Física (plan 2002) 2020-2

Optativas, Temas Selectos de Física Computacional I

Primera reunión el 29 de enero de 2020 a las 14:30 en el Instituto de Investigaciones en Materiales, IIM, cubiculo T-110

Propuestas de horario.

Ma-Ju de 14:30 - 16:00

Lu-Ju de 15:30:00 17:00

Temario

Temas Selectos de Física Computacional I

(Dinámica Molecular)

Requisitos

Ecuaciones Diferenciales

Mecánica vectorial

Electromagnetismo I

Objetivo. En este curso el alumno conocerá las bases para desarrollar y entender la metodología de la Dinámica Molecular. Podrá desarrollar códigos sencillo de dinámica molecular y usar paquetes de software libre para estudiar temas de la física estadística, materia condensada blanda y biofísica, entre otros.

1. Introducción

a) Potenciales de Interacción

b) Sistemas atómicos

c) Sistemas moleculares

d) Cálculos de Potencial

2. Potenciales

a) Interacciones Intermoleculares

b) Interacciones intermoleculares

c) Campos de fuerzas

3. Metodologías de simulaciones

a) Condiciones periódicas de frontera

b) Corte de Potenciales

c) Desarrollo computacional para las condiciones periódicas

4. Dinámica Molecular

a) Sistemas atómicos

b) Solución de las ecuaciones de movimiento

c) Algoritmo de Verlet

d) Algoritmo salto de rana

e) algoritmo de predicción-corrección

f) Sistemas de moléculas rígidas

g) Moléculas no lineales

h) Moléculas lineales

i) Cálculo de las fuerzas

j) Cálculo de energías

5. Análisis de propiedades

a) Correcciones por uso del corte del potencial

b) Fluctuaciones

c) Propiedades estructurales

d) Funciones de distribución de pares

e) Perfiles de densidad

f) Coeficientes de transporte

6. aplicaciones

a) Simulaciones de fluidos

b) Modelos atómicos

c) Modelos moleculares

d) Simulaciones de interfaces

e) Sistemas biológicos

Bibliografía

Computer Simulación of Liquids

M.P Allen and D. J. Tidesley

Oxford University express, New York

Understanding Molecular Simulation

D. Frenkel and B. Smit

Academic Press.