Encabezado Facultad de Ciencias
Presentación

Biología (plan 1997) 2022-2

Optativas, Temas Selectos de Biología I

Grupo 5581, 25 lugares. 4 alumnos.
Morfometría Geométrica.
Profesor Marcia María Ramírez Sánchez
Profesor lu ju 15 a 18
 

Temas Selectos de Biología I

Morfometría Geométrica

La morfometría geométrica es un área de la morfometría que estudia la forma de los organismos con base en variables cuantitativas como las coordenadas de puntos anatómicos. Actualmente, este método es ampliamente utilizado debido a las ventajas que presenta sobre el uso de otras variables cuantitativas como las mediciones o funciones armónicas, ya que mantiene la disposición geométrica de los rasgos de la estructura en estudio. Adicionalmente, permite visualizar los cambios morfológicos a través de la generación de gráficos denominados gradillas de deformación.

La morfometría geométrica permite responder diferentes preguntas biológicas, relacionadas con aspectos taxonómicos, ecológicos, funcionales, evolutivos, entre otros, de los organismos. Esto la convierte en una disciplina que permite integrar las diferentes áreas del conocimiento biológico.

Objetivos:

  • Que el alumno comprenda los fundamentos teóricos de la morfometría geométrica.

  • Que aprenda a formular el tipo de preguntas biológicas que se responden con esta metodología.

  • Que diseñe un protocolo de investigación acorde a los objetivos a cumplir.

  • Que conozca el uso del software para obtener las variables de estudio y para realizar el análisis respectivo.

  • Que sea capaz de presentar y discutir los resultados obtenidos, generando conclusiones sobre sus implicaciones biológicas.

Metodología de la enseñanza:

Curso teórico-práctico en modalidad virtual

  • Se realizarán actividades sincrónicas donde se abordarán los puntos medulares de cada tema teórico y/o la demostración en el caso práctico.

  • Se realizarán actividades asincrónicas como lecturas, investigación bibliográfica, revisión de tutoriales en video, y la discusión de temas en foros digitales.

  • Se realizará un trabajo de investigación semestral que comprenderá desde la reunión y selección de imágenes, hasta la obtención y discusión de resultados.

Plataformas en línea:

Google Classroom

Google Meet

YouTube

El link para unirse a la clase el 14 de febrero a las 15:00 horas (3 pm hora del centro de México), es:

Enlace de Meet

https://meet.google.com/fej-kdev-gvr

Temario

DÍA

TEMA

Lu

14 FEBRERO

Presentación del curso. Definición de los criterios y porcentajes respectivos de evaluación.

Ju

17 FEBRERO

Perspectiva histórica de la morfometría

Lu

21 FEBRERO

Morfometría tradicional VS morfometría geométrica. Revolución-Ventajas-desventajas

Ju

24 FEBRERO

Instalación/Uso del software. Serie TPS, IMP y MorphoJ

Lu

28 FEBRERO

Adquisición y procesamiento de imágenes

Ju

3 MARZO

Variables utilizadas en morfometría geométrica. Marcas y semimarcas

Lu

7 MARZO

Conceptos básicos: Form, shape and size

Ju

10 MARZO

Configuraciones de marcas

Lu

14 MARZO

Práctica MakeFan-Práctica TPSDig

Ju

17 MARZO

Propuesta del Proyecto de investigación a desarrollar

Ju

24 MARZO

PRIMER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO (sincrónica)

Lu

28 MARZO

Superposición. Análisis Generalizado de Procrustes

Ju

31 MARZO

Práctica superposición, TPSRelW y CoordGen

Lu

4 ABRIL

Espacios morfométricos

Ju

7 ABRIL

Distancia Procrustes

Lu

18 ABRIL

Proyección de espacios tangenciales

Ju

21 ABRIL

Borrador de los avances del Proyecto de investigación. Asesoría.

Lu

25 ABRIL

2o EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica)

Ju

28 ABRIL

Deslizamiento de semimarcas

Lu

2 MAYO

Práctica de protocolos y métodos de deslizamiento de semimarcas TPSRelW y CoordGen

Ju

5 MAYO

Regresión y Mínimos cuadrados parciales

Lu

9 MAYO

Análisis de componentes principales y de variables canónicas

Ju

12 MAYO

Procrustes ANOVA

Lu

16 MAYO

Entrega de los avances del Proyecto de investigación. Asesoría.

Ju

19 MAYO

TERCER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica)

Lu

23 MAYO

Aplicaciones de la morfometría geométrica. Dimorfismo sexual/ Biomecánica

Ju

26 MAYO

Integración morfológica y modularidad /Filogenia

Lu

30 MAYO

Asimetría fluctuante/ Ontogenia

Ju

2 JUNIO

Entrega del manuscrito final del proyecto de investigación desarrollado. Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica)

Lu

6 JUNIO

Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica)

Ju

9 JUNIO

ENTREGA DE CALIFICACIÓN FINAL

CRITERIOS DE EVALUACIÓN:

3 exámenes teóricos-prácticos parciales30%

Ejercicios en clase, reportes de prácticas, participaciones35%

Trabajo final35%

0.6 sube al siguiente entero para calcular el promedio final (excepto 5.6, que baja a 5)

Por reglamento, no hay renuncia de calificación por lo que deben darse de baja formalmente en el periodo designado para tal fin.

  • Sobre la entrega de reportes, tareas, y otras actividades:

- Incluir referencias bibliográficas (imagen o audiovisual).

- Si se trata de un reporte escrito, éste puede ser requerido a mano, y se revisarán la redacción y ortografía, y que no se incurra en plagio por lo cual deberán citar correctamente las referencias bibliográficas.

- Si la evidencia solicitada consiste en una imagen debe procurarse que la calidad de la misma sea óptima (iluminación, nitidez, aumento), de otra manera aunque se hayan entregado no podrán ser evaluadas. Si se trata de varias imágenes, los archivos deberán estar nombrados o numerados en el orden adecuado para su lectura y revisión, o preferentemente incluidas en un solo archivo formato PDF.

- Las actividades que se soliciten en equipo, deberán consistir de un solo archivo en el formato que consideren pertinente (PDF, DOC, PPT o documentos de Google)

- No se reciben trabajos finales para subir calificación.

- Habrá tolerancia de hasta tres semanas después de la fecha establecida para la entrega de actividades (excepto exámenes) y se califican sobre 8 si es una semana de retraso, sobre 7 si son dos, sobre 6 si son tres semanas.

- Cuenta de @ciencias.unam.mx o @gmail.com

- autorización para grabar sesiones síncronas

BIBLIOGRAFÍA BÁSICA

  1. Adams, D. C., Rohlf, F. J. & Slice, D. 2013. A field comes of age: geometric morphometrics in the 21st century. Hystrix the Italian Journal of Mammalogy 24, 1-24.

  2. Benítez HA, Püschel T. 2014. Modelando la varianza de la forma: Morfometría geométrica aplicaciones en Biología Evolutiva. International Journal of Morphology. 32(3):998-1008.

  3. De Luna, E. 2020. Integrando análisis morfométricos y filogenéticos: de la sistemática fenética a la morfometría filogenética. Acta Botanica Mexicana 127: e1640. DOI: 10.21829/abm127.2020.1640

  4. Gunz, P, & Mitteroecker, P. 2013. Semilandmarks: a method for quantifying curves and surfaces. Hystrix, the Italian Journal of Mammalogy 24 (1): 103-109.

  5. James, F. C. & McCulloch, C. E. 1990. Multivariate analysis in ecology and systematics: Panacea or Pandora's box. Annual Review of Ecology and Systematics 21, 129-166.

  6. Klingenberg, C.P. 2013. Cranial integration and modularity: insights into evolution and development from morphometric data. Hystrixthe Italian Journal of Mammalogy 24(1):43–58.

  7. Mitteroecker, P. & P. Gunz. 2009. Advances in Geometric Morphometrics. Evol. Biol. 36: 235-247.

  8. Palacio, F. X., M. J. Apodaca y J. V. Crisci. 2020. Análisis multivariado para datos biológicos: teoría y su aplicación utilizando el lenguaje R. Buenos Aires: Vazquez Mazzini Editores.

  9. Richtsmeier, J.T., V. B. Deleon & S. R. Lele. 2002. The promise of Geometric Morphometrics. Yearbook of physical anthropology 45: 63-91.

  10. Torcida, S. & Pérez, S. I. 2012 Análisis de Procrustes y el estudio de la variación morfológica. Revista Argentina de Antropología Biológica 14, 131-141.

  11. Toro Ibacache, V, Manriquez G, & Suazo I. 2010. Morfometría Geométrica y el Estudio de las Formas Biológicas: De la Morfología Descriptiva a la Morfología Cuantitativa. International Journal of Morphology, 28(4), 977-990

  12. Viscosi, V. & Cardini, A. 2011. Leaf Morphology, taxonomy and geometric morphometrics: a simplified protocol for beginners. PLOS ONE 6(19): e25630. doi: 10.1371/journal.pone.0025630

  13. Zelditch, M. L., Swiderski, D. L. & Sheets, H. D. 2012. Geometric morphometrics for biologists: a primer. 2nd edition. New York: Elsevier.

 


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