Biología (plan 1997) 2021-2

Quinto Semestre, Taller Nivel 1

TEMARIO DEL TALLER DE

ANTROPOLOGÍA MOLECULAR Nivel I.

Semestre 2021-2. Grupo 5393. Clave Taller: 1503. 12 créditos.

Facultad de Ciencias, UNAM.

IMPARTIDO POR LO PROFESORES

Dra. Angélica González Oliver

M. en C. Ernesto Garfias Morales

Biólogo Héctor Alessandro López Hernández

Laboratorio Antropología Molecular. Facultad Ciencias, UNAM.

EL HORARIO SERÁ DEFINIDO CON LOS ALUMNOS INSCRITOS
Y SE REQUIERE DE DOS DIAS A LA SEMANA CON TRES HORAS CADA UNO.

El objetivo general del curso es revisar los conceptos básicos de la Antropología Molecular, que es una línea de investigación relativamente reciente e interesante, y de interés para un amplio sector de la comunidad científica.

Objetivos particulares:

1. Revisar los conceptos generales de la antropología biológica y en particular de la antropología molecular, ya que actualmente son campos muy activos de investigación interdisciplinaria, especialmente en el área de la evolución de las poblaciones humanas.

2. Adquirir experiencia en revisar artículos científicos relevantes, incluyendo los más recientes, ya que son las fuentes originales de la información científica.

3. Conocer el reglamento de seguridad del Laboratorio de Antropología Molecular y las medidas preventivas en el estudio del DNA moderno.

4. Aprender el funcionamiento del material y equipo de laboratorio.

5. Aprender las metodologías que se utilizan en el análisis del DNA mitocondrial

6. Aprender a utilizar distintos softwares para el análisis estadístico del DNA mitocondrial u otros marcadores genéticos vistos en la literatura.

Contenido Temático

1. Introducción.

1.1 ¿Qué es la Antropología Molecular? Alcances y estudios.

1.2 Areas de la antropología (Antropología Biológica, Histórica, Social, Arqueología, Etnológica y Lingüísitca).

1.3 Antropología Biológica.

1.4 Paleoantropología: Homíninos.

2. Biología Molecular: Conceptos básicos del DNA

2.1 Características físico-químicas de la molécula de DNA.

2.2 Características generales del genoma mitocondrial.

2.3 Marcadores genéticos.

2.4 Marcadores denominados polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción (RFLPs en inglés).

2.5 Método de extracción de DNA.

2.6 Método de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR en inglés).

2.7 Método de electroforesis en geles de poliacrilamida.

2.8 Enzimas de restricción.

2.9 Método de análisis de restricción.

3. Estudio de las poblaciones humanas.

3.1 Origen del Hombre: Eva Mitocondrial y Adán Cromosoma “Y”.

3.2 Teoría de un solo origen vs Teoría del orIgen múltiple.

3.3 Origen del Hombre y dispersión.

3.4 Origen del Hombre en América.

3.5 Poblaciones Americanas y el estudio del Genoma Mitocondrial.

3.6 Poblaciones indígenas de México. Estudios llevados a cabo en el Laboratorio de Antropología Molecular.

4. Haplogrupos mitocondriales.

4.1 Definición de los cinco haplogrupos fundadores del mtDNA.

4.2 Distribución de los haplogrupos en América.

4.3 Haplotipos del mtDNA.

4.4 Definición y distribución de los haplotipos mitocondriales en América.

4.5 Revisión de los haplogrupos y haplotipos del DNA mitocondrial en poblaciones indígenas de orígen mesoamericano.

REQUISITOS

Leer fluidamente literatura científica en inglés, haber cursado y aprobado Biología Molecular de la Célula I, Genética, Sistemática y Estadística (en la carrera de Biología), o en el caso de la carrera de Antropología, haber cursado materias del área de Antropología Física.

Evaluación.

Fundamentalmente por la asistencia, controles de lectura,

Participación en clase.

Literatura.

1. Lehninger Albert, Nelson David and Michael Cox. Priciples of Biochememistry. Worth Publishers. New York.

2. Antonio Torroni, Theodore G. Shurr, Chi-Chuan Yang, Emöke J. E. Szathmary, Robert C. Williams, Moses S. Schanfield, Gary A. Troup, William C. Knowler, Dale N. Lawrence, Kenneth M. Weiss and Douglas C. Wallace. Native American Mitochondrial DNA Analysis indicates that the amerind and the nadene populations were founded by two independent migrations. Genetic 130: 153-162 , January 1992.

3. Antonio Torroni, Theodore Schurr, Margaret Cabell, Michael Brown, James Neel, Merethe Larsen, ... & Douglas Wallace. Asian affinities and continental radiation of the four founding Native American mtDNAs. American journal of human genetics, 53(3), 563. 1993

4. Michael D. Brown, Seyed H. Hosseine, Antonio Torroni, Hans-Jürgen Bandelt, Jon C. Allen, Theodore G. Schurr, Rosaria Scozzari, Fulvio Cruciani, and Douglas C. Wallace. MtDNA haplogroup X: An ancient link between Europe/Western Asia and North America?. Am. J. Hum. Genet. 63: 1852-1861, 1998.

5. Joseph G. Lorenz & David G. Smith. Distribution of four founding mtDNA haplogroups among native North Americans. American Journal of physical anthropology 101: 307-323, 1996.

6. Ripan S. Malhi, Jason A. Eshleman, Jonathan A. Greenberg, Deborah A. Weiss, Beth A. Schultz, Frederika A. Kaestle, Joseph G. Lorenz, Briam M. Kemp, John R. Johnson, and David Glenn Smith. The structure of diversity within New World mitochondrial DNA haplogroups: Implications for the prehistory of North America. Am. J. Hum. Genet. 70: 905-919, 2002.

7. Angélica González-Oliver, Lourdes Márquez-Morfín, José C. Jiménez and Alfonso Torre Blanco. Founding amerindian mitochondrial DNA lineages in ancient maya from Xcaret, Quintana Roo. American Journal of physical anthropology 116: 230-235, 2001.

8. Angélica González-Oliver, Ernesto Garfias-Morales, David G. Smith, & Mirsha Quinto-Sánchez. Mitochondrial DNA analysis of Mazahua and Otomi indigenous populations from Estado de México suggests a distant common ancestry. Human biology, 89(3), 195-216. 2017.

9. Angéliza González-Oliver, Dirce Pineda-Vázquez, Ernesto Garfias-Morales, Isabel De La Cruz-Laina, Luis Medrano-González, Lourdes Márquez-Morfín, & Alan Ortega-Muñoz. Genetic Overview of the Maya Populations: Mitochondrial DNA Haplogroups. Human biology, 90(4), 281-300. 2019.

10. Isabel de la Cruz-Laina, Angélica González-Oliver, Brian Kemp, Juan A. Román, David G. Smith, Alfonso Torre-Blanco. Sex identification of children sacrificed to the ancient Aztec rain gods in Tlatelolco. Current Anthropology, 49(3), 519-526. 2008

11. Huw S. Groucutt, Michael D. Petraglia, Geoff Bailey, Eleanor M. L., Scerri Ash Parton, Laine Clark‐Balzan, Richard P. Jennings, Laura Lewis, James Blinkhorn, Nick A. Drake, Paul S. Breeze, Robyn H. Inglis, Maud H. Devès, Matthew Meredith‐Williams, Nicole Boivin, Mark G. Thomas, Aylwyn Scally. Rethinking the dispersal of Homo sapiens out of Africa. Evolutionary Anthropology, 24 (4), 149-164. 2015

12. Morten E. Allenfort, et. al. Populacion Genomics of Bronze Age Eurasia. Nature, 522, 167-172. 2015

13. Ashot Margaryan, Daniel J. Lawson, Eske Willerslev, el. al. Population Genomics of the Viking World. Nature, 585. 390-396. 2020.

14. Roca-Rada X, Souilmi Y, Teixeira JC, Llamas B. Ancient DNA Studies in Pre-Columbian Mesoamerica. Genes, 11(11):1346. 2020.

15. Brenna M Henn, Teresa E Steele, Timothy D Weaver, Clarifying distinct models of modern human origins in Africa, Current Opinion in Genetics & Development, 53,148-156. 2018.

Complementaria

1. Theodore G. Schurr, Scott W. Ballinger, Yik-Yuen Gan, Judith A. Hodge, D. Andrew Merriwether, Dale N. Lawrence, William C. Knowler, Kenneth M. Weiss and Douglas C. Wallace. Amerindian mitochondrial DNAs Have rare asian mutations at high frequencies, suggesting they derived from four primary maternal lineages. Am. J. Hum. Genet. 46:613-623, 1990.
2. Ernesto Garfías Morales. (2016). Búsqueda e identificación de DNA de treponema pallidum en restos óseos humanos prehispánicos de México, que muestran lesiones sugerentes de sífilis. Tesis de Maestría. Universidad Nacional Autónoma de México.
3. Héctor A. López H. (2019). Análisis de marcadores genéticos del DNA mitocondrial en indígenas teenek que habitan la Huasteca Potosina, México. Tesis de Licenciatura. Universidad Nacional Autónoma de México.
4. Miriam J. Bravo L. (2016). Análisis del DNA mitocondrial en mayas contemporáneos y antiguos de Xcaret, Quintana Roo. Tesis de Maestría. Universidad Nacional Autónoma de México.
5. Dirce Pineda V. (2015). Estudio del DNA mitocondrial en poblaciones indígenas contemporáneas: Mixe, Mixteca y Maya del sureste de México. Tesis de Maestría. Universidad Nacional Autónoma de México.
6. Guadalupe E. Alarcón G. (2017). Revisión histórica de la investigación del DNA mitocondrial humano en Sudamérica relacionada con el poblamiento de América. Seminario de Titulación. Universidad Nacional Autónoma de México.