Encabezado Facultad de Ciencias
Presentación

Biología (plan 1997) 2021-2

Segundo Semestre, Sistemática I

Grupo 5082, 30 lugares. 13 alumnos.
Profesor Jorge Damián López Caballero ma 14:30 a 16:30
Profesor Edmundo González Santillán vi 14:30 a 17:30
 

Estimados estudiantes,

Sean bienvenidas y bienvenidos al curso de Sistemática I, materia obligatoria dentro del Plan de Estudios de la Carrera de Biología. Algunas de las preguntas que la Sistemática busca responder son: cómo surgió en el tiempo y espacio y por qué tenemos la biodiversidad actual en nuestro planeta. Asimismo, busca encontrar los patrones de cambio en ancestros y descendientes que ha producido la evolución. Busca también, organizar, nombrar y comunicar procesos y relaciones evolutivas en una forma clara, lógica y accesible para toda la comunidad científica y para cualquier otra persona interesada en la asombrosa biodiversidad.

Siendo la primera materia del Plan de Estudios de Biología que los introduce francamente a la Biología, lo que los profesores esperamos en nuestra clase es guiar a nuestros estudiantes a zambullirse en una ciencia diferente, un universo donde nosotros mismos junto con todo lo que está vivo en el planeta, somos el objeto de estudio; un universo donde otras ciencias se integran para reconstruir y responder a preguntas como las mencionadas anteriormente.

Para que todo esto camine sobre ruedas, pedimos su cooperación para que nos permitan ayudarlos y guiarlos en este maravilloso aprendizaje. Requerimos de su compromiso, su comprensión y muchas ganas de aprender. Les pedimos que nos ayuden preguntando, leyendo, escribiendo, y haciendo lo que se requiere en clase para que adquieran los conocimientos necesarios y se apacionen por la Biología. Sobre todo, estimados alumnos, que vengan con gusto y no por obligación. Les ofrecemos una clase amena y en donde el respeto mutuo es fundamental.

Finalmente, queremos decirles que estos son tiempos difíciles, para unos más que para otros, pero esperamos que la empatía y comprensión entre sus compañeros y compañeras nuca falte. La pandemia nos ha obligado a ver una parte del mundo, que, aunque obvia, no nos habíamos parado a analizar. Queremos que se cuiden mucho, que estén en contacto constante con nosotros y si requieren algún tipo de apoyo, acudan a la página de la facultad. Existen diversas formas en las que podemos apoyarlos.

Les recomendamos que de vez en cuando, entren a la siguiente página. Allí encontrarán varios enlaces de ayuda para mejorar la salud mental y física: https://sites.google.com/ciencias.unam.mx/covid19-fc/home

A continuación les compartimos el link de nuestra primera sesión, la cual se llevará a cabo por la plataforma Meet, el día martes 2 de marzo a partir de las 14:30 hrs. (como lo establece el horario de clase).

https://meet.google.com/djr-kkev-rgc

Sin más, esperamos que se animen a inscribirse en este grupo.

Los Profesores, Jorge y Edmundo

TEMARIO CALENDARIZADO

FECHA

TEMA

PROFESOR

MARZO

Martes

2

Presentación del curso

JLC y EGS

Viernes

5

Descendiente con modificación

EGS

Martes

9

Descendiente con modificación

EGS

Viernes

12

Origen de las especies

EGS

Martes

16

Origen de las especies

EGS

Viernes

19

Filogenia y el Árbol de la vida

EGS

Martes

23

Filogenia y el Árbol de la vida

EGS

Viernes

26

Conceptos de Especie

JLC

Martes

30

Asueto Académico

ABRIL

Viernes

2

Asueto Académico

Martes

6

Conceptos de Especie

JLC

Viernes

9

Especiación

JLC

Martes

13

Especiación

JLC

Viernes

17

Caracteres y Homología

JLC

Martes

20

Caracteres y Homología

JLC

Viernes

24

Caracteres y Homología

JLC

Martes

27

Examen parcial 1 (Conceptos de especie–Homología)

JLC

Viernes

30

Sistemática filogenética

EGS

MAYO

Martes

4

Cladística (parsimonia)

EGS

Viernes

7

Cladística ejercicio con TNT

EGS

Martes

11

Caracteres moleculares

EGS

Viernes

14

Alineamiento múltiple de secuencias programación dinámica

EGS

Martes

18

Construcción de Modelos de evolución molecular

EGS

Viernes

21

Máxima Verosimilitud y Soporte de ramas

EGS

Martes

25

Ejercicio IQtree y Mega

EGS

Viernes

28

Inferencia Bayesiana y MCMC

EGS

JUNIO

Martes

1

Ejercicio con MrBayes y Tracer

EGS

Viernes

4

Escuela Evolutiva / Escuela Fenética

JLC

Martes

8

Escuela Fenética

JLC

Viernes

11

Nomenclatura, códigos y literatura taxonómica

JLC

Martes

15

Nomenclatura, códigos y literatura taxonómica

JLC

Viernes

18

Colecciones Biológicas

JLC

Martes

22

Colecciones Biológicas

JLC

Viernes

25

Examen parcial 2 (Escuela Fenética–Colecciones Biológicas)

JLC

Martes

29

Entrega de calificaciones parciales

JLC y EGS

JULIO

Viernes

2

Reposiciones

JLC

Martes

6

Entrega de calificaciones finales

JLC y EGS

Viernes

9

CRITERIOS DE EVALUACIÓN

JLC

EGS

Rubro

Porcentaje

Rubro

Porcentaje

2 exámenes parciales*

60

1 ensayo

40

Participación y Tareas

20

Participación y Tareas

40

Prácticas

20

Prácticas (computadora)

20

50% del total

50% del total

* Derecho a reponer un solo examen parcial no aprobado, o el de menor calificación aprobatoria, condicionado a que se tomará en cuenta la calificación de este último.

ESCALA DE CALIFICACIONES FINALES

Rango

Final

6 a 6.5

6

6.6 a 7.5

7

7.6 a 8.5

8

8.6 a 9.5

9

9.6 a 10

10

BIBLIOGRAFÍA

Avise, J. C. (2000). Phylogeography. The history and formation of species. Harvard University Press, Cambridge, England, 474 pp.

Baum, D. A., & Smith, S. D. (2012). Tree thinking: An introduction to phylogenetic biology. Greenwood Village, Colo: Roberts.

Lipscomb, D. (1998). Basics of Cladistic Analysis. George Washington University, Washington D.C.

Morrone, J. J. (2013). Sistemática. Fundamentos, métodos, aplicaciones. Facultad de Ciencias, México, 508 pp.

Urry, L., Cain, M., Wasserman, S., Minorsky, P., Reece, J. (2017). Campbell biology. Boston: Benjamin Cummings / Pearson.

Wheeler, Q. D. (2008). The new taxonomy. Boca Raton: CRC Press.

Wheeler, W. C. (2012). Systematics: A Course of Lectures. John Wiley & Sons.

Citas de programas de computo a usar en el curso

Nguyen., L. T., Schmidt, H.A., von Haeseler, A., and Minh B.Q. (2015) IQ-TREE: A fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum likelihood phylogenies. Mol. Biol. Evol., 32:268-274. https://doi.org/10.1093/molbev/msu300

Ronquist, F., Teslenko, M., van der Mark, P., Ayres, D.L. Darling, A. Höhna, S., Larget, B., Liu, L., Suchard, M.A. and Huelsenbeck. J.P. (2012). MRBAYES 3.2: Efficient Bayesian phylogenetic inference and model selection across a large model space. Syst. Biol. 61:539-542.

Tamura, K., Peterson, D., Stecher, G., Nei, M. and Kumar S. (2011). Phylogenetic and molecular evolutionary analyses were conducted using MEGA version 5.

Willi Hennig Society. (2021). The Willi Hennig Society. https://cladistics.org/tnt/

 


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