Biología (plan 1997) 2022-2

Segundo Semestre, Sistemática I

SISTEMÁTICA I
SEMESTRE 2022–2
GRUPO 5109 CLAVE 1204

Profesoras:

Andrea Alejandra Caballero Ochoa, correo: a.caballero.ochoa@ciencias.unam.mx

Sara Angélica Ramírez Cañas, correo: saracanas@ciencias.unam.mx

Horario:

Lunes 14:30-17:30 hrs.
Jueves 14:30-16:30 hrs.

Plataforma para las clases y actividades virtuales:

Classroom

link de la clase (acceso con cuenta institucional): https://classroom.google.com/c/NDY0NzU1OTQ5NjQz?hl=es&cjc=rrzzp3k

Código de clase: rrzzp3k

Objetivos:

1. Introducir a los estudiantes en aspectos generales de la teoría y metodología de la Sistemática biológica, por medio de la exposición y discusión de los conceptos y terminología de las principales disciplinas que la componen.
2. Estudiar los diferentes conceptos y criterios que conducen al reconocimiento y conceptualización de caracteres en Sistemática.
3. Examinar los fundamentos teóricos y prácticos de las principales corrientes de pensamiento en la Sistemática biológica: Evolucionismo, Fenética y Cladista.
4.- Conocer los aspectos generales de los Códigos de nomenclatura taxonómica en Biología.
5.-Estudiar las funciones, organización e importancia de las colecciones y museos biológicos.

Evaluación:

1. Un examen de reposición sólo si se reprobó (<5.9) o por ausencia.
2. Si se presenta al menos un parcial, no se tiene derecho a NP.
3. No hay examen final.
4. 15 minutos de tolerancia como máximo para ingresar a la clase virtual.
5. No se toma asistencia.
6. <5.9 = 5, 6 a 6.49 = 6, 6.5 a 7.49 = 7, 7.5 a 8.49 = 8, 8.5 a 9.49 = 9, 9.5 a 10 = 10.
7. 60% tres exámenes parciales, 10% proyecto semestral (4 personas) que consiste en un ensayo 4 a 6 cuartillas (tema en específico utilizando un grupo biológico), 30% tareas y prácticas en clase.

Temario:

Tema 1. La Sistemática y sus relaciones con la biología.
1.1. Sistemática y Biodiversidad.
1.2. Conceptos básicos en Sistemática.
I.2.1. Taxonomía, clasificación, clave, sistemática, nomenclatura biológica, filogenia.
I.2.2. Naturalidad, clasificación artificial, taxón natural, taxón, determinación taxonómica, jerarquía, diagnosis, descripción, carácter, estado de carácter, categoría taxonómica.

Tema 2. Historia de la Sistemática.
2.1. Sistemática tradicional y orígenes de la taxonomía.
2.2. Sistemática prelinneana.
2.3. Sistemática linneana.
2.4. El papel del esencialismo en la sistemática.
2.5. Sistemática postlinneana: evolucionismo, fenética y cladismo.

Tema 3. Conceptos de especie.
3.1. Conceptos de especie con base en el enfoque nominalista y realista.
3.2. Conceptos de especie tipológico, biológico, politípico, evolutivo, filogenético.
3.3. Comparación de los conceptos de especie a partir de su contenido teórico, universalidad y aplicabilidad.

Tema 4. Patrones de especiación.
4.1. Definición de la especiación.
4.1.2. Anagénesis y cladogénesis: polaridad y divergencia evolutiva, árboles filogenéticos.
4.2.1. Relaciones reproductivas y ontogenia.
4.3. Especiación geográfica.
4.3.1. Especiación alopátrida, aloparapátrida, parapátrida y simpátrida.
4.4. Mecanismos de aislamiento reproductor.
4.5. Hibridación e introgresión.
4.6. Patrones de evolución reticulada.

Tema 5. Caracteres.
5.1. Definición de carácter y determinación de estados de carácter.
5.2. Carácter taxonómico.
5.3. Elección de caracteres.
5.4. Clasificación de caracteres y codificación.
5.5. Compatibilidad, congruencia y consenso en Taxonomía.

Tema 6. Reconstrucción filogenética.
6.1. Holomorfología y semaforontes.
6.2. Homología y homoplasia.
6.3. Criterios de homología.
6.4. Niveles de universalidad: apomorfía y plesiomorfía.
6.5. Dendrogramas.
6.6. Grupo externo: monofilia, polifilia y parafilia.
6.7. La importancia de la cladística en el pensamiento biológico contemporáneo.

Tema 7. Evolucionismo o gradismo.
7.1. Origen y fundamentos de la taxonomía evolucionista
7.2. Ponderación de caracteres.
7.3. Construcción de árboles filogenéticos o filogramas.
7.4. Concepto de grado.
7.5. Clasificaciones evolucionistas.
7.6. Importancia del concepto de subespecie.
7.7. Críticas al evolucionismo.

Tema 8. Fenética.
8.1. Conceptos en Fenética.
8.2. Unidad taxonómica y similitud total: vectores y construcción de matrices.
8.3. Síntesis esquemática general del método en taxonomía numérica
8.4. Estimación de la similitud.
8.5. Métodos de agrupamiento y fenogramas.
8.6. Críticas y limitaciones a la taxonomía numérica.

Tema 9. Cladismo.
9.1. Origen y fundamentos de la escuela cladista.
9.2. Definición de los términos empleados en cladismo: holomorfología, semaforonte, homología, homoplasia, autapomorfia, sinapomorfia, plesiomorfia, serie de transformación.
9.3. Grupos monofiléticos, parafiléticos y polifiléticos.
9.4. Método cladístico.
9.5. Críticas al cladismo.

Tema 10. Métodos probabilísticos.
10.1. Homología molecular.
10.2. Modelos de sustitución nucleotídica.
10.3. Introducción a la inferencia filogenética por Máxima verosimilitud (ML), probabilidad a priori.
10.3.1. Bootstrap paramétrico.
10.4. Introducción a la inferencia filogenética por probabilidad a posteriori (Bayesiana).
10.5. Aplicación de la Sistemática molecular a problemas específicos.
10.6. Alcances y limitaciones de los modelos probabilísticos.

Tema 11. Clasificación y contenido de información.
11.1. Nomenclatura y códigos.
11.2. Estabilidad y comunicación. Universalidad de la clasificación.
11.3. Prioridad, homonimia y sinonimia.
11.4. Tipos y ética en Sistemática.

Tema 12. Literatura taxonómica, acervos biológicos.
12.1. Monografías, revisiones, floras, claves, catálogos, guías, atlas, descripciones y notas.
12.2. Colecciones, herbarios, museos, jardines botánicos, zoológicos y áreas protegidas.
12.3. La Sistemática en México.

Bibliografía:

Amorim, D.S. 1994. Elementos Básicos de Sistemática Filogenética. Soc. Bras. Ent. São Paulo, Brasil. 314pp.
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Crisci, J. V. y M. F. López Armengol. 1983. Introducción a la teoría y práctica de la taxonomía numérica. O. E.A. Washington, U.S.A.
Llorente, J. B. 1990. La búsqueda del Método Natural. No. 95 en Colección La Ciencia desde México. Fondo de Cultura Económica. México. 160pp.
Llorente, J. B. e I. Luna (Comps.) 1994. Taxonomía biológica. Fondo de Cultura Económica. México. 626pp.
Mayr, E. y P. D. Ashlock 1991. Principles of systematic zoology. McGrawHill. New York. 475pp.
Meacham, C. T. y T. Duncan 1989. Systematic and evolutionary biology. Software Source list. Univ. California. Berkeley: 16pp.
Morrone, J. J. 2013. Sistemática Fundamentos, métodos, aplicaciones. UNAM, México DF 505 pp.
Morrone, J.J., A. N. Castañeda-Sortibrán, B. E. Hernández-Baños & A. Luis-Martínez (eds.). 2004. Manual de prácticas de sistemática. Las Prensas de Ciencias, Facultad de Ciencias (UNAM), México, D.F., 126pp.
Morrone, J.J. 2001. Sistemática, biogeografía, evolución: Los patrones de la biodiversidad en tiempo espacio. Las prensas de Ciencias, UNAM, México, D.F.
Morrone, J.J. 2003. El lenguaje de la Cladistica. Facultad de Ciencias UNAM. 109 pp.
Papavero, N. & J. Llorente (eds) 1996. Fundamentos prácticos de taxonomía zoológica. Fac. Ciencias, UNAM. México. 400pp.
Papavero, N., J. Llorente et. al. 1995. Historia de la biología comparada (tres volúmenes). Fac. Ciencias, UNAM.
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