes y germoplasma, ceparios, colecciones, herbarios, museos, jardines botánicos, zoológicos y áreas protegidas.

8.3. Repositorios en línea: Biodiversity Heritage Library, Plantlist, IAPT, etc.

8.4. Bases de datos de biodiversidad: GBIF, REMIB, Tropicos. Utilidad y limitaciones

9 TÓPICOS DIVERSOS

9.1 La Sistemática en México: Breve historia, científicos destacados y sus aportaciones.

9.2 La Sistemática y la crisis de la biodiversidad: la sexta extinción, días conmemorativos, etc.

9.3 La crisis de la Sistemática contemporánea.

9.4 El concepto de especies humanas.

9.5 La sistemática y las artes: la ilustración científica, numismática, filatelia, el arte como evidencia, fotografía científica, etc..