Biología (plan 1997) 2024-2

Segundo Semestre, Biología Molecular de la Célula I

Mensaje de bienvenida

Clases teóricas

Días jueves de 18:00 - 21:00 horas.

Lugar: Por asignar.

Clases prácticas

Días martes en horario de 18:00 - 21:00 horas.

Lugar: Laboratorio de Prácticas de Biología Molecular de la Célula I.

Docentes:

Georgina Nieto Castañeda

Correo electrónico: ginanietoc3107@ciencias.unam.mx

Criterios de evaluación de la asignatura

Las clases teóricas ponderan con el 45%

Las clases prácticas ponderan con el 45%

El examen departamental pondera con el 10%

Para aprobar la asignatura es requisito obtener una calificación aprobatoria (6.0-10.0) tanto en la teoría como en el laboratorio.[1]

Estrategias de enseñanza-aprendizaje

La asignatura es teórica-práctica y consta de nueve unidades temáticas, que se desarrollarán mediante clases teóricas en el salón de clase y prácticas en el laboratorio; el estudiantado aprenderá la importancia de las diversas macromoléculas presentes en los seres vivos, así como la estructura y funciones que desempeñan los ácidos nucléicos en la vida.

Temario

1. El agua

1.1. Propiedades fisicoquímicas de la molécula de agua. Formación de puentes de hidrógeno.

1.2. Interacción del agua con moléculas polares y no polares. Efecto hidrofóbico.

1.3. Ionización de las moléculas de agua

1.4. Disociación de ácidos y bases.

1.5. Conceptos de pH y pI. Amortiguadores.

2. La relevancia de los enlaces no covalentes y las interacciones reversibles en la

biología.

3. La relación estructura­función a nivel de las proteínas.

3.1. Propiedades fisicoquímicas y clasificación de los aminoácidos.

3.2. Estructuras primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.

3.3. Métodos de purificación y análisis de proteínas.

3.4. Proteínas estructurales: queratinas, colágena.

3.5. Proteínas de transporte: mioglobina y hemoglobinas.

3.6. Autoensamble y polimerización de proteínas.

4. Enzimas

4.1. Equilibrio químico

4.2. Energía libre de activación y mecanismo de catálisis.

4.3. Cofactores y coenzimas

4.4. Concepto y estructura del sitio activo

4.5. Cinética enzimática. Inhibidores de la actividad enzimática. Regulación de la actividad enzimática. Alosterismo, modificaciones covalentes y activación de zimógenos

5. Estructura de los ácidos nucleícos

5.1. Nucleótidos y polinucleótidos. DNA y RNA.

5.2. El modelo de la doble hélice de Watson y Crick. Conformaciones A, B y Z.

5.3. Interacciones de los ácidos nucléicos con proteínas

6. Organización y características del material genético en los sistemas biológicos.

6.1. Contenido de DNA en los organismos. La paradoja C.

6.2. DNA y RNA virales.

6.3. DNA bacteriano

6.4. Elementos genéticos móviles: transposones, plásmidos. Implicaciones evolutivas: transferencia genética horizontal.

6.5. El genoma eucarionte: DNA alta y medianamente repetido, DNA de copia única. Genes partidos: exones e intrones.

6.6. Estructura molecular del cromosoma eucarionte. Nucleosomas. II.6.7. DNA en organelos.

7. Los flujos de información en los sistemas biológicos

7.1. El dogma central de la biología molecular

7.2. Características generales del código genético

7.3. Clasificación de las mutaciones: puntuales y no puntuales.

7.4. Clasificación de las mutaciones puntuales: deleciones, inserciones, transiciones y transversiones.

7.5. Clasificación de las mutaciones con respecto al código genético: silenciosas, de sentido equivocado, sin sentido. Teoría neutralista de la evolución.

7.6. Comparación de secuencias de proteínas y ácidos nucléicos a lo largo de la escala filogenética. Homología y similitud a nivel molecular; genes ortólogos y parálogos.

7.7. Replicación, reparación del DNA y recombinación.

7.8. Transcripción. Procesamiento postranscripcional del RNA II.7.9. Traducción

8. Regulación de la expresión génica

8.1. El paradigma del modelo del operón en bacterias.

8.2. Eucariontes. Sistemas unicelulares y pluricelulares, totipotencialidad, genes de diferenciación y genes de rutina, niveles de expresión, genes de segmentación y genes homeóticos.

9. Tecnología de DNA recombinante.

9.1. Clonación de DNA. Endonucleasas de restricción. Vectores de clonación.

9.2. Hibridación de secuencias específicas en ácidos nucléicos.

9.3. Amplificación de secuencias específicas. PCR.

9.4. Secuenciación de ácidos nucléicos.

9.5. Expresión de los productos de clonación.

Prácticas

1. Instrumentación.

2. Preparación de disoluciones.

3. Precipitación isoeléctrica de la caseína de la leche.

4. Cuantificación de proteínas.

5. Electroforesis de proteínas.

6. Cinética enzimática de la polifenol oxidasa.

7. Proteómica comparativa.

8. Preparación de medios de cultivo para Escherichia coli y propagación de E. coli transformada con pGLO.

9. Mini preparaciones de plásmidos

10. Transformación con pGLO.

11. Enzimas de restricción.

12. Escena del crimen: perfil de DNA (DNA fingerprinting).

13. Desechos de residuos generados en el laboratorio de Biología molecular de la célula I.

[1] Reglamento General de Exámenes de la UNAM. Disponible en: http://www.abogadogeneral.unam.mx:6060/legislacion/view/29