Física Biomédica (plan 2015) 2021-1

Ciencias Biológicas, Física Biológica

Física Biológica 2021-1

Fecha primera reunión lunes 21 de septiembre del 2020 a las 14:00 h por Google meet https://meet.google.com/qsu-hvrd-uym

o mandar correo a daniel_perez@ciencias.unam.mx

Plataformas Google meet y Google Classroom

Debido a la contingencia sanitaria el curso comprenderá de una clase síncrona a la semana (i.e. en línea) ya sea el lunes o el miércoles a las 14:00 y dos clases asíncronas (entiéndase una clase pregrabada o alguna actividad de investigación).

Evaluación

Tarea - examen 40%

Exposición (proyecto de investigación) 40%

Participación en clase (preguntas, aportaciones y lecturas) 20%

Temario

1. Introducción a la biología

   1. Aminoácidos

   2. Acidos nucleicos

   3. Membranas

2. Repaso de física estadística

   1. Postulados de la termodinámica

   2. Potenciales termodinámicos

   3. Ensambles canónicos

   4. Transiciones de fase y parámetro de orden

   5. Movimiento Browniano y difusión

3. Autoorganización de sistemas vivos

   1. Sistemas abiertos y fueras de equilibrio

   2. Autoensamblaje y autoorganización

4. La célula

   1. Descripción cuantitativa de sus componentes

   2. Señalización

5. Escalas de tiempo en los sistemas biológicos

   1. Procesos Biológicos y Bioquímicos

   2. Ciclo de la célula

   3. Evolución en el tiempo y evolución de la escala

6. Aplicación de modelos físicos a los sistemas biológicos

   1. Adhesión celular

      1. Modelo de Bell

      2. Modelo de Clucht

   2. Modelos mecánicos celulares

      1. Mecánica continua

      2. Modelos mesoscópicos (soft matter theory)

Referencias

1. Alberts, Bruce, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter. Molecular Biology of the Cell. New York: Garland Science, 2002.

2. Mohan C: Signal Transduction: A Short Overview of its Role in Health and Disease, Second edition. EMD Biosciences: 2010. San Diego, CA, United States.

3. Bleidorn, Christoph. Phylogenomics: an introduction. Springer, 2017.

4. Mikhailov, Alexander S., Ertl, Gerhard, Chemical Complexity: Self-Organization Processes in Molecular Systems, Springer International Publishing, 2017.

5. Robert Brooks Phillips, Jane Kondev, Julie Theriot. Physical Biology of the Cell, Garland Science, 2009.

6. Linda S. Hirst, Fundamentals of Soft Matter Science, CRC Press, 2012.