Profesor | Marco Fabio Ortiz Ramírez | lu | 11 a 14 | B001 |
ju | 11 a 14 | Laboratorio de Prácticas de Sistemática I | ||
Profesor | Niza Gámez Tamariz |
BIOGEOGRAFÍA II
DOCENTES
Dra. Niza Gámez Tamariz nizagt@ciencias.unam.mx
Dr. Marco Fabio Ortiz Ramírez marcoortiz@ciencias.unam.mx
OBJETIVO
Brindar al grupo de estudiantes información que les permita profundizar sus conocimientos en BIOGEOGRAFÍA, haciendo especial énfasis
en los métodos y técnicas más recientes empleadas en Biogeografía. A la par, buscamos desarrollar el pensamiento crítico, por ello, se espera que
participen mucho y que reflexionen más, de eso dependerá en parte grande el nivel del curso.
DINÁMICA : este curso es teórico-práctico, enfocado a abordar los métodos biogeográficos contemporáneos.
Durante todo el curso se buscará que el estudiante desarrolle habilidades analíticas, mediante el uso herramientas de última generación.
Utilizaremos el Classroom para diversas cosas, como envío de bibliografía, tareas y material de apoyo.
ÉTICA ACADÉMICA
Es importante que no incurras en plagio, porque de lo contrario tu evaluación será cero. Para ello te invitamos a visitar la liga siguiente de la
página de la UNAM donde se te aclara qué es, cómo evitarlo y cómo citar correctamente: Ética académica
No se envían las presentaciones de las clases. |
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Temario |
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mes | Temas | Teoría, conceptos y herramientas metodológicas | Notas | ||
Agosto |
Historia de la Biogeografía en Mesoamérica y el Caribe -Historia sobre la biogeografía con énfasisi en Mesoamérica y Latinoamérica -Cambios de paradigmas en biogeografía -Repaso de conceptos basicos para estudiar la distribución de los seres vivos |
Presentación del curso e Introducción a la biogeografía e historia en América Latina | |||
Repaso de conceptos basicos y cambios del pensamiento en biogeografía | |||||
Generalidades geográficas y ecológicas - Componente geológico en México - Elementos del ambiente físico y su importancia en la delimitación de patrones de distribución de las especies - Areografía - Patrones en Biogeografía |
ntroducción al lenguaje de programación y su uso en análisis de diversidad biológica y distribución | Conociendo R | |||
Importancia de las condiciones bióticas y abióticas en la distribución de las especies | Teoría y práctica para explorar y crear objetos, funciones básicas y graficos de datos de precipitación, temperatura y biodiversidad en contextos geográficos | ||||
Bases de datos (GBIF) y capas de información geográfica y biológica (CONABIO, INEGI, etc.) | Teoría sobre la importación, manipulación (depuración) y exportación de datos en R para analizar la biodiversidad | ||||
Análisis de patrones de distribución geográfica en Mesoamérica | Análisis exploratorios de datos de registros puntuales y capas de información geográfica en R | ||||
Septiembre | Exploratorios multivariados (VIF, PCA, Dist. Mahalanobis) | ||||
Análisis de las características geográficas, ecológicas y su papel en la distribución de la flora y fauna Mesoamericana | Análisis de conglomerados, discriminantes y álgebra de Mapas | ||||
Qué es un sistema de Información Geográfica (SIG) y fuentes de información | Manejo de QGIS | ||||
Delimitación de las áreas de distribución, ejemplo usando CU | Manejo básico (polígonos, líneas, buffer, cortes, uniones, disolver) y Mapserver | ||||
Análisis de patrones de biodiversidad asociados a condiciones ambientales | Práctica de extracción de información a partir de las capas en QGIS y representación de información | ||||
Patrones de riqueza y endemismo -Estimación de diversidad alfa, beta y gamma -Identificación y representación de Hotspots -Identificación de áreas de endemismo |
Análisis de riqueza biológica en Mesoamérica y el Caribe (diversidad alfa) | Mapas de riqueza y calor en función de variables, uso de la calculadora (selecciónes y cálculos) | |||
Índices de biodiversidad, complementariedad e identificación de zonas de alta riqueza biológica | Dataplotly y exploración de información de capas en QGIS | ||||
Qué son las áreas de endemismo y cómo identificarlas | Estimación de áreas endemismo en México usando QGIS | ||||
Octubre |
El componente geológico en Biogeografía - Geología de México Biogeografía de la vicarianza Biogeografía ecológica Concepto nicho Limitantes bióticas Paleoclimas y refugios Pleistocénicos Regionalizaciones |
Características geológicas de México | Manejo de cartografía geológica, edafológica, ecológica especializada, Disponible en web | ||
Importancia de la vicarianza en la distribución de las especies y en la riqueza biológica | |||||
Cambios en la distribución de especies asociados al surgimiento de barreras geográficas | Práctica MaxEnt (con y sin clamping, MESS) y extrapolaciones. Análisis de congruencia entre datos genéticos y MNE | ||||
Estimación de áreas de distribución (SDM/MNE) | MNE y postprocesamiento de modelos en R | ||||
Identificación de barreras geográficas | Algoritmo de Monmonier y Barreras geográficas en R | ||||
Teoría de refugios Pleistocénicos | Delimitación de refugios Pleistocénicos | ||||
Estudio de caso | Obtener los datos de una especie Mesoamericana y las capas de información geográfica para estimar y analizar los posibles cambios en su distribución entre el último UMG y el presente | ||||
Estudio de caso | Discusión grupal sobre los resultados y su interpretación | ||||
Biogeográfía Parámétrica Fundamentos |
Introducción a la biogeografía paramétrica | ||||
Noviembre | Áreas ancestrales ¿Qué son y cómo se estiman? | Discusión de artículos uno de Monmonier y uno de Reconstrucción de estados de caracter | |||
Estudio de caso | BEAST reconstrucción de Caracteres Ancestrales y Reconstrucción de Áreas Ancestrales en RASP | ||||
Biogeografía de la conservación Genética de la conservación y del paisaje |
Conservación biológica: Metas y desafíos | ||||
Fragmentación del hábitat y su impacto en la riqueza biológica y diversidad genética | Manejo de imágenes satelitales | ||||
Uso de herramientas satelitales en la conservación de la biodiversidad | GoogleEarth engine | ||||
Pérdida de diversidad biológica y genética | |||||
Estudio de caso | |||||
Seminarios | |||||
Seminarios | |||||
Diciembre | |||||
Calificaciones Finales |