Biología (plan 1997) 2021-2

Optativas, Microbiología

LIGA PARA LA REUNION A LA PRIMER SESION DE LA MATERIA:

**** La presentación de la clase se llevará a cabo el Martes 2 de Marzo a las 2:30 hrs (hora del centro) a través de Goole Meet. En el Classroom asociado será en donde trabajaremos la parte práctica de la materia ****

Link para enlace a la primer reunión: https://meet.google.com/lookup/cck7thk4j4?authuser=0&hs=179

PARA EVITAR PROBLEMAS Y PODER UNIRSE FACILMENTE A LA REUNION EN EL MEET, SE LES INVITA A UTILIZAR UNA CUENTA DE CORREO CON TERMINACION @ciencias.unam.mx. CON ELLA PODRAN ACCEDER SIN RESTRICCIONES TANTO A LA REUNION COMO A LOS MATERIALES COMPARTIDOS EN EL CLASSROOM.

Atte: Horacio Villafán y Octavio Moreno

NOTA: De exisitir alguna dificultad para unirse a la reunión (asumiendo que están empleando una cuenta de correo con terminación @ciencias.unam.mx para acceder), favor de mandar un correo al profesor Octavio Moreno (su correo está abajo) para notificarle, y con gusto les manda la liga de la reunión de forma personal.

Saludos y nos vemos en clase!

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Bienvenidos a la asignatura optativa de Microbiología. Este es un curso teórico y práctico. La parte teórica será impartida por el profesor Horacio Villafán Monroy (horaciovillafan@ciencias.unam.mx) y la práctica por el profesor Octavio A. Moreno Guillén (octavio_m_g@ciencias.unam.mx).

Este curso, de acuerdo al temario de la materia, tiene como objetivos la descripción de la morfología y la fisiología de los principales grupos de microorganismos, el conocimiento de algunos métodos de estudio y de control microbiano y el aprendizaje y manejo de conceptos y vocabulario microbiológicos.

Los temas a tratar en la parte teórica son los siguientes:

I.- Introducción a la microbiología.

II.- Estructura de los microorganismos.

III.- Metabolismo microbiano.

IV.- Crecimiento microbiano.

V.- Influencia de factores ambientales en el crecimiento de los microorganismos.

VI.- Ecología microbiana.

VII.- Genética microbiana e ingeniería genética.

Las clases teóricas se llevarán a cabo por videoconferencia a través de la plataforma Zoom de la Cuaieed los días martes en un horario de 14:30 a 17:30.

Habrá un aula virtual para la parte de teoría en Moodle.

En las clases teóricas se revisarán los temas con exposición del profesor, de los alumnos y con la lectura y discusión de artículos.

La calificación final de la materia se generará tomando en cuenta un 50% para la parte de teoría y un 50% para la parte práctica. Para aprobar la materia es requisito indispensable obtener una calificación mínima de 6.0 en cada una de las partes de la materia (teoría y laboratorio) al finalizar el curso.

Los rubros a evaluar en la parte teórica del curso son los siguientes:

Exámenes parciales 40%

Trabajo semestral 40%

Participación 10%

Tareas y presentaciones 10%

En la parte de teoría se presentarán tres exámenes parciales. La suma de las tres calificaciones de los exámenes parciales se promediará para obtener la calificación correspondiente en teoría. No hay reposición de los exámenes parciales.

Si la calificación de teoría en los exámenes parciales es menor de 6 se presentará examen final. De ser este el caso, la calificación que se obtenga en el examen final será la que se asentará en el acta final. No se promediará con la calificación final de laboratorio la calificación del examen final.

Es obligatorio presentar y acreditar el trabajo semestral de la parte de teoría aunque se presente examen final.

Se aconseja que al inscribirse al curso los alumnos tengan acreditadas las materias de Biología de procariontes, Biología molecular de la célula I, II y III y también es deseable que hayan cursado la materia de Inmunología.

La bibliografía básica para la parte teórica es la siguiente:

1.- Madigan MT. et al. 2017. Brook Biology of microorganisms. 15th edition. Pearson. USA.

2. Tortora G, et al. 2016. Microbiology: An introduction. 12th edition. Pearson. USA.

3. Pelczar MJ. 2008. Microbiología. McGraw Hill. México.

Algunas páginas electrónicas:

• www.microbeworld.org
• www.commtechlab.msu.edu/sites/dlc-me/
• www.people.ku.edu/~jbrown/bugs.html
• www.ucmp.berkeley.edu/bacteria/bacteria.html
• www.bacteriamuseum.org
• www.biology4kids.com
• www.facmed.unam.mx/deptos./microbiología/index.php
• www.microbiologybook.org

En cuanto al laboratorio de la materia de Microbiología y como parte del esfuerzo del profesorado para adaptar las materias y sus temas a los tiempos de pandemia, la parte práctica de la materia de Microbiología tendrá un fuerte contenido teórico-conceptual con enfoque en el análisis in silico de las características y evolución de los microorganismos, es decir, los temas se abordarán desde un enfoque primordialmente Bioinformático. Por tanto, los alumnos serán introducidos a los análisis de secuencias, los genomas, la genómica, la metagenómica, la sistemática molecular y a la Biología Estructural (el estudio 3D de las estructuras proteicas), por nombrar algunos.

Detalles importantes sobre la parte práctica del curso:

Dada la presente situación, la parte práctica de la materia de Microbiología recibirá algunos ajustes para facilitar una mejor enseñanza de los temas abordados en la misma a través de las clases en línea. Los detalles de los mismos se darán a conocer el día de la presentación de la materia.

El principal método de enseñanza será el de clases en línea a través de la plataforma de Google Meet impartidas por el profesor. Para solicitar acceso a las sesiones, favor de escribir un correo a los profesores responsables.

Las sesiones/clases de la parte práctica no serán grabadas.

La parte práctica de la materia tiene un fuerte enfoque en organismos procariontes (Bacterias y Arqueas) debido a la practicidad de su estudio. Por ejemplo, dado su pequeño tamaño en comparación con secuencias proteicas de eucariontes unicelulares, primordialmente analizaremos secuencias de organismos procariontes.

Dado su trascendencia, el SARS-CoV-2, el virus causante de la enfermedad conocida como COVID-19 será un estudio de caso frecuente durante la parte práctica de la materia.

La participación, así como la entrega de tareas en tiempo y forma son FUNDAMENTALES para la parte práctica de la materia. Si bien no se promoverá la saturación con actividades asincrónicas, se espera un genuino compromiso del alumn@ con la materia y sus temas.

Dependiendo del desempeño del grupo, se pretende un examen por tema. Entre más exámenes haya, los mismos serán más sencillos. Al menos en la parte práctica de la materia, se pretende que sean mediante Google Forms, pero esto está sujeto a cambio.

El material de apoyo para la materia (libros, artículos) será compartido mediante Google Classroom.

De manera general, la calificación final sería producto de las siguientes contribuciones:

Tareas/Ensayos/Reportes de práctica = 20%

Participación en clase = 20%

Seminarios = 20%

Exámenes = 40%

NOTA: En la parte práctica de la materia será posible sacar una calificación de 10 sólo con el promedio de los exámenes; sin embargo, los porcentajes asignados a las otras actividades previamente descritas permiten alcanzar calificaciones aprobatorias elevadas (8,9,10). Sobre esto, el día de la presentación de la materia se darán más informes.

Referencias Bibliográficas Introductorias

Madigan MT, Bender KS, Buckley DH, Sattley WM, Stahl DA. 2017. Brock Biology of Microorganisms. 15va ed. Pearson SA.

Voet D., Voet J.G. and Pratt C.W. 2012. Principles of Biochemistry. 4a ed. Wiley.

Brown, T. A. 2006. Genomes. 3ra ed. Garland Science.

Christensen, Henrik. 2018. Introduction to Bioinformatics in Microbiology. Springer International Publishing.

Lesk, Arthur M. 2014. Introduction to bioinformatics. 4ta ed. Oxford University Press.