Encabezado Facultad de Ciencias
Presentación

Biología (plan 1997) 2022-1

Optativas, Temas Selectos de Biología I

Grupo 5206, 25 lugares. 4 alumnos.
Morfometría geométrica
Profesor Marcia María Ramírez Sánchez ju 14:30 a 17:30
Profesor Cirene Gutiérrez Blando lu 14:30 a 17:30
 

Temas Selectos de Biología I

Morfometría Geométrica

La morfometría geométrica es un conjunto de métodos para el estudio de la variación morfológica basado en variables cuantitativas. Actualmente, este método es ampliamente utilizado debido a las ventajas que presenta sobre el uso de variables como mediciones o funciones armónicas, ya que mantiene la disposición geométrica de los rasgos de la estructura en estudio. Adicionalmente, permite visualizar los cambios morfológicos a través de la generación de gráficos denominados gradillas de deformación. La morfometría geométrica se ha instaurado en distintas disciplinas, y su estrecha relación con perspectivas teóricas que enfatizan el análisis funcional y multivariado de los procesos biológicos, la convierten en parte fundamental de una revolución epistemológica en el estudio de las formas biológicas.

Objetivos:

  • Que el alumno comprenda los fundamentos teóricos de la morfometría geométrica.
  • Que aprenda a formular el tipo de preguntas biológicas que se responden con esta metodología.
  • Que diseñe un protocolo de investigación acorde a los objetivos a cumplir.
  • Que conozca el uso del software básico para obtener las variables de estudio y realizar el análisis respectivo.
  • Que sea capaz de presentar y discutir los resultados obtenidos, generando conclusiones sobre sus implicaciones biológicas.

Metodología de la enseñanza:

Curso teórico-práctico en modalidad a distancia

  • Se realizarán actividades sincrónicas de máximo hora y media de duración, donde se abordarán los puntos medulares de cada tema teórico y/o la demostración en el caso práctico.
  • Se realizarán actividades asincrónicas como lecturas, investigación bibliográfica, revisión de tutoriales en video, y la discusión de temas en foros digitales.
  • Se realizará un trabajo de investigación semestral que comprenderá desde la reunión y selección de imágenes, hasta la obtención y discusión de resultados.

Plataformas en línea:

Google Groups

Google Classroom

Google Meet

YouTube

Primera reunión

https://meet.google.com/xcv-jkxc-yew

Lunes 20 de septiembre 2021, 15:00 horas (hora del centro de México)

Temario

TEMAS

Presentación del curso. Definición de los criterios y porcentajes respectivos de evaluación.

Actividad integradora.

Perspectiva histórica de la morfometría

Morfometría tradicional VS morfometría geométrica. Revolución-Ventajas-desventajas

Instalación/Uso del software. Serie TPS, IMP y MorphoJ

Protocolos de medición: muestreo, laboratorio e instrumentos.

Variables utilizadas en morfometría geométrica. Marcas-semimarcas

Conceptos básicos: Form, shape and size

Configuraciones de marcas

Práctica MakeFan-Práctica TPSDig

Asesoría

PRIMER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO (sincrónica)

Propuesta del Proyecto de investigación a desarrollar en la materia (requisito para examen)

Superposición. Análisis Generalizado de Procrustes

Práctica superposición, TPSRelW y CoordGen

Espacios morfométricos

Distancia Procrustes

Proyección de espacios tangenciales

Asesoría. Borrador de los avances del Proyecto de investigación (requisito para examen)

2o EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica)

Tratamiento de semimarcas

Práctica de protocolos y métodos de deslizamiento de semimarcas TPSRelW y CoordGen

Análisis de componentes principales y de variables canónicas

Regresión y Mínimos cuadrados parciales

Asesoría

TERCER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica)

Entrega del primer manuscrito de los avances del Proyecto de investigación (requisito para examen)

Aplicaciones de la morfometría geométrica: Dimorfismo sexual/ Biomecánica

Integración morfológica y modularidad /Filogenia

Asimetría fluctuante/ Ontogenia

Entrega del manuscrito final del proyecto de investigación desarrollado. Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica)

Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica)

ENTREGA DE CALIFICACIÓN FINAL

CRITERIOS DE EVALUACIÓN:

3 exámenes teóricos-prácticos parciales (no hay reposiciones de exámenes) 30%

Ejercicios en clase, reportes de prácticas, participaciones 35%

Trabajo final 35%

0.6 sube al siguiente entero para calcular el promedio final (excepto 5.6, que baja a 5).

Para aprobar el curso, el promedio obtenido con cada profesora debe ser aprobatorio.

Por reglamento, no hay renuncia de calificación.

BIBLIOGRAFÍA BÁSICA

  1. Adams, D. C., Rohlf, F. J. & Slice, D. 2013. A field comes of age: geometric morphometrics in the 21st century. Hystrix the Italian Journal of Mammalogy 24, 1-24.
  2. Benítez HA, Püschel T. 2014. Modelando la varianza de la forma: Morfometría geométrica aplicaciones en Biología Evolutiva. International Journal of Morphology. 32(3):998-1008.
  3. De Luna, E. 2020. Integrando análisis morfométricos y filogenéticos: de la sistemática fenética a la mor­fometría filogenética. Acta Botanica Mexicana 127: e1640. DOI: 10.21829/abm127.2020.1640
  4. Gunz, P, & Mitteroecker, P. 2013. Semilandmarks: a method for quantifying curves and surfaces. Hystrix, the Italian Journal of Mammalogy 24 (1): 103-109.
  5. James, F. C. & McCulloch, C. E. 1990. Multivariate analysis in ecology and systematics: Panacea or Pandora's box. Annual Review of Ecology and Systematics 21, 129-166.
  6. Klingenberg, C.P. 2013. Cranial integration and modularity: insights into evolution and development from morphometric data. Hystrix the Italian Journal of Mammalogy 24(1):43–58.
  7. Mitteroecker, P. & P. Gunz. 2009. Advances in Geometric Morphometrics. Evol. Biol. 36: 235-247.
  8. Palacio, F. X., M. J. Apodaca y J. V. Crisci. 2020. Análisis multivariado para datos biológicos: teoría y su aplicación utilizando el lenguaje R. Buenos Aires: Vazquez Mazzini Editores.
  9. Richtsmeier, J.T., V. B. Deleon & S. R. Lele. 2002. The promise of Geometric Morphometrics. Yearbook of physical anthropology 45: 63-91.
  10. Torcida, S. & Pérez, S. I. 2012 Análisis de Procrustes y el estudio de la variación morfológica. Revista Argentina de Antropología Biológica 14, 131-141.
  11. Toro Ibacache, V, Manriquez G, & Suazo I. 2010. Morfometría Geométrica y el Estudio de las Formas Biológicas: De la Morfología Descriptiva a la Morfología Cuantitativa. International Journal of Morphology, 28(4), 977-990
  12. Viscosi, V. & Cardini, A. 2011. Leaf Morphology, taxonomy and geometric morphometrics: a simplified protocol for beginners. PLOS ONE 6(19): e25630. doi: 10.1371/journal.pone.0025630
  13. Zelditch, M. L., Swiderski, D. L. & Sheets, H. D. 2012. Geometric morphometrics for biologist: a primer. 2nd edition. New York: Elsevier.

 


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