Encabezado Facultad de Ciencias
Presentación

Biología (plan 1997) 2021-1

Optativas, Temas Selectos de Biología I

Grupo 5588, 25 lugares. 10 alumnos.
Morfometría geométrica
Profesor Cirene Gutiérrez Blando ju 14:30 a 17:30
Profesor Marcia María Ramírez Sánchez lu 14:30 a 17:30
 

Temas Selectos de Biología I

Morfometría Geométrica

La morfometría geométrica es un método para el estudio de la variación morfológica basado en variables cuantitativas como coordenadas de puntos, funciones armónicas, entre otras. Actualmente, este método es ampliamente utilizado debido a las ventajas que presenta sobre el uso de otras variables como distancias o mediciones, ya que permite visualizar los cambios morfológicos a través de la generación de gradillas de deformación, al mantener la disposición geométrica de los rasgos de la estructura en estudio. La morfometría geométrica se ha instaurado en distintas disciplinas, y su estrecha relación con perspectivas teóricas que enfatizan el análisis funcional y multivariado de los procesos biológicos, la convierten en parte fundamental de una revolución epistemológica en el estudio de las formas biológicas.

Objetivos:

  • El alumno comprenderá los fundamentos teóricos de los análisis de morfometría geométrica.

  • Tendrá conocimiento del tipo de preguntas biológicas que se responden con esta metodología.

  • Aprenderá a diseñar el protocolo de investigación más acorde a los objetivos a cumplir.

  • Conocerá el uso del software básico para obtener las variables de estudio y realizar el análisis respectivo.

  • Discutirá los resultados obtenidos y generará conclusiones biológicas.

Metodología de la enseñanza:

Curso teórico-práctico en modalidad a distancia

  • Se realizarán actividades sincrónicas de máximo hora y media de duración, donde se explicarán los puntos críticos de cada tema teórico y se hará la demostración en el caso práctico

  • Se realizarán actividades asincrónicas como lecturas, investigación bibliográfica, revisión de tutoriales en video, y la discusión de temas en foros digitales.

  • .Se generarán bases de datos individuales para el trabajo de investigación final, en el cuál los alumnos aplicarán el flujo de trabajo de la morfometría geométrica.

  • Se guiará en la interpretación biológica de las representaciones obtenidas de cambio morfológico entre y dentro de los grupos, en relación a la pregunta de investigación y a los objetivos planteados al inicio del proyecto.

Plataformas en línea:

Google Groups

Google Classroom

Google Meet

YouTube

Facebook

Requisitos

Haber cursado Bioestadística o tener conocimientos básicos de análisis estadístico

Contar con un equipo de cómputo donde pueda instalar el software especializado (gratuito)

Primera reunión

https://meet.google.com/lookup/fs6fcitp3h?authuser=0&hs=179

Lunes 21 de septiembre, 14:30 horas (hora del centro de México)

Temario

DÍA

TEMA

Lu

21 SEP

Presentación del curso. Definición de los criterios y porcentajes respectivos de evaluación.

Actividad integradora.

Ju

24 SEP

Perspectiva histórica de la morfometría

Lu

28 SEP

Morfometría tradicional VS morfometría geométrica. Revolución-Ventajas-desventajas

Ju

1º OCT

Instalación/Uso del software. Serie TPS, IMP y MorphoJ

Lu

5 OCT

Protocolos de medición: muestreo, laboratorio e instrumentos.

Ju

8 OCT

Variables utilizadas en morfometría geométrica. Marcas-semimarcas

Lu

12 OCT

Conceptos básicos: Form, shape and size

Ju

15 OCT

Configuraciones de marcas

Lu

19 OCT

Práctica MakeFan-Práctica TPSDig

Ju

22 OCT

Asesoría

Lu

26 OCT

PRIMER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO (sincrónica)

Propuesta del Proyecto de investigación a desarrollar en la materia (requisito para examen)

Ju

29 OCT

Superposición. Análisis Generalizado de Procrustes

Ju

5 NOV

Práctica superposición, TPSRelW y CoordGen

Lu

9 NOV

Espacios morfométricos

Ju

12 NOV

Distancia Procrustes

Ju

19 NOV

Proyección de espacios tangenciales

Lu

23 NOV

Asesoría. Borrador de los avances del Proyecto de investigación (requisito para examen)

Ju

26 NOV

2o EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica)

Lu

30 NOV

Tratamiento de semimarcas

Ju

3 DIC

Práctica de protocolos y métodos de deslizamiento de semimarcas TPSRelW y CoordGen

Lu

7 DIC

Regresión y Mínimos cuadrados parciales

Ju

10 DIC

Análisis de componentes principales y de variables canónicas

Lu

4 ENE

Asesoría

Ju

7 ENE

TERCER EXAMEN PARCIAL TEÓRICO-PRÁCTICO (sincrónica)

Entrega del primer manuscrito de los avances del Proyecto de investigación (requisito para examen)

Lu

11 ENE

Aplicaciones de la morfometría geométrica. Dimorfismo sexual/ Biomecánica

Ju

14 ENE

Integración morfológica y modularidad /Filogenia

Lu

18 ENE

Asimetría fluctuante/ Ontogenia

Ju

21 ENE

Modelos 3D

Lu

25 ENE

Entrega del manuscrito final del proyecto de investigación desarrollado. Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica)

Ju

28 ENE

Exposición y discusión de los proyectos de investigación. (sincrónica)

Ju

4 FEB

ENTREGA DE CALIFICACIÓN FINAL

CRITERIOS DE EVALUACIÓN:

3 exámenes teóricos-prácticos parciales 30%

Ejercicios en clase, reportes de prácticas, participaciones 35%

Trabajo final 35%

0.6 sube al siguiente entero al calcular el promedio final (excepto 5.6, que baja a 5)

Para aprobar el curso, el promedio obtenido con cada profesora deben ser aprobatorio

Por reglamento, no hay renuncia de calificación.

BIBLIOGRAFÍA BÁSICA

  1. Adams, D. C., Rohlf, F. J. & Slice, D. 2013. A field comes of age: geometric morphometrics in the 21st century.Hystrix the Italian Journal of Mammalogy 24, 1-24.

  2. Benítez HA, Püschel T. 2014. Modelando la varianza de la forma: Morfometría geométrica aplicaciones en Biología Evolutiva. International Journal of Morphology. 32(3):998-1008.

  3. De Luna, E. 2020. Integrando análisis morfométricos y filogenéticos: de la sistemática fenética a la mor­fometría filogenética. Acta Botanica Mexicana 127: e1640. DOI: 10.21829/abm127.2020.1640

  4. Gunz, P, & Mitteroecker, P. 2013. Semilandmarks: a method for quantifying curves and surfaces. Hystrix, the Italian Journal of Mammalogy 24 (1): 103-109.

  5. James, F. C. & McCulloch, C. E. 1990. Multivariate analysis in ecology and systematics: Panacea or Pandora's box. Annual Review of Ecology and Systematics 21, 129-166.

  6. Klingenberg, C.P. 2013. Cranial integration and modularity: insights into evolution and development from morphometric data. Hystrixthe Italian Journal of Mammalogy 24(1):43–58.

  7. Mitteroecker, P. & P. Gunz. 2009. Advances in Geometric Morphometrics. Evol. Biol. 36: 235-247.

  8. Palacio, F. X., M. J. Apodaca y J. V. Crisci. 2020. Análisis multivariado para datos biológicos: teoría y su aplicación utilizando el lenguaje R. Buenos Aires: Vazquez Mazzini Editores.

  9. Richtsmeier, J.T., V. B. Deleon & S. R. Lele. 2002. The promise of Geometric Morphometrics. Yearbook of physical anthropology 45: 63-91.

  10. Torcida, S. & Pérez, S. I. 2012 Análisis de Procrustes y el estudio de la variación morfológica. Revista Argentina de Antropología Biológica 14, 131-141.

  11. Toro Ibacache, V, Manriquez G, & Suazo I. 2010. Morfometría Geométrica y el Estudio de las Formas Biológicas: De la Morfología Descriptiva a la Morfología Cuantitativa. International Journal of Morphology, 28(4), 977-990

  12. Viscosi, V. & Cardini, A. 2011. Leaf Morphology, taxonomy and geometric morphometrics: a simplified protocol for beginners. PLOS ONE 6(19): e25630. doi: 10.1371/journal.pone.0025630

  13. Zelditch, M. L., Swiderski, D. L. & Sheets, H. D. 2012. Geometric morphometrics for biologist: a primer. 2nd edition. New York: Elsevier.

 


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