Biología (plan 1997) 2024-1

Tercer Semestre, Biología Molecular de la Célula II

Grupo 5453. Biología Molecular de la Célula II

Presentación del curso. Parte de teoría

Profesor: Héctor Quezada Pablo hquezada@ciencias.unam.mx

La calificación final de la materia corresponde al 50% de teoría y al 50% de laboratorio. Se debe aprobar ambas partes para aprobar la materia, pues en caso de reprobar teoría o laboratorio, en automático se reprueba la materia.

La calificación final subirá al siguiente número cerrado a partir de 0.6.

Sesiones de teoría

Viernes 14:30 a 17:30

Las clases serán de tres ciclos de 50 minutos de explicación por parte del profesor, resolver ejercicios, exposición de los alumnos, y 10 minutos de descanso. Algunos ejercicios involucrarán videos o textos en inglés.

Se intercambiará información, tareas y ejercicios por correo electrónico y la plataforma Classroom .

Algunos exámenes se resolverán en clase y otros en casa.

Evaluación

Exámenes parciales 60%

Tareas, ejercicios y exposiciones 40%

La calificación será el promedio de 5 calificaciones parciales de acuerdo con la siguiente planeación didáctica:

Sesión 1

1. LA MEMBRANA PLASMATICA

I.1. Bicapas de lípidos.

I.1.1. Estructura de los lípidos polares y composición de las membranas biológicas

I.2. proteínas y carbohidratos membranales.

I.3. La membrana del eritrocito.

I.3.1. La membrana del eritrocito como sistema modelo.

I.3.2. Anclaje al citoesqueleto.

I.4. Mecanismos de transporte a través de las membranas celulares.

I.4.1. Transporte pasivo de solutos.

I.4.2. Transporte activo de iones. Canales iónicos.

I.4.3. Co-transporte: simporte y antiporte

I.4.4. Osmosis. Movimiento del agua y regulación del volumen celular

I.4.5. Transporte de macromoléculas y partículas: endo y exocitosis.

I.4.6. Fusión de membranas, entrada de virus a la célula.

Sesión 2:

II.1. Conceptos básicos y diseño del metabolismo.

II.1.1. Transferencia de energía de autótrofos a heterótrofos.

II.1.2. Conceptos de anabolismo y catabolismo y su interrelación.

II.2. El papel del ATP como moneda energética de la célula.

II.2.1. Conceptos termodinámicos básicos.

II.2.2. El ciclo del ATP y la bioenergética de la célula.

II.2.3. Reacciones de oxido­rreducción.

II.2.4. El poder reductor y el control del metabolismo energético en la célula.

PRIMER EXAMEN PARCIAL Sesión 3

Sesión 4:

II.3. Estructura química y función de los carbohidratos.

II.3.1. Monosacáridos, disacáridos, polisacáridos.

II.4. Glicólisis y fermentación.

II.4.1. La glicólisis.

II.4.2. Metabolismo fermentativo en bacterias.

II.4.3. La importancia de distintos tipos de fermentación en los procesos biotecnológicos.

Sesión 5:

II.5 Ciclo de Krebs.

II.5.1. La descarboxilación del piruvato.

II.5.2. El ciclo de los ácidos tricarboxílicos.

II.6. Estructura mitocondrial y bioenergética.

II.6.1. Estructura y compartimentalización de las mitocondrias.

II.6.2. Estructura y composición de la membrana interna.

II.6.3. La hipótesis del acoplamiento quimiosmótico.

II.6.4. Transporte de electrones.

II.6.5. Fosforilación oxidativa.

SEGUNDO EXAMEN PARCIAL Sesión 6

Sesión 7:

II.7. Vía colateral de las pentosas.

II.7.1. La generación de poder reductor para reacciones biosintéticas.

II.8. Gluconeogénesis y metabolismo del glucógeno.

II.8.1. Gluconeogénesis.

II.8.2. Síntesis y degradación del glucógeno. Regulación hormonal.

Sesión 8:

II.9. Metabolismo de los ácidos grasos.

II.9.1. Estructura de los ácidos grasos. Triglicéridos, almacenamiento de energía.

II.9.2. Beta oxidación.

II.9.3. Biosíntesis de los ácidos grasos.

TERCER EXAMEN PARCIAL Sesión 9:

Sesiones 10 y 11::

II.10. Estructura de los cloroplastos y fotosíntesis.

II.10.1. Estructura y compartimentalización de los cloroplastos.

II.10.2. Las clorofilas y los pigmentos accesorios. Interacción con la luz.

II.10.3. Las fases luminosa y oscura de la fotosíntesis.

II.10.4. El flujo de electrones y la fosforilación del ADP.

II.10.5. La fijación del CO2. Ciclo de Calvin.

II.10.6. Fotorrespiración. Plantas C3 y C4.

II.11. El transporte de proteínas a las mitocondrias y cloroplastos.

CUARTO EXAMEN PARCIAL Sesión 12:

Sesiones 13 y 14:

II.12. Metabolismo del nitrógeno.

II.12.1. Ciclo del nitrógeno en la biósfera

II.12.2. Fijación biológica del nitrógeno

II.12.3. Ciclo de la urea. Transaminación y desaminación.

II.13. Perspectiva evolutiva del metabolismo.

II.13.1. Las posibles relaciones evolutivas entre distintas vías metabólicas.

II.14. Integración del metabolismo energético en animales.

QUINTO EXAMEN PARCIAL Sesión 15

Bibliografía para la parte de teoría

• David L. Nelson and Michael M. Cox. Lehninger Principles of Biochemistry. Sixth, Seventh, or eighth editions. W. H. Freeman
• Donald Voet and Judith G. Voet. Biochemistry. 4th Edition. Wiley & Sons. (2011)
• B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, and P. Walter. Molecular biology of the cell. 5th edition. Garland Science (2008)

Sección laboratorio

Profesora Jazmín Aguilar Medina correo obsole@ciencias.unam.mx

Forma de evaluación bitácora 50% tareas en la bitácora 20%, exámenes parciales en línea 30%

Sesiones de laboratorio martes de 14:30 a 18:30

Dinámica de clase, se revisaran antes de cada práctica los aspectos teóricos brevemente, antes de cada práctica los alumnos tendrán que revisar el procedimiento y resolver las preguntas de cada práctica que colocarán como introducción de cada práctica en su bitácora, en esta se anotaran los detalles extra a lo que se explica en el manual con información que permita elaborar el análisis de resultados y conclusión correspondientes.

Se recomienda adquirir el manual de laboratorio pero no es obligatorio.

Calendario de prácticas tentativo

Práctica 1. Buenas prácticas del Laboratorio de Biología Molecular de las Célula II 22-08
Práctica 2. Preparación de disoluciones 22-08
Práctica 3. Elaboración de curvas estándar 29-09 y 05-09
Práctica 4. Propiedades generales de los lípidos 12-09
Práctica 5. Membranas y ósmosis 19-09
Práctica 6. Carbohidratos 26-09 y 03-10
Práctica 7. Degradación de almidón por la α-amilasa salival 10-10
Práctica 8. Fermentación de la glucosa por la levadura de panificación (Saccharomyces cerevisiae) 17-10
Práctica 9. Actividad de la enzima del ciclo de Krebs: malato deshidrogenasa 24-10
Práctica 10. Efecto del nitrofenol y azida de sodio en los cambios de ph extracelular inducido por el consumo de glucosa en Saccharomyces cerevisiae 31-10
Práctica 11. Metabolismo de semillas en germinación: conversión de lípidos de reserva a glucosa 07-11 y 14-11
Práctica 12. Actividad fotosintética en cloroplastos aislados de Spinacia oleraceae L. (espinaca) 21-11
Práctica 13. Actividad enzimática de la alanina aminotransferasa 28-11