Encabezado Facultad de Ciencias
Presentación

Biología (plan 1997) 2019-1

Cuarto Semestre, Biogeografía I

Grupo 5123, 25 lugares. 22 alumnos.
Profesor Marco Alejandro Suárez Atilano lu 18 a 20 Laboratorio de Prácticas de Biogeografía I
Profesor Gala Cortés Ramírez mi 14:30 a 17:30 Laboratorio de Prácticas de Biogeografía I
 

Biogeografía I, Cuarto Semestre (Obligatorio)

Grupo 5123

Evaluación

  • 50%, 4 exámenes
  • 50%, Miscelánea académicaà Tareas, Prácticas, Ensayos, Controles de lecturas
  • Se podrá reponer solamente un examen (el de calificación más baja)*
  • Las prácticas y tareas se entregan sólo el día indicado, si el alumno no puede entregarla ese día ÚNICAMENTE se podrá entregar la clase siguiente con un justificante (médico o de práctica de campo)
  • Redondeo de calificación al 0.5 (>6), excepto si la calificación es reprobatoria, 5.99 es 5
  • No se pondrá NP si se presenta el primer examen parcial.
  • Calificación irrenunciable. No se pondrá NA ni NP si la calificación es aprobatoria.
  • No se aceptan alumnos de otros grupos ni se guarda la calificación
  • Equipos de máximo 3 personas

Fecha

Día

Tema

Profesor

Actividades

Agosto 6

Lunes

Presentación del curso

G y M

8

Miércoles

Introducción a la biogeografía (definición, subdivisiones, relación con otras ciencias, panorama general).

G

Actividad de grupo: “Encontrando puentes”

Actividad de grupo II: “Inscripción” del grupo a la página del curso

13

Lunes

Historia de la biogeografía (I): de los orígenes a Darwin. Historia de la biogeografía (II): de Darwin a la actualidad.

M

15

Miércoles

Historia de la biogeografía (I): de los orígenes a Darwin. Historia de la biogeografía (II): de Darwin a la actualidad.

Taller: ¿Cómo citar? ¿Cómo buscar información?

M

G y M

Actividad de grupo: Taller

20

Lunes

Áreas de distribución. Tipos de áreas.

G

Tarea: Ejemplos de patrones de distribución. Uno de cada uno.

22

Miércoles

Áreas de distribución. Modelos de nicho ecológico

Práctica Obtención de datos

M

M y G

Práctica: Obtención de datos de distribución geográfica

27

Lunes

Áreas de Endemismo, relaciones entre áreas

M

Entrega Tarea: Ejemplos de patrones de distribución

29

Miércoles

Práctica: Modelado de nicho

M y G

Práctica: MAXENT. Se utilizarán los datos obtenidos en GBIF

Artículo. Lozier, J. D., Aniello, P., Hickerson, M. J. 2009. Predicting the distribution of Sasquatch in wetern North America: anything goes with ecological niche modelling. Journal of Biogeography 39:1623-1627

Septiembre 3

Lunes

EXAMEN I

M y G

5

Miércoles

Biogeografía Cuantitiva (I) Estimación de la riqueza de especies Diversidad alfa, beta y gamma. Índices de similitud y análisis de agrupamientos.

Regionalización

G

Entrega práctica MAXENT

Clase-Práctica: Biogeografía cuantitativa. Regionalización de la Península de Yucatán.

10

Lunes

Regionalización

Biogeografía Ecológica.

G

Artículo. Holt, B. G., et al. 2013. An Update of Wallace´s Zoogeographic Regions of the World. Science 339:74-78

12

Miércoles

Fundamentos y métodos de la biogeografía del equilibrio insular (I) Práctica: Equilibrio insular clásica vs. contemporánea.

G

Entrega práctica regionalización Península de Yucatán

Artículo. Partes seleccionadas. Warren BH, Simberloff D, Ricklefs RE, Aguilee R, Condamine FL, Gravel D, Morlon H, Mouquet N, Rosindell J, and Casquet J. 2015. Islands as model systems in ecology and evolution: prospects fifty years after MacArthur‐Wilson. Ecology Letters 18:200-217.

Práctica. Biogeografía y evolución de lagartos Gallotia

17

Lunes

Fundamentos y métodos de la biogeografía del equilibrio insular.

G

Cont. Práctica. Biogeografía y evolución de lagartos Gallotia

19

Miércoles

Oscilaciones climáticas

G

Entrega práctica Biogeografía y evolución de lagartos Gallotia

24

Lunes

Teoría de refugios pleistocénicos.

G

Artículo. Leite YL, Costa LP, Loss AC, Rocha RG, Batalha-Filho H, Bastos AC, Quaresma VS, Fagundes V, Paresque R, and Passamani M. 2016. Neotropical forest expansion during the last glacial period challenges refuge hypothesis. Proceedings of the National Academy of Sciences:201513062.

Actividad de grupo: Cuestionario Refugios Pleistocénicos

26

Miércoles

Macroecología

Reglas ecogeográficas y macroecología

M

Entrega tarea: cuestionario Refugios

Pedir material práctica Dispersalismo

Octubre 1

Lunes

EXAMEN II

M y G

Artículos:

-Mitchell K. J. et al. 2014. Ancient DNA reveals elephant birds and kiwi are sister taxa and clarifies ratite bird evolution.

Science 344: 898-900

-Palma-Ramírez, A., et al. 2014. Panbiogeography of Santa María Amajac region, Hidalgo, México. Revista Mexicana de Biodiversidad 85: 1228-1234

3

Miércoles

Dispersionismo:

Historia y conceptos básicos. Determinación de centros de origen y rutas de dispersión.

Biogeografía filogenética (I). Reglas de la desviación y la progresión corológica. Biogeografía filogenética (II). Centro de origen y ruta de dispersión

M

Artículo. Morrone, J. J. 2002. El espectro del dispersalismo: De los centros de origen a las áreas ancestrales. Rev. Soc. Entomol. Argent. 61:1-14.

8

Lunes

Práctica Dispersionismo

M y G

Tarea opcional punto extra: Biogeografía filogenética Abejas

Práctica Dispersalismo. Elaboración de Historias Biogeográficas de taxones bajo la lógica Dispersalista

10

Miércoles

Tectónica de placas y deriva continental

Pambiogeografía. Conceptos generales y métodos

M

Discusión y entrega de controles de lectura de artículos DNA antiguo con Ratites y Pambiogeografía con fósiles

15

Lunes

Pambiogeografía. Ejercicio

M

Entrega práctica-tarea: Dispersalismo

17

Miércoles

Biogeografía cladista (I). Conceptos básicos. Método de Rosen. Método de componentes.

M

Ejercicios para entregar: Análisis de componentes

22

Lunes

Biogeografía cladista (II). Método de parsimonia de Brooks.

G

Ejercicios para entregar: BPA

24

Miércoles

Biogeografía cladista (III). Método de árboles reconciliados.

G y M

Ejercicios para entregar-repaso

29

Lunes

EXAMEN III

G y M

Entrega tarea opcional punto extra: Biogeografía filogenética Abejas

31

Miércoles

Biogeografía Paramétrica

Reloj Molecular

G

Artículo. Ho, S. Y. (2014). The changing face of the molecular evolutionary clock. Trends in ecology & evolution, 29(9), 496-503.

Práctica: “Comprendiendo la estimación de parámetros por máxima verosimilitud”

Noviembre 5

Lunes

Filogeografía (I). Conceptos básicos. Métodos exploratorios basados en árboles y redes y métodos estadísticos basados en Coalescencia

M

Artículos para Práctica de filogeografía comparada:

-Hernández-Canchola, G., León-Paniagua, L., 2017. Genetic and ecological processes promoting early diversification in the lowland Mesoamerican bat Sturnira parvidens (Chiroptera Phyllostomidae). Journal of Biogeography 114:334-34

-Arteaga, M. C. Piñeero, D., Eguiarte, L.E., Gasca, J. & Medellín, R.A. 2012. Genetic structure and diversity of the nine-banded armadillo in Mexico. Journal of Mammalogy, 93, 547–559

-Suárez-Atilano, M., Burbrink, F.T. & Vázquez-Domínguez, E. 2014. Phylogeographical structure within Boa constrictor imperator across the lowlands and mountains of Central America and Mexico. Journal of Biogeography, 41, 2371–2384.

7

Miércoles

Práctica consolidación de conceptos

M y G

Práctica: Historia Biogeográfica de los cardenales

12

Lunes

Biogeografía de la conservación

M

14

Miércoles

Filogeografía (II) filogeografía comparada

G

Práctica Filogeografía comparada

Lecturas en línea para discusión

19

Lunes

ASUETO ACADÉMICO

21

Miércoles

EXAMEN IV

28

Miércoles

Reposiciones

3

Lunes

Entrega de Calificaciones finales

  • La fecha de las clases y exámenes están sujetos a cambios con previo aviso
  • Las actividades y número de tareas pueden modificarse a lo largo del semestre. Las tareas deben entregarse el día marcado con “Entrega de Tarea”
  • Los controles de lectura y la discusión de artículos se realizarán los días marcados con “Artículo”. Los artículos se discutirán a lo largo o después de la clase. El control de lectura se realizará a principio de clase, si llegan después no podrán entregarlo.
  • Todas las tareas contendrán un apartado de “Referencias”.
    • Las referencias deben ser de literatura científica (artículos, libros, o páginas web especializadas)
    • Copiar y pegar texto de páginas web, o copiar textualmente secciones de artículos o libros es plagio. QUEDA ABSOLUTAMENTE PROHIBIDO. De notarlo la tarea tendrá calificación reprobatoria.
    • Si no sabes citar textos o cómo obtener la información, pide ayuda a tus profesores.
  • Las mayoría de las prácticas podrás encontrarlas en la página del curso (al menos con una semana de anticipación) y debes traerlas impresas el día indicado en el plan de trabajo.

 


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