Encabezado Facultad de Ciencias
Presentación

Biología (plan 1997) 2022-2

Segundo Semestre, Sistemática I

Grupo 5096, 31 lugares. 27 alumnos.
Profesor Moisés Armando Luis Martínez lu 7:30 a 9:30
Profesor María Berenit Mendoza Garfias ju 7:30 a 10:30
 

En esta clase aprenderemos a interpretar y reconstruir filogenias de diferentes grupos biológicos, así como las métodologías utilizadas para contruir e interpretar otros tipos de árboles.

Correos de Profesoras:

alm@ciencias.unam.mx, berenit@ib.unam.mx, berenit@ciencias.unam.mx,

Las clases se llevarán a cabo mediante la plataforma Meet

Todo lo relevante a la clase y asignaciones (tareas, ejercicios) se hará mediante la plataforma Google Classroom.

Forma de Evaluación

  1. Cuatro exámenes parciales y ensayos ---------- 60%
  2. Tareas y prácticas ------------------ 35%
  3. Asistencia---------------------------- 5%

TOTAL ------------------------------------- 100%

Software a emplear en las prácticas:

- PAUP*,

- TNT: Tree analysis using New Technology

- MrBayes: Bayesian Inference of Phylogeny

- BEAST: Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees

- ClustalW2, MAFFT

Introducción a servidores de análisis como:

Galaxy (https://usegalaxy.org/)

CIPRES (http://www.phylo.org/)

En esta clase aprenderemos a interpretar y reconstruir filogenias de diferentes grupos biológicos, así como las métodologías utilizadas para contruir e interpretar otros tipos de árboles.

Correos de Profesoras:

alm@ciencias.unam.mx, berenit@ib.unam.mx, berenit@ciencias.unam.mx,

Las clases se llevarán a cabo mediante la plataforma Meet

Todo lo relevante a la clase y asignaciones (tareas, ejercicios) se hará mediante la plataforma Google Classroom.

Forma de Evaluación

  1. Cuatro exámenes parciales y ensayos ---------- 60%
  2. Tareas y prácticas ------------------ 35%
  3. Asistencia---------------------------- 5%

TOTAL ------------------------------------- 100%

Software a emplear en las prácticas:

- PAUP*,

- TNT: Tree analysis using New Technology

- MrBayes: Bayesian Inference of Phylogeny

- BEAST: Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees

- ClustalW2, MAFFT

Introducción a servidores de análisis como:

Galaxy (https://usegalaxy.org/)

CIPRES (http://www.phylo.org/)

Cronograma (A–Armando; B–Berenit )

Tema

Profesor

Lu

14

Feb

Presentación

A y B

Ju

17

Feb

La sistemática y su relevancia

A

Lu

21

Feb

La sistemática y su relevancia

A

Ju

24

Feb

Historia de la Sistemática

A

Lu

28

Feb

Conceptos de especie

A

Ju

03

Mar

Patrones de especiación

A

Lu

07

Mar

Patrones de especiación

A

Ju

10

Mar

Importancia de las colecciones científicas (visita virtual a colecciones)

A

Lu

14

Mar

Examen l

Ju

17

Mar

Árboles filogenéticos: qué son y cómo interpretarlos

A

Lu

21

Mar

Día Feriado

Ju

24

Mar

Árboles filogenéticos: qué son y cómo interpretarlos

A

Lu

28

Mar

Caracteres y Homología

A

Ju

31

Mar

Caracteres y Homología

A

Lu

04

Abr

Evolucionismo-Gradismo

B

Ju

07

Abr

Evolucionismo-Gradismo

B

Del 11 al 17 de Abril vacaciones de Semana Santa

Lu

18

Abr

Métodos de distancia y Fenética

B

Ju

21

Abr

Métodos de distancia y Fenética

B

Lu

25

Abr

Examen 2

Ju

28

Abr

Métodos de parsimonia y cladismo

B

Lu

02

May

Métodos de parsimonia y cladismo

B

Ju

05

May

Métodos de parsimonia y cladismo

B

Lu

09

May

Métodos Probabilísticos

B

Ju

12

May

Métodos Probabilísticos

B

Lu

16

May

Métodos Probabilísticos

B

Ju

19

May

Práctica en línea

B

Lu

23

May

Árboles de especies

B

Ju

26

May

Nomenclatura

A

Lu

30

May

Nomenclatura

A

Ju

02

Jun

Examen Parcial III

Ju

09

Jun

Entrega de calificaciones

A y B

 


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