Profesor | Benito Estrada Mena | ju | 18 a 21 | B007 |
Profesor | José Alberto Campillo Balderas | ma | 18 a 21 | S5 |
Laboratorio |
UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO
FACULTAD DE CIENCIAS
CURSO DE VIROLOGÍA 2019-1 (Grupo 5404)
Características generales del curso
Modalidad: Optativa
Horario: Martes y jueves de 6-9 pm
Cupo: 25 lugares
Número de sesiones: 31
Inicio y término de clases: martes 7 de agosto- jueves 22 de noviembre de 2018
Aula: 203, nuevo edificio (Lansbiodyt)
Método de evaluación:
4 exámenes parciales: 40%
Tareas: 15%
Práctica de laboratorio de cómputo: 20%
Presentación de un proyecto: 25%
Responsables
Dr. Benito Estrada Mena
Correo: benestrada@ciencias.unam.mx
Dr. José Alberto Campillo Balderas
Tel: 56224823 (Laboratorio de Origen de la Vida)
Correo: campillo@ciencias.unam.mx
Recomendaciones
Tener conocimientos básicos en Biología molecular, Inmunología y Evolución
Objetivo
Mostrar al estudiante los principios básicos de la Virología desde un enfoque molecular, biomédico y evolutivo.
Explicar los aspectos históricos de la virología; así como, las estrategias de replicación, ensamblaje, interacción con las células y los organismos hospederos, patogénesis y métodos de detección y control de los virus.
Describir y comprender los mecanismos evolutivos utilizados por los grupos virales más representativos de cada grupo de Baltimore (sistema de clasificación de virus que depende del tipo de genoma y la forma de replicación).
Identificar los mecanismos por los cuales aparecen los virus emergentes (de la influenza, del sida, del dengue, chikungunya, zika, entre otros) y describir su epidemiología.
Describir y discutir el uso de algunos virus como posibles herramientas para la terapia de enfermedades humanas y para el desarrollo de armas biológicas.
Introducción
Los virus son agentes infecciosos intracelulares obligados que dependen de la maquinaria enzimática de la célula hospedera para poder sintetizar sus proteínas y replicar su genoma. Muy probablemente los virus pueden infectar a todos y cada uno de los organismos de los tres dominios de la vida (Bacteria, Archaea y Eukarya) y tienen una influencia extraordinaria en procesos biogeoquímicos y geológicos de la Tierra. Se caracterizan por tener una arquitectura muy simple que puede resguardar a un genoma de DNA o de RNA en una cubierta llamada cápside y que, en algunos casos, adicionalmente presenta una membrana lipídica. Algunas características de los virus son equivalentes a las de las células como la posesión de genes, la capacidad de crear múltiples copias de sí mismos y la habilidad de evolucionar por selección natural. Sin embargo, ellos no realizan autopoiesis (por sí mismos no pueden autoreplicarse porque no tienen ribosomas ni tienen un metabolismo propio) y no comparten un ancestro común. Al mismo tiempo, algunos virus pueden causar un sinnúmero de enfermedades en diferentes organismos, entre ellos, el ser humano. El constante surgimiento de enfermedades virales emergentes en la mitad del pasado siglo (infecciones por el virus Nipah y Hendra, fiebre hemorrágica por Hantavirus, síndromes respiratorios por coronavirus, Ebola, sida, influenza, entre otros padecimientos), ha subrayado la urgencia de comprender los factores epidemiológicos, ecológicos, moleculares y evolutivos que influyen en su aparición.
Referencias
Flint et al, 2015. Principles of Virology. Vol I: Molecular Biology, Vol. II: Pathogenesis and Control, 3rd Edition, ASM Press.
Cann Alan, 2015. Principles of Molecular Virology, 6th Edition. Academic Press.
Dimmock et al, 2016. Introduction to Modern Virology, 7th Edition, Wiley-Blackwell.
Temario
Temas | Otros | Fecha | |
0 | Presentación del curso | 7-Aug | |
1 | Breve historia de la Virología y características generales de los virus | 9-Aug | |
Explorando la virósfera | |||
Infecciones virales en la antigüedad: China, Egipto, Europa y Mesoamérica | |||
Las primeras vacunas | |||
Descubrimiento de virus de plantas, de bacterias y de animales | |||
Los virus en el árbol de la vida | |||
2 | Ciclo infeccioso | 14-Aug | |
Unión y entrada de los virus a la célula | |||
Replicación y transcripción de virus de RNA y de DNA | |||
Formación y liberación de viriones | |||
3 | Métodos de estudio de los virus I | 16-Aug | |
Clases de virus de acuerdo a sus estrategias replicativas | |||
Aislamiento de los virus | |||
Métodos clásicos: plaqueo, cultivos celulares, ELISA, microscopía electrónica | |||
4 | Estructura I | 21-Aug | |
Diversidad fenotípica, función y nomenclatura de la cápside | |||
Métodos para estudiar la estructura de la cápside | |||
Tipos de cápside | |||
5 | Estructura II | Determinar el tema del proyecto | 23-Aug |
Empaquetamiento del genoma | Elegir compañero (equipo de dos personas) | ||
Capa lipídica de algunas cápsides | |||
Proteínas no estructurales de los viriones | |||
Laboratorio I | Diseñar tentativamente el proyecto | 28-Aug | |
6 | Métodos de estudio de los virus II | 30-Aug | |
Métodos moleculares: PCR y secuenciación | |||
Naipes virales | |||
7 | Mecanismos de patogénesis y control de virus I | Examen Parcial I | 4-Sep |
Patrones de infección (periodos de incubación, infecciones agudas y persistentes) | |||
Virulencia y patogénesis | |||
8 |
Laboratorio II
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Examen Parcial I |
6-Sep
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Utilizar, de preferencia, herramientas bioinformáticas aprendidas en los laboratorios para el diseño del proyecto | |||
9 | Mecanismos de patogénesis y control de virus II | 11-Sep | |
Sistema de defensa antivirales en procariontes (Modificación-Restricción) | |||
Sistema de defensa antivirales en procariontes (CRISPR) | |||
10 | Mecanismos de patogénesis y control de virus III | 13-Sep | |
Sistema de defensa antivirales en eucariontes (inmunidad innata y adaptativa) | |||
Mecanismos virales de evasión de la respuesta inmune | |||
11 | Mecanismos de patogénesis y control de virus IV | Examen Parcial II | 18-Sep |
Vacunas clásicas y recombinantes | |||
12 | Origen y evolución de los virus I |
Asesoría y elaboración de proyectos (últimos 30 minutos de la clase)
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20-Sep |
Origen de la vida en breve | |||
Hipótesis sobre el origen de los virus en Mundo del RNA | |||
Hipótesis sobre el origen regresivo de los virus | |||
Hipótesis sobre el origen de los virus como genes escapados | |||
Hipótesis sobre el origen de los virus en coevolución con entidades celulares | |||
Hipótesis sobre el origen de los virus en vesículas | |||
Paradoja de Eigen | |||
13 | Origen y evolución de los virus II | Invitado: Dr. Rodrigo Jácome (FC-UNAM) | 25-Sep |
Proteínas virales conservadas | |||
Relaciones filogenéticas profundas con proteínas virales conservadas | |||
Filogenias basadas en estructuras terciarias de proteínas virales | |||
14 | Origen y evolución de los virus III | Examen Parcial II | 27-Sep |
Filogenias basadas en genomas virales | |||
Pangenómica viral | |||
Bases moleculares de la mutación en virus | |||
Frecuencias y tasas de mutación en virus de DNA y de RNA | |||
15 | Origen y evolución de los virus IV |
Asesoría y elaboración de proyectos (últimos 30 minutos de la clase)
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2-Oct |
Consecuencias de las tasas altas de mutación | |||
Replicación propensa a errores (error prone) | |||
Recombinación y rearreglo | |||
Cuasiespecies de virus de RNA | |||
16 | Origen y evolución de los virus V |
Última asesoría y elaboración de proyectos (últimos 30 minutos de la clase)
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4-Oct |
Evolución de la arquitectura de genomas virales I: tamaño, organización y orientación | |||
Evolución de la arquitectura de genomas virales II: segmentación y genes sobrelapados | |||
Procesos de evolución del genoma: duplicación, transferencia horizontal y modulación | |||
Patrones y procesos de macroevolución viral | |||
17 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales I | Examen Parcial III | 9-Oct |
Los fagos y la decisión lisis-lisogenia | |||
Fagoterapia | |||
18 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales II | Examen Parcial III | 11-Oct |
Virus emergentes I: Arbovirus (Zika, Chikungunya, Dengue), vectores y filogeografía | Invitado: C.Dr. Luis Antonio Alonso Palomares (ENCB-IPN) | ||
19 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales III | Presentación Equipo 1 | 16-Oct |
Virus emergentes II: Emergencia y evolución del VIH y de la influenza | |||
20 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales IV | Presentación Equipo 2 | 18-Oct |
Los megavirus: ¿un nuevo paradigma en la Virología? | Presentación Equipo 3 | ||
21 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales V | Presentación Equipo 4 | 23-Oct |
Los virus oncogénicos de DNA y RNA | Presentación Equipo 5 | ||
22 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales VI |
Presentación Equipo 6
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25-Oct |
Los virus de plantas y mecanismos de RNA de interferencia | |||
Los virus de insectos como agentes comensales | |||
23 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales VII | Presentación Equipo 7 | 30-Oct |
Los virus como vectores para terapia génica | |||
DÍA INHÁBIL | 1-Nov | ||
24 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales VIII | Presentación Equipo 8 | 6-Nov |
Los virus de hongos y los fitopatógenos | |||
25 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales IX | Presentación Equipo 9 | 8-Nov |
Los virus como armas biológicas | |||
26 | Importancia biológica, médica y social de algunos grupos virales X | Presentación Equipo 10 | 13-Nov |
Metagenómica viral y el viroma humano | Presentación Equipo 11 | ||
27 | Conclusiones I | 15-Nov | |
28 | Conclusiones II | 20-Nov | |
29 | Examen parcial IV | 22-Nov |