Biología (plan 1997) 2024-1

Quinto Semestre, Taller Nivel 1

Antropología Molecular Clase Teórica

TALLER DE ANTROPOLOGÍA MOLECULAR

OBJETIVO GENERAL

El Taller de Antropología Molecular tiene como objetivo introducir a los alumnos a este campo de investigación que se caracteriza por el análisis genético de las poblaciones humanas actuales y antiguas.

Los campos que se revisan son: Biología Molecular, Antropología, Genética de Poblaciones, Bioinformática, e Historia.

OBJETIVOS PARTICULARES

1. En los niveles 1 Y 2 del taller se introducirá a los alumnos al campo de la

Antropología Molecular con énfasis en entender aspectos básicos y especializados de la disciplina, tanto a nivel teórico como práctico.

Objetivos particulares del Taller nivel 1 y 2:

1. Revisar los conceptos generales de la antropología biológica y en particular de la antropología molecular, ya que actualmente son campos muy activos de investigación interdisciplinaria, especialmente en el área de la evolución de las poblaciones humanas.

2. Adquirir experiencia en revisar artículos científicos relevantes, incluyendo los más recientes, ya que son las fuentes originales de la información científica.

3. Conocer el reglamento de seguridad del Laboratorio de Antropología Molecular y las medidas preventivas en el estudio del DNA moderno y antiguo.

4. Aprender el funcionamiento del material y equipo de laboratorio.

5. Aprender las metodologías que se utilizan en el análisis del DNA mitocondrial moderno.

Evaluación.

Asistencia obligatoria

Participación en clase 100%

Exposición de temas específicos

REQUISITOS

Leer fluidamente literatura científica en inglés y haber cursado y aprobado Biología Molecular de la Célula I para los alumnos de Biología.

El horario del taller 1 requiere dos días a la semana de dos horas cada día. La teoría se impartirá los días viernes de 16 a 18 pm (horario tentativo). La práctica puede ser los días lunes por la mañana. El horario específico se acuerda con los alumnos interesados en cursarlo.

Contenido Temático en las clases Teóricas:

1. Introducción.

1.1 ¿Qué es la Antropología Molecular? Alcances y estudios.

1.2 Areas de la antropología (Antropología Biológica, Histórica, Social, Arqueología, Etnológica y Lingüísitca).

1.3 Antropología Biológica.

2. Biología Molecular: Conceptos básicos del DNA

2.1 Características físico-químicas de la molécula de DNA.

2.2 Características generales del genoma mitocondrial.

2.3 Marcadores genéticos.

3. Haplogrupos mitocondriales.

3.1 Marcadores denominados polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción (RFLPs en inglés).

3.2 Definición de los cinco haplogrupos fundadores del mtDNA.

3.3 Distribución de los haplogrupos en América.

3.4 Haplotipos del mtDNA.

3.5 Definición y distribución de los haplotipos mitocondriales en América.

3.6 Estudios de los haplogrupos y haplotipos del DNA mitocondrial en poblaciones indígenas actuales de México.

3.7 Estudios de los haplogrupos y haplotipos del DNA mitocondrial en poblaciones indígenas prehispánicas de Mesoamérica.

4. Contenido Temático en las clases teóricas-“prácticas”:

4.1 Reglamentos en el Laboratorio.

4.2 Material y equipo de laboratorio.

4.3 Protocolos de esterilización de material.

4.4 Preparación de soluciones acuosa y tipos de agua.

4.5 Preparación de soluciones molares y porcentuales.

4.6 Importancia del pH en las disoluciones.

4.7 Aprendizaje de uso de micropipetas y pipeteo.

4.8 Extracción de DNA.

Literatura sugerida.

1. Álvarez-Sandoval, B. A., Manzanilla, L. R., González-Ruiz, M., Malgosa, A., & Montiel, R. 2015. Genetic evidence supports the multiethnic character of teopancazco, a neighborhood center of Teotihuacan, Mexico (ad 200-600). PLoS ONE 10(7), e0132371.

2. De la Cruz-Laina, I., González-Oliver, A., Kemp B., Román, J.A., Smith, D.G., Torre-Blanco, A. 2008.Sex identification of children sacrificed to the ancient Aztec rain gods in Tlatelolco. Current Anthropology, 49(3), 519-526.

3. González-Martín, A. et al. 2015. Demographic history of indigenous populations in Mesoamerica based on mtDNA sequence data. PLoS One, 10.

4. González-Oliver, A., Garfias-Morales, E., David G. Smith, & Quinto-Sánchez, M. 2017. Mitochondrial DNA analysis of Mazahua and Otomi indigenous populations from Estado de México suggests a distant common ancestry. Human biology, 89(3), 195-216.

5. González‐Oliver, A., Márquez‐Morfín, L., Jiménez, J. C., & Torre‐Blanco, A. Founding amerindian mitochondrial DNA lineages in ancient Maya from Xcaret, Quintana Roo. 2001. American Journal of Physical Anthropology, 116(3), 230-235.

6. González-Oliver, A., Pineda-Vázquez, D., Garfias-Morales, E., De La Cruz-Laina, I., Medrano-González, L., Márquez-Morfín, L. & Ortega-Muñoz, A. 2019. Genetic Overview of the Maya Populations: Mitochondrial DNA Haplogroups. Human biology, 90(4), 281-300.

7. Joseph G. Lorenz & David G. Smith. 1996.Distribution of four founding mtDNA haplogroups among native North Americans. American Journal of physical anthropology, 101: 307-323.

8. Kemp, B., & Schurr, T. G. 2010. Ancient and Modern Genetic Variation in the Americas (1 ed.). Center of Archaeological Investigations. pp: 12-50.

9. Lehninger Albert, Nelson David and Michael Cox. Priciples of Biochememistry. Worth Publishers. New York.

10. Malhi, R.S. et al. 2001. Distribution of mitochondrial DNA lineages among Native American tribes of Northeastern North America. Hum. Biol, 73, 17–55

11. Michael D. Brown, Seyed H. Hosseine, Antonio Torroni, Hans-Jürgen Bandelt, Jon C. Allen, Theodore G. Schurr, Rosaria Scozzari, Fulvio Cruciani, and Douglas C. Wallace. 1998. MtDNA haplogroup X: An ancient link between Europe/Western Asia and North America?. Am. J. Hum. Genet. 63: 1852-1861.

12. Ochoa-Lugo, de Lourdes Muñoz, Pérez-Ramírez, Beaty, López-Armenta, Cervini & Silva, … Romano-Pacheco. 2017. Genetic Affiliation of Pre-Hispanic and Contemporary Mayas through Maternal Linage. Human Biology, 88(2), 136.

13. Peñaloza-Espinosa, R.I. et al. 2007. Characterization of mtDNA Haplogroups in 14 Mexican Indigenous Populations. Hum. Biol. 79, 313–320.

14. Ripan S. Malhi, Jason A. Eshleman, Jonathan A. Greenberg, Deborah A. Weiss, Beth A. Schultz, Frederika A. Kaestle, Joseph G. Lorenz, Briam M. Kemp, John R. Johnson, and David Glenn Smith. 2002. The structure of diversity within New World mitochondrial DNA haplogroups: Implications for the prehistory of North America. Am. J. Hum. Genet. 70: 905-919.

15. Roca-Rada X, Souilmi Y, Teixeira JC, Llamas B. Ancient DNA Studies in Pre-Columbian Mesoamerica. 2020. Genes, 11(11):1346.

16. Sandoval, K., Buentello-Malo, L., Peñaloza-Espinosa, R., Avelino, H., Salas, A., Calafell, F., & Comas, D. 2009. Linguistic and maternal genetic diversity are not correlated in Native Mexicans. Human Genetics, 126(4), 521–531.

17. Torroni A., Schurr T., Cabell M., Brown M., Neel J., Larsen M., ... & D.Wallace. 1993. Asian affinities and continental radiation of the four founding Native American mtDNAs. American journal of human genetics, 53(3), 563.

18. Torroni, A., Shurr, T. G., Yang, C., Szathmary, E. J. E., Williams, R.C., Schanfield, M.S.,Troup G.A., Knowler, W.C., Lawrence, D.N., Weiss K.M. and Wallace, D.C. 1992. Native American Mitochondrial DNA Analysis indicates that the amerind and the nadene populations were founded by two independent migrations. Genetic, 130: 153-162.

Literatura Complementaria

1. Dirce Pineda V. (2015). Estudio del DNA mitocondrial en poblaciones indígenas contemporáneas: Mixe, Mixteca y Maya del sureste de México. Tesis de Maestría. Universidad Nacional Autónoma de México.

2. Ernesto Garfías Morales. (2016). Búsqueda e identificación de DNA de treponema pallidum en restos óseos humanos prehispánicos de México, que muestran lesiones sugerentes de sífilis. Tesis de Maestría. Universidad Nacional Autónoma de México.

3. Guadalupe E. Alarcón G. (2017). Revisión histórica de la investigación del DNA mitocondrial humano en Sudamérica relacionada con el poblamiento de América. Seminario de Titulación. Universidad Nacional Autónoma de México.

4. Héctor A. López H. (2019). Análisis de marcadores genéticos del DNA mitocondrial en indígenas teenek que habitan la Huasteca Potosina, México. Tesis de Licenciatura. Universidad Nacional Autónoma de México.

5. Miriam J. Bravo L. (2016). Análisis del DNA mitocondrial en mayas contemporáneos y antiguos de Xcaret, Quintana Roo. Tesis de Maestría. Universidad Nacional Autónoma de México.

6. Smith, M. E. (1984). The Aztlan Migrations of the Nahuatl Chronicles: Myth or History?. Ethnohistory, 31(3), 153–186.

7. Theodore G. Schurr, Scott W. Ballinger, Yik-Yuen Gan, Judith A. Hodge, D. Andrew Merriwether, Dale N. Lawrence, William C. Knowler, Kenneth M. Weiss and Douglas C. Wallace. Amerindian mitochondrial DNAs Have rare asian mutations at high frequencies, suggesting they derived from four primary maternal lineages. Am. J. Hum. Genet. 46:613-623, 1990.