Biología (plan 1997) 2022-1

Quinto Semestre, Taller Nivel 1

CALENDARIO DE ACTIVIDADES DEL SEMESTRE 2022-1

Taller: Respuesta inmune: de lo básico a lo aplicado

NIVEL 1

Reunión informativa: martes 24 de agosto 11 hrs contactar con anticipación a la coordinadora del taller Dra. Bertha Espinoza para obtener liga al correo: besgu@iibiomedicas.unam.mx

Horario: 11:00-14:00 martes y jueves en Zoom

Primer bloque Dr. Rafael Saavedra Durán

Martes 21 septiembre

Presentación de la rotación en al lab. Dr. Rafael Saavedra

Revisión de cálculos

Cálculos Químicos

Preparación de soluciones (Video)

Manejo de animales de laboratorio (Videos)

Jueves 23 de septiembre

Clase teórica: Toxoplasma gondii (Dr. Rafael Saavedra): Discusión de artículo

Martes 28 de septeimbre

Obtención de bazo y células de bazo (Video)

Conteo de células y cálculos (Video y práctica virtual)

Jueves 30 de septiembre

Clase teórica: Citometría de flujo (Dr. Rafael Saavedra)

Introducción al programa FlowJo: Tutorial

Martes 5 de octubre

Clase teórica: Inmunofluorescencia (Dr. Rafael Saavedra)

Inmunofluorescencia (Video)

Obtención de órganos linfoides de ratón (Video y Artículo)

Análisis de datos de inmunofluorescencia en FlowJo (1)

Jueves 7 de octubre

Análisis de datos de inmunofluorescencia en FlowJo (1) (Continuación)

Martes 12 de octubre

Reacción de PCR (Videos y práctica virtual)

Revisión de protocolo de PCR

Realización de reacción de PCR

Jueves 14 de octubre

Reacción de PCR (Práctica virtual) (Continuación)

Martes 19 de octubre

Citometría de flujo (Video)

Análisis de datos de inmunofluorescencia en FlowJo (2)

Examen de Análisis de Datos

Jueves 21 de octubre

Purificación de anticuerpos por precipitación de sulfato de amonio (Video)

Presentación de resultados del Análisis de Datos de FlowJo

Martes 26 de octubre

Calificaciones

Referencias

1. Montoya JG, Liesenfeld O. Toxoplasmosis. The Lancet (2004) 363, 1965-76.
2. Kuby Immunology (6-8th ed). WH Freeman ed. 2013-2018.
3. Reeves JP, Reeves PA. Removal of Lymphoid Organs. Current Protocols in Immunology (1991) 1.9.1-1.9.3.

Videos

1. https://www-jove-com.pbidi.unam.mx:2443/v/5030/making-solutions-in-the-laboratory
2. https://www-jove-com.pbidi.unam.mx:2443/v/10221/rodent-handling-and-restraint-techniques
3. https://www-jove-com.pbidi.unam.mx:2443/v/5161/introducing-experimental-agents-into-the-mouse
4. https://www-jove-com.pbidi.unam.mx:2443/v/10298/sterile-tissue-harvest
5. https://www-jove-com.pbidi.unam.mx:2443/v/5160/mouse-genotyping
6. https://www-jove-com.pbidi.unam.mx:2443/v/10494/flow-cytometry-fluorescence-activated-cell-sorting-facs-isolation
7. https://learn.genetics.utah.edu/content/labs/flowcytometry/
8. https://www.jove.com/v/10499/antibody-generation-producing-monoclonal-antibodies-using-hybridomas
9. https://www-jove-com.pbidi.unam.mx:2443/v/5056/pcr-the-polymerase-chain-reaction

Segundo bloque Dra. Gohar Gevorgyan

Jueves 8 de octubre y martes 4 de noviembre

Introducción: líneas de investigación en el laboratorio.

Enfermedad de Alzheimer: bases moleculares y aproximaciones terapéuticas.

Inmunoterapia de la enfermedad de Alzheimer.

Jueves 9 y martes 11 de noviembre

Antígeno; Anticuerpo; Interacción antígeno-anticuerpo

https://www.youtube.com/watch?v=DhmRfwtvtxQ

https://www.youtube.com/watch?v=ZrloJtXZw1w

https://www.youtube.com/watch?v=FquR5V4eb-4

ELISA: teoría y procedimientos

https://www.youtube.com/watch?v=fxyHClJ3sgo

https://www.youtube.com/watch?v=KrGC0ZgIDI8

https://www.youtube.com/watch?v=FmVV4e8evc8

Jueves 16 y martes 18 de noviembre

ELISA: aplicaciones (ejemplos para diferentes enfermedades)

Se revisarán también las pruebas de COVID.

Jueves 23 y martes 25 noviembre

Inmunohistoquímica: teoría y procedimientos

https://www.youtube.com/watch?v=1_bu_iWaQeE

Jueves 30 de noviembre y martes 2 diciembre

Inmunohistoquímica: revisión de varias imágenes de laboratorio y de literatura

(enfermedades neurodegenerativas)

Para cada sesión se les proporcionará material adicional

Tercer bloque Dra. Bertha Espinoza/ M. en C. Ignacio Martínez

Jueves 7 de diciembre

Presentación de línea de investigación sobre enfermedad de Chagas

Presentación del trabajo en esta parte de la rotación

Forma de trabajo en línea y en el laboratorio

Tarea de búsqueda

Martes 9 diciembre

Propiedades de las proteínas y preparación de la muestra para electroforesis

Leer los archivos PDF adjuntos: Electrophoresis guide Bio-Rad y Electroforesis

Jueves 14 diciembre

Electroforesis (SDS-PAGE) en una dimensión. Aplicaciones y revisión de artículos

Video https://www.youtube.com/watch?v=aQ00nH0kPSk

Video https://www.youtube.com/watch?v=_8xftsCIwYo

Martes 16 diciembre

Electroforesis en dos dimensiones. Aplicaciones y revisión de artículos

Leer el archivo adjunto 2D-PAGE

Conceptos básicos Video https://www.youtube.com/watch?v=FHvblg338Gg

Práctica Video https://www.youtube.com/watch?v=3wFh0z7so8w

Jueves 8 de enero

Principios del Western blot. Aplicaciones y revisión de artículos

Leer el archivo PDF adjunto WesternBlot

Conceptos básicos Video https://www.youtube.com/watch?v=Yh69yHJMWPc

Práctica Video https://www.youtube.com/watch?v=4BE0CWdfxw0

Martes 11 de enero

Análisis de Western blot on line e interpretación.

Análisis de artículo por alumnos

Jueves 13 de enero

Teoría de cultivo celular y muestra de trabajo (Video). Revisión de artículos

Leer el capitulo 1 del archivo PDF “Basic Cell Culture 3rd edition”

Teoría Video https://www.youtube.com/watch?v=T1UDMIEgEKkVideo

Práctica Video https://www.youtube.com/watch?v=h4PjGjQL_mw

Martes 18 de enero

Bioinformática en inmunología I:

Búsquedas en GenBank y alineamientos.

Revisión de artículos

Jueves 20 de enero

Bioinformática en inmunología II:

Diseño de primers mediante software libre y PCR in silico.

Revisión y análisis de geles.

Revisión de artículos

Martes 25 de enero

Bioinformática en inmunología III:

Análisis y modelado de proteínas mediante software libre.

Revisión de artículos

Jueves 27 de enero

Reunión final entrega de calificaciones

Referencias

Respuesta inmune a microorganismos:

Wang, J. et al., Cytokine storm and leukocyte changes in mild versus severe SARS-CoV2 infection….. J.Leucocyte Biol. Doi: 10.1002/JLB3covros.20272R

Felstein, S. et al., COVID 19: Immunology and Treatment options. Clin Imm. 215 (2020) 108448.

Cardoso, MS. Et al., Evasion of the immune response by Trypanosoma cruzi during acute infection. Front. Imm. Doi: 10.3389/fimmu.2015.00659.

Acevedo, G. et al., The unsolved jigsaw puzzle of the immune response in Chagas Diseases. Doi: 10.339/fmm.2018.0929.

https://www.ibiology.org/microbiology/protozoan-parasites/ Excellent videos

Vacunas

Michele A. Kutzler and David B. Weiner. DNA vaccines: ready for prime time? Nature 2008, 9:776-788.

Anna Rosa Garbuglia, Daniele Lapa, Catia Sias, Maria Rosaria Capobianchi, Paola Del Porto, The Use of Both Therapeutic and Prophylactic Vaccines in the Therapy of Papillomavirus Disease. Front Immunol. 2020, 11:188. doi: 10.3389/fimmu.2020.00188. eCollection 2020.

Geoghegan S, O'Callaghan KP, Offit PA. Vaccine Safety: Myths and Misinformation. Front Microbiol. 2020, 11:372. doi: 10.3389/fmicb.2020.00372. eCollection 2020.

Gary EN, Weiner DB. DNA vaccines: prime time is now. Curr Opin Immunol. 2020, 65:21-27. doi: 10.1016/j.coi.2020.01.006.

Review of preventative HIV vaccine clinical trials in South Africa.

Laher F, Bekker LG, Garrett N, Lazarus EM, Gray GE. Review of preventative HIV vaccine clinical trials in South Africa. Arch Virol. 2020, 14:1-14. doi: 10.1007/s00705-020-04777-2.

Aplicaciones de biología molecular en inmunología:

Harrell CR, Markovic BS, Fellabaum C, Arsenijevic A, Volarevic V. Mesenchymal stem cell-based therapy of osteoarthritis: Current knowledge and future perspectives. Biomed Pharmacother. 2019, 109: 2318. doi:10.1016/j.biopha.2018.11.099.

Hoving JC. Targeting IL-13 as a Host-Directed Therapy Against Ulcerative Colitis. Front Cell Infect Microbiol. 2018, 8: 395. doi: 10.3389/fcimb.2018.00395. Review.

Lopes A, Vanvarenberg K, Kos Š, Lucas S, Colau D, Van den Eynde B, Préat V, Vandermeulen G. Combination of immune checkpoint blockade with DNA cancer vaccine induces potent antitumor immunity against P815 mastocytoma. Sci Rep. 2018, 8: 15732. doi: 10.1038/s41598-018-33933-7.

Meyer IS, Goetzke CC, Kespohl M, Sauter M, Heuser A, Eckstein V, Vornlocher HP, Anderson DG, Haas J, Meder B, Katus HA, Klingel K, Beling A, Leuschner F. Silencing the CSF-1 Axis Using Nanoparticle Encapsulated siRNA Mitigates Viral and Autoimmune Myocarditis. Front Immunol. 2018, 9: 2303. doi: 10.3389/fimmu.2018.02303.