Presentación del grupo 6163 - 2010-2.

La reunión para definir horario será el miercoles 3 de febrero a la 1 pm en el Edificio Tlahuizcalpan, planta baja, salón 008. Se propone 2 sesiones semanales de 2 horas cada una. Informes srhidalgo@yahoo.com

Presentación:

La conclusión del Proyecto del Genoma Humano, en conjunto con los avances tecnológicos, ha marcado una nueva era en la genética humana y ha revolucionado las estrategias de investigación y del cuidado de la salud. Actualmente, los investigadores en el área biomédica están en posibilidad de realizar estudios del genoma completo, identificar los genes y sus variantes, analizar la expresión de los mismos y conocer la función y estructura tridimensional de las proteínas, todo ello encaminado a mejorar las estrategias de diagnóstico, tratamiento y prevención de las enfermedades. Sin embargo, lo anterior requiere de la participación de profesionales que trabajen vinculando la genética humana y las matemáticas a través de evaluar y desarrollar métodos y modelos que permitan describir fenómenos biológicos afines al tema.

Por lo tanto, el objetivo de impartir esta materia es dar a conocer a los estudiantes de las carreras de matemáticas, actuaría y ciencias de la computación los conceptos básicos sobre los que descansa la genética humana; así como introducir los métodos estadísticos más comunes utilizados en este campo desde un punto de vista teórico y práctico.

Temario:

Introducción a la estadística y al paquete estadístico R

Introducción a la genética

• DNA, alelos, locus, genotipos y fenotipos
• Leyes de Mendel
• Herencia Mendeliana y multifactorial
• Ley de Hardy-Weinberg

• Heredabilidad
• Análisis de segregación

• Recombinación y distancias genéticas
• Modelo y parámetros
• Paramétrico
  • Algoritmo de Elston y Stuart
  • Método de LOD score
• No-parámetrico
  • Alelos idénticos por estado y descendencia
  • Método de pares de hermanos
  • Extensiones del método de pares de hermanos
  • Rasgos cuantitativos

• Introducción a la genética de poblaciones
  • Equilibrio de Hardy-Weinberg
    • Pruebas para medir desviaciones
  • Desequilibrio de ligamiento
    • Concepto
    • Medidas
• Pruebas estadísticas
  • Pruebas no-paramétricas
  • Regresión lineal y logística
• Estratificación poblacional
  • Control Genómico
  • Estimación de mezcla (admixture)
• Estudios de asociación basados en familias
  • HRR (Haplotype Relativa Risk)
  • TDT (Transmision disequilibrium Test)

• Falconer DS y Mackay TFC. Introduction to Quantitative Genetics. Prentice Hall, 1996.
• Weir BS. Genetic Data Analysis II: Methods for Discrete Population Genetic Data. Sinauer Associates Inc. 1996.
• Lange K. Mathematical and Statistical Methods for Genetic Analysis. Springer, 1997.
• Thompson EA. Statistical Inference from Genetic Data on Pedigree. NSF-CBMS Regional Conference Series in Probability and Statistics, Volume 6, 2000.
• Editado por Rao DC y Province MA. Genetic Dissection of Complex Traits. Academic Press, 2001.
• Thomas DC. Statistical Methods in Genetic Epidemiology. Oxford University Press, 2004.
• Siegmund D y Yakir B. The Statistics of Gene Mapping. Springer Science +Business Media, LLC 2007.
• Ziegler A y König IR. A Statistical Approach to Genetic Epidemiology. Wiley-VCH, 2008.
• Foulkes AS. Applied Statistical Genetics with R: for population-based association studies. Springer Science +Business Media, LLC 2009.

Dinámica y forma de evaluación:

El curso consistirá en presentaciones por parte del profesor titular y de los alumnos, así como ejercicios prácticos utilizando R y programas de cómputo propios de esta esta área. Semanalmente se proporcionarán lecturas complementarias que introduzcan a los alumnos a los diferentes temas. La forma de evaluar será a través de las presentación y se propone un trabajo o examen final.

Prerequisitos:

Estadística I y II