Profesor | Pedro Eduardo Miramontes Vidal | lu mi vi | 11 a 12 | Taller de Sistemas Complejos |
Ayudante | Yoselin Alejandra Ramírez Padrón | ma ju | 11 a 12 | Taller de Sistemas Complejos |
Biología Matemática I
Presentación.
Este curso pretende acercar tanto a los estudiantes de matemáticas y física como a los de biología con la interacción moderna de la Biología con la Matemática. No se trata de un curso de matemáticas aplicadas a la biología, sino un curso en donde se va explorando el acervo matemático en busca de soluciones a problemas biológicos.
Se pide a los estudiantes conocimientos de cálculo diferencial e integral en una y varias variables y es deseable el manejo de álgebra lineal y ecuaciones diferenciales. También es deseable el conocimiento de algún lenguaje de programación. Los ejemplos y las tareas se harán sobre la plataforma del sistema operativo Linux.
Temario
Historia y antecedentes
1.1 Qué es un modelo matemático
1.2 Leonardo de Pisa
1.3 Describir vs explicar
1.4 Filotaxia
Dinámica de Poblaciones
2.1 Poblaciones con generaciones discretas.
2.2 Poblaciones con generaciones traslapadas.
2.3 Poblaciones estructuradas.
2.4 Dinámica de interacciones.
2.5 Dinámica espacial.
2.6 Modelos simples de epidemiología.
Genómica
3.1 El DNA: estructura y función
3.2 Elementos básicos de bioinformática
3.3 La estructura fractal del DNA y la dinámica caótica
3.4 Regularidades globales: la Ley de Zipf y la función GermiBeta.
Análisis no lineal de series de tiempo biológicas
4.1 Determinismo Vs aleatoriedad
4.2 Métodos de filtraje de series de tiempo
4.3 Detección de periodicidades
4.4 Reconstrucción de los atractores: dimensión fractal
Evaluación
Los estudiantes entregarán dos proyectos de investigación propia. Uno a la mitad del semestre y el segundo al final. La evaluación irá de acuerdo a la calidad tanto del tema elegidos como su profundidad y presentación. Esto le otorgará al estudiante el ochenta por ciento de su calificación. Habrá un número indeterminado de tareas cuyo peso en la evaluación será el veinte por ciento restante.
Bibliografía básica
1. Esteva, L., Falconi, M. (Eds.), Biomatemáticas, una Visión desde los Sistemas Dinámicos, México: Facultad de Ciencias, UNAM, 2002.
2. Gutiérrez - Sánchez, J.L., Sánchez - Garduño, F., Matemáticas para las Ciencias Naturales. No. 11, Aportaciones Matemáticas, México: Sociedad Matemática Mexicana, 1998.
3. Keener, J., Sneyd, J., Mathematical Physiology, New York: Springer-Verlag, 1998. Kot, M., Elements of Mathematical Ecology, Cambridge: Cambridge University Press, 2001.
4. Sánchez - Garduño, F., Miramontes, P, Gutiérrez, J.L. (Eds.), Clásicos de Biología Matemática. México: Siglo XXI-UNAM, 2002.
5. Glass, L. y Kaplan, D. Understanding Nonlinear Dynamics. Springer-Verlag, 1991.