Profesor | Adrián Nieto Montes de Oca |
Profesor | Rosario Mata López |
Profesor | Magali Blanca Isabel Honey Escandón |
Profesor | Jorge Damián López Caballero |
Profesor | Sara Angélica Ramírez Cañas |
Profesor | José Daniel Lara Tufiño |
SISTEMÁTICA MOLECULAR:
ENFOQUE DE ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD BIOLÓGICA
Responsable: Dr. Adrián Nieto Montes de Oca, coordinador y responsable del taller; Profesor Titular C de TC, Sistemática y biogeografía de anfibios y reptiles, Colección de Herpetología, Museo de Zoología “Alfonso L. Herrera” Facultad de Ciencias, UNAM. anietomontesdeoca@me.com
Profesores participantes:
Dra. Rosario Mata López, Profesora Titular A de TC, Sistemática y evolución de helmintos parásitos de vertebrados terrestres, Departamento de Biología Evolutiva, Facultad de Ciencias, UNAM. rmatalopez@ciencias.unam.mx
Dra. Magali Blanca Isabel Honey Escandón, Profesora de Asignatura A, Facultad de Ciencias, UNAM. mbihoney@ciencias.unam.mx
Dr. Jorge Damián López Caballero, Profesor de Asignatura B, Facultad de Ciencias, UNAM. jorgedlopezc@ciencias.unam.mx
M. en C. Sara Angélica Ramírez Cañas, Profesora de Asignatura A, Facultad de Ciencias, UNAM. saracanas@ciencias.unam.mx
M. en C. José Daniel Lara Tufiño, Profesor de Asignatura A, Facultad de Ciencias, UNAM. jdanieluah@hotmail.com
A todos los estudiantes interesados en el taller:
El link para la reunión:
meet.google.com/ppn-eeri-grr
En esa primera reunión, los profesores daremos los pormenores del curso, pero nos parece importante proporcionarles la siguiente información general:
Siguiendo las indicaciones dadas por las autoridades universitarias, las sesiones del primer nivel serán impartidas de manera virtual, atendiendo principalmente la disponibilidad de medios virtuales, por lo que se usarán los recursos digitales otorgados gratuitamente por la UNAM: Google Classroom para manejo general del curso y Meet para las sesiones virtuales. El horario en el cual se realizarán las sesiones sincrónicas es Martes y Jueves de 16:00 a 18:00 hrs. Las dos horas restantes se usarán para realizar actividades de manera asincrónica.
Este taller está dirigido a los estudiantes de biología interesados en estudiar la biodiversidad en sus diferentes niveles: molecular, morfológico y ecosistémico, teniendo como objetivo principal que los estudiantes obtengan los conocimientos esenciales para estudiar diversos grupos biológicos, atendiendo aspectos taxonómicos, filogenéticos, biogeográficos, entre otros. Por ello, con base en los grupos biológicos que los profesores del taller abordan en su grupo de trabajo y la colaboración con otros profesores que abordan el estudio de otros grupo de vertebrados e invertebrados y plantas, tratamos temas desde estudios faunísticos, revisiones taxonómicas, delimitación de especies y asociaciones biológicas como el parasitismo, donde integramos diferentes fuentes de información como la morfológica y la biología molecular. Debido a esto, nos parece importante que se traten temas enfocados a los diferentes métodos de obtención de información para su manejo y aplicación al grupo biológico que elijan para diseñar y realizar su proyecto de investigación, pero también que tengan los conocimientos necesarios para que en el futuro continúen su desarrollo académico, ya sea en programas de posgrado o se integren a algún grupo de investigación. Los profesores del taller contamos con recursos tanto materiales (material de campo, material de laboratorio, microscopios e insumos) como de financiamiento (proyectos de investigación).
Si tienes alguna duda, por favor, envía un mensaje a las siguientes direcciones de correo:
anietomontesdeoca@ciencias.unam.mx
rmatalopez@ciencias.unam.mx
Les dejamos el link de la presentación:
https://drive.google.com/file/d/1aBTmp6Sb_Zm9dgyHMZ6MH4Ed1yWqAKfJ/view?usp=sharing
PLAN DE TRABAJO Y TEMARIO DEL TALLER
NIVEL I
Fecha |
Profesor |
|
9 y 11 marzo |
Exposición de los proyectos que desarrollan los profesores. |
Todos |
16 y 18 marzo |
|
Rosario |
23 y 25 marzo |
4.1. Datos usados en Sistemática molecular. |
Jorge |
6 y 8 abril 13 y 15 abril 20 y 22 abril |
5. Generación de datos moleculares y manipulación de secuencias. 5.1. Técnicas para la obtención de secuencias de DNA (extracción, amplificación, secuenciación Sanger, secuenciación de nueva generación). 5.2. Tipos de archivos usados en análisis bioinformáticos. 5.3. Bases de datos moleculares (secuencias de nucleótidos, secuencias de proteínas, genomas). 5.4. Herramientas de búsqueda en bases de datos |
Sara |
27 y 29 abril 4 y 6 mayo 11 y 13 mayo |
|
Daniel |
18 y 20 mayo 25 y 27 mayo |
|
Rosario |
1 y 3 junio 8 y 10 junio 15 y 17 junio |
|
Magali |
22 y 24 junio |
|
Nivel II
Identificación y delimitación de especies. Biogeografía Molecular. Filogeografía. Evolución morfológica (especies crípticas). |
3. Técnicas de laboratorio en biología molecular. |
4. Aspectos teóricos y prácticos de la elaboración de un trabajo científico. |
5. Búsquedas bibliográficas electrónicas. |
6. Diseño de anteproyecto. |
Niveles III y IV
1. Desarrollo del proyecto de tesis. |
2. Trabajo de laboratorio en técnicas moleculares. |
3. Trabajo de laboratorio en técnicas de morfología. |
ACTIVIDADES:
- Cursos teórico-prácticos.
- Discusión de artículos relacionados con el temario.
- Prácticas de laboratorio sobre Técnicas de sistemática molecular.
- Prácticas de cómputo.
- Realización de búsquedas bibliográficas.
- Elaboración de redes conceptuales.
EVALUACIÓN:
- Examen por tema o grupo de temas.
- Ensayos de los artículos discutidos en clase.
- Trabajo semestral escrito.
- Trabajo semestral expuesto.
- Asistencia y participación.
Bibliografía recomendada:
AVISE, J. C. (2000). Phylogeography. The history and formation of species. Harvard University Press, Cambridge, England: pp 474.
BAUM, D. A. and SMITH, S. D. (2013). Tree Thinking: An introduction to phylogenetic biology. Roberts and Company Publishers, Greenwood Village, Colorado.
DESALLE, R. GIRIBET, G. and WHEELER, W. (2002). Molecular systematics and Evolution. Basel, Birkhauser Verlag.
EGUIARTE, L., SOUZA, V. y AGUIRRE, X. (Comps.) (2007). Ecología molecular. INE-SEMARNAT-CONABIO, México: pp 592.
HALL, B. G. (2011) Phylogenetic trees made easy: A how to manual. Sinauer. 179 pp.
HARTL, D. L. y CLARK, A. G. (2006). Principles of population genetics. Sinauer Associate, Inc. Publishers, Sunderland, Massachusetts: pp. 545.
HILLIS, D. M., MORITZ, C. and MABLE B. K. (1996). Molecular Systematics. Second Edition. Sinauer Associates.
LEMEY, P., SALEMI, M. and VANDAMME, A. M. (Eds.). (2009). The phylogenetic handbook: a practical approach to phylogenetic analysis and hypothesis testing. Cambridge University Press. 723 pp.
MATA-LÓPEZ, R., A. N. CASTAÑEDA S., E. A. GARCÍA-TREJO., M. HONEY- ESCANDÓN, M. B. MENDOZA-GARFIAS y P. AGUILAR-CERVANTES. (Coords.). (2018). Sistemática Molecular y Bioinformática. Guía práctica. Las Prensas de Ciencias, Facultad de Ciencias, UNAM. Ciudad de México. ISBN 978-607-30-0171-7. 499 p.
PAGE, R. D. M. (2003). Tangle Trees: phylogeny, coespeciation, and coevolution. The University of Chicago Press, Chicago, U.S.A.: pp 378.
WHEELER, W. D. 2012. Systematics: A Course of Lectures. Wiley‐Blackwell, Oxford, 426 pp.
YANG Z. 2014. Molecular Evolution: A Statistical Approach. Oxford University Press. 512 pp.