Profesor | Marcia María Ramírez Sánchez | ||
Profesor | lu ju | 15 a 18 |
Temas Selectos de Biología I
Morfometría Geométrica
La morfometría geométrica es un área de la morfometría que estudia la forma de los organismos con base en variables cuantitativas como las coordenadas de puntos anatómicos. Actualmente, este método es ampliamente utilizado debido a las ventajas que presenta sobre el uso de otras variables cuantitativas como las mediciones o funciones armónicas, ya que mantiene la disposición geométrica de los rasgos de la estructura en estudio. Adicionalmente, permite visualizar los cambios morfológicos a través de la generación de gráficos denominados gradillas de deformación.
La morfometría geométrica permite responder diferentes preguntas biológicas, relacionadas con aspectos taxonómicos, ecológicos, funcionales, evolutivos, entre otros, de los organismos. Esto la convierte en una disciplina que permite integrar las diferentes áreas del conocimiento biológico.
Objetivos:
Que el alumno comprenda los fundamentos teóricos de la morfometría geométrica.
Que aprenda a formular el tipo de preguntas biológicas que se responden con esta metodología.
Que diseñe un protocolo de investigación acorde a los objetivos a cumplir.
Que conozca el uso del software para obtener las variables de estudio y para realizar el análisis respectivo.
Que sea capaz de presentar y discutir los resultados obtenidos, generando conclusiones sobre sus implicaciones biológicas.
Metodología de la enseñanza:
Curso teórico-práctico en modalidad virtual
Se realizarán actividades sincrónicas donde se abordarán los puntos medulares de cada tema teórico y/o la demostración en el caso práctico.
Se realizarán actividades asincrónicas como lecturas, investigación bibliográfica, revisión de tutoriales en video, y la discusión de temas en foros digitales.
Se realizará un trabajo de investigación semestral que comprenderá desde la reunión y selección de imágenes, hasta la obtención y discusión de resultados.
Plataformas en línea:
Google Classroom
Google Meet
YouTube
El link para unirse a la clase el 14 de febrero a las 15:00 horas (3 pm hora del centro de México), es:
Enlace de Meet
https://meet.google.com/fej-kdev-gvr
Temario
DÍA |
TEMA |
|
Lu |
14 FEBRERO |
Presentación del curso. Definición de los criterios y porcentajes respectivos de evaluación. |
Ju |
17 FEBRERO |
Perspectiva histórica de la morfometría |
Lu |
21 FEBRERO |
Morfometría tradicional VS morfometría geométrica. Revolución-Ventajas-desventajas |
Ju |
24 FEBRERO |
Instalación/Uso del software. Serie TPS, IMP y MorphoJ |
Lu |
28 FEBRERO |
Adquisición y procesamiento de imágenes |
Ju |
3 MARZO |
Variables utilizadas en morfometría geométrica. Marcas y semimarcas |
Lu |
7 MARZO |
Conceptos básicos: Form, shape and size |
Ju |
10 MARZO |
Configuraciones de marcas |
Lu |
14 MARZO |
Práctica MakeFan-Práctica TPSDig |
Ju |
17 MARZO |
Propuesta del Proyecto de investigación a desarrollar |
Ju |
24 MARZO |
PRIMER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO (sincrónica) |
Lu |
28 MARZO |
Superposición. Análisis Generalizado de Procrustes |
Ju |
31 MARZO |
Práctica superposición, TPSRelW y CoordGen |
Lu |
4 ABRIL |
Espacios morfométricos |
Ju |
7 ABRIL |
Distancia Procrustes |
Lu |
18 ABRIL |
Proyección de espacios tangenciales |
Ju |
21 ABRIL |
Borrador de los avances del Proyecto de investigación. Asesoría. |
Lu |
25 ABRIL |
2o EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica) |
Ju |
28 ABRIL |
Deslizamiento de semimarcas |
Lu |
2 MAYO |
Práctica de protocolos y métodos de deslizamiento de semimarcas TPSRelW y CoordGen |
Ju |
5 MAYO |
Regresión y Mínimos cuadrados parciales |
Lu |
9 MAYO |
Análisis de componentes principales y de variables canónicas |
Ju |
12 MAYO |
Procrustes ANOVA |
Lu |
16 MAYO |
Entrega de los avances del Proyecto de investigación. Asesoría. |
Ju |
19 MAYO |
TERCER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica) |
Lu |
23 MAYO |
Aplicaciones de la morfometría geométrica. Dimorfismo sexual/ Biomecánica |
Ju |
26 MAYO |
Integración morfológica y modularidad /Filogenia |
Lu |
30 MAYO |
Asimetría fluctuante/ Ontogenia |
Ju |
2 JUNIO |
Entrega del manuscrito final del proyecto de investigación desarrollado. Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica) |
Lu |
6 JUNIO |
Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica) |
Ju |
9 JUNIO |
ENTREGA DE CALIFICACIÓN FINAL |
CRITERIOS DE EVALUACIÓN:
3 exámenes teóricos-prácticos parciales30%
Ejercicios en clase, reportes de prácticas, participaciones35%
Trabajo final35%
0.6 sube al siguiente entero para calcular el promedio final (excepto 5.6, que baja a 5)
Por reglamento, no hay renuncia de calificación por lo que deben darse de baja formalmente en el periodo designado para tal fin.
Sobre la entrega de reportes, tareas, y otras actividades:
- Incluir referencias bibliográficas (imagen o audiovisual).
- Si se trata de un reporte escrito, éste puede ser requerido a mano, y se revisarán la redacción y ortografía, y que no se incurra en plagio por lo cual deberán citar correctamente las referencias bibliográficas.
- Si la evidencia solicitada consiste en una imagen debe procurarse que la calidad de la misma sea óptima (iluminación, nitidez, aumento), de otra manera aunque se hayan entregado no podrán ser evaluadas. Si se trata de varias imágenes, los archivos deberán estar nombrados o numerados en el orden adecuado para su lectura y revisión, o preferentemente incluidas en un solo archivo formato PDF.
- Las actividades que se soliciten en equipo, deberán consistir de un solo archivo en el formato que consideren pertinente (PDF, DOC, PPT o documentos de Google)
- No se reciben trabajos finales para subir calificación.
- Habrá tolerancia de hasta tres semanas después de la fecha establecida para la entrega de actividades (excepto exámenes) y se califican sobre 8 si es una semana de retraso, sobre 7 si son dos, sobre 6 si son tres semanas.
- Cuenta de @ciencias.unam.mx o @gmail.com
- autorización para grabar sesiones síncronas
BIBLIOGRAFÍA BÁSICA
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Palacio, F. X., M. J. Apodaca y J. V. Crisci. 2020. Análisis multivariado para datos biológicos: teoría y su aplicación utilizando el lenguaje R. Buenos Aires: Vazquez Mazzini Editores.
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Torcida, S. & Pérez, S. I. 2012 Análisis de Procrustes y el estudio de la variación morfológica. Revista Argentina de Antropología Biológica 14, 131-141.
Toro Ibacache, V, Manriquez G, & Suazo I. 2010. Morfometría Geométrica y el Estudio de las Formas Biológicas: De la Morfología Descriptiva a la Morfología Cuantitativa. International Journal of Morphology, 28(4), 977-990
Viscosi, V. & Cardini, A. 2011. Leaf Morphology, taxonomy and geometric morphometrics: a simplified protocol for beginners. PLOS ONE 6(19): e25630. doi: 10.1371/journal.pone.0025630
Zelditch, M. L., Swiderski, D. L. & Sheets, H. D. 2012. Geometric morphometrics for biologists: a primer. 2nd edition. New York: Elsevier.