Facultad: De Ciencias, UNAM.
Plan de estudios: Biología, plan 1997
Clave:1201
Modalidad: Asignatura fundamental
Área: Biología Molecular de la Célula
Créditos:10
Horas por semana: 3 de teoría y 3 de laboratorio.
Horas por semestre: 48 de teoría y 48 de laboratorio.
Profesores: Dr. Alejandro Marché Cova almarche@prodigy.net.mx
Bio. Felipe Alcantara Sánchez felipus_sp@yahoo.com.mxMetas:
Formar al alumno en el estudio objetivo y sistemático de la célula desde una perspectiva bioquímico-molecular, de manera que adquiera los conocimientos necesarios que le permitan continuar con los siguientes cursos relacionados y además ser un profesionista exitoso.
Reforzar los conceptos teóricos a través de prácticas de bioquímica y de biología molecular, con las que el alumno también se familiarizará, reconocerá y apreciará la importancia del trabajo de laboratorio en las áreas de especialización de la biotecnología, fisiología, bioquímica y biología molecular de la célula.
Metodología de la enseñanza:
Curso teórico-práctico.
Evaluación del curso:
La parte teórica consistirá de 5 exámenes parciales (60%), trabajo de investigación semestral (20%), participación en clase (10%), tareas (5%), asistencia (5%). Dos exámenes ordinarios (opcionales para subir calificación y obligatorios si se reprobó algún parcial y/o el primer ordinario).
La parte de laboratorio será detallada al inicio del curso. Cuando el alumno tenga práctica de campo deberá avisar al menos con una semana de anticipación.
La calificaciòn final consistirà de: 45% Teorìa + 45% Laboratorio + 10% Departamental
Temario (reordenado del oficial de acuerdo a las necesiddes del curso):
I.- LA UNIDAD FUNDAMENTAL DE LA BIOLOGIA: LA CÉLULA
I.1.- Ciencia y Método.
I.2.- Teoría celular.
I.3.- Características generales de la célula.
I.4.- Origen y evolución celular. Arquea, Bacteria y Eucaria.
I.5.- Organización y estructura de virus, procariontes y eucariontes.Examen: Primer Parcial
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II.- ESTUDIO BIOQUÍMICO DE LA CÉLULA
II.1.- Enlaces químicos.II.1.- Covalentes
II.2.- No covalentes
II.2.- El agua.II.2.1.- Propiedades fisicoquímicas de la molécula de agua. Formación de puentes de hidrógeno.
II.2.2.- Interacción del agua con moléculas polares y no polares. Efecto hidrofóbico.
II.2.3.- Producto iónico del agua.
II.3.- Equilibrio ácido-base.II.3.1.- Conceptos de pH, amortiguadores y pI.
II.3.2.- Ácidos y bases. Teorías de Arrhenius, Brônsted–Lowry y Lewis.
Examen: Segundo Parcial
Laboratorio: Ver manual de prácticas sección de introducción (pp. 25-28) y Práctica 1 (pp. 29-38) --- o ---
II.4.- Proteínas.
II.4.1.- Aminoácidos: propiedades fisicoquímicas y clasificación.
II.4.2.- Estructuras: primaria, secundaria, supersecundaria, terciaria, cuaternaria y quinaria.
II.4.3.- Clasificación.
II.4.4.- Funciones.
II.4.5.- Métodos de purificación y análisis
Actividad extra clase (sala Ixtli).
Examen: Tercer Parcial.
Laboratorio: Prácticas 2 (pp. 39-43), 3 (pp. 45-50) y 4 (pp. 51-62). --- o ---
II.5.- Enzimas.
II.5.1.- Generalidades.
II.5.2.- Clasificación.
II.5.3.- Conceptos estructurales importantes en la catálisis. Zimógeno, cofactores,
coenzimas, sitio activo, grupo catalítico, orientación orbital, mecanismos.
II.5.3.- Cinética química y tipos de reacciones.
II.5.4.- Energía libre de activación
II.5.5.- Cinética enzimática. Ecuaciones de Michaelis-Menten, Lineweaver-Burk y Eadie-
Hofstee. Inhibiciones reversibles (competitiva, acompetitiva y no competitiva) e
irreversibles. Alosterismo y regulación de la actividad enzimática.
Examen: Cuarto_Parcial.Laboratorio: Práctica 5 (pp. 65-68).
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III.- ESTUDIO MOLECULAR DE LA CÉLULA
III.1.- Ácidos nucleicosIII.1.1.- Bases purínicas y pirimídinicas.
III.1.2.- Ribosa y Desoxirribosa.
III.1.3.- Nucleósidos.
III.1.4.- Nucleótidos.
III.1.5.- Polinucleótidos.III.2.- Generalidades del DNA.
III.2.1.- Leyes de Chargaff.
III.2.2.- Modelo de Watson-Crick
III.2.3.-.Conformaciones: A, B, Z y otras.
III.2.4.- Propiedades fisicoquímicas.
Actividad extra clase.
III.3.- Organización y contenido del DNA en organismos y organelos.
III.3.1.- Virus.
III.3.2.- Procariontes.
III.3.3.- Eucariontes: Nucleosoma, solenoide, cromatina, cromosoma.
III.3.4.- Organelos.
III.3.5.- La paradoja del valor C.III.3.6.- Secuencias de copia única, alta y medianamente repetidas.
III.3.7.- Exones e intrones.
III.4.- Los flujos de información en los sistemas biológicos.III.4.1.- Elementos genéticos móviles: transposones, provirus, plásmidos.
III.4.2.- Transferencia genética horizontal: transducción, conjugación y transformación.
III.4.3.- El dogma central de la biología molecular
III.4.4.- Características generales del código genético.
III.4.5.- Mutaciones
III.5.- Clasificación de las mutaciones.III.5.1.- Puntuales: Transicionales, transversionales, inserción y supresión.
III.5.2.- No puntuales.
III.5.3.- Silenciosas.
III.5.4.- De sentido equivocado.
III.5.5.- Sin sentido.
III.5.6.- Teoría neutralista de la evolución.
III.6.- Replicación del DNA.III.6.1.- Conservadora
III.6.2.- Semiconservadora
III.6.3.- Dispersora.
III.6.4.- Etapas del proceso.
III.7.- Trascripción del DNA.III.7.1.- Tipos de RNA y RNA-Polimerasas
III.7.2.- Etapas del proceso.
III.7.3.- Modificaciones post-transcripcionales.
III.7.4.- Inhibidores.
III.8.- Traducción: biosíntesis de proteínas.III.8.1.- Ribosomas.
III.8.2.- Etapas del proceso.
III.8.3.- Inhibidores.
III.9.- Regulación de la expresión de genes y sus implicaciones evolutivas.III.9.1.- Comparación de secuencias de proteínas y ácidos nucleicos a lo largo de la escala
filogenética.
III.9.2.- Genes ortólogos y parálogos.
III.9.3.- Genes de diferenciación y de rutina.
III.9.4.- Genes de segmentación y homeóticos.
III.10.- Tecnología del DNA.III.10.1.- FISH.
III.10.2.- PCR
III.10.3.- Secuenciación.
III.10.4.- Clonación.
Examen: Quinto Parcial.
Laboratorio: Prácticas: 6 – 11 (pp. 69-119)
--- o ---Bibliografía:
1.- Alberts, Bruce, et. al. Molecular Biology of the Cell. 2nd ed., GarlandPubs., New York, 1989.
2.- Branden, Carl, John Tooze. Introduction to Protein Structure.Garland Pubs., New York, 1991.
3.- Brown, T. A. Essential Molecular Biology. A Practical Approach. IRL Press, 1992.
4.- Darnell, James, et. al. Molecular Cell Biology, 2nd. ed., ScientificAmerican Books, New York,
1990.
5.- DeDuve, C. 1991. Blueprint for a Cell: the Nature and Origin of Life. Neil Patterson,
BurlingtonNC.
6.- Drlica, K. Understanding DNA and Gene Cloning. John Wiley, New York, 1992.
7.- Gilbert, H. F. Basic Concepts in Biochemistry. McGrow-Hill, New York, 1992.
8.- Grierson, D. y S. N. Covey.1988.Plant Molecular Biology. 2ed.
9.- Kornberg, A. y T.A.Baker. 1991. DNA Replication.2ed. W.H. Freeman New York.
10.- Lehninger, Albert L., et. al. Principles of Biochemistry. 2nd ed., Worth Pubs. New York, 1993.11.- Lewin, Benjamin. 1990. Genes IV, OxfordUniversity Press.
1 12.- Mathews, Christopher K. y K. E. van Holde. Biochemistry.
1 13.- Benjamin/Cummings, Redwood City, California, 1990.
1 14.- Rawn, J. David. Biochemistry. Neil Patterson, Englewood Cliffs, N. J., 1989.
1 15.- Stryer, Lubert. Biochemistry, 3rd ed., W. H. Freeman, New York, 1988.
1 16.- Selander, R. K. y A. G. Clark. 1991. Evolution at the Molecular Level. Sinauer, New York.
1 17.- Voet, Donald y Judith G. Voet. Biochemistry. John Wiley, New York, 1990.
1 18,- Voet, D. y J. G. Voet. 1991. Biochemistry. 1991 Supplement. John Wiley, New York, 1991.
1 19.- Watson, James D., et.al. 1992. Recombinant DNA, 2nd ed. Scientific American Books,
New York.
2 20.- Watson, James D., et. al. 1987. Molecular Biology of the Gene, 4th ed. Benjamin/
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2 21.- Woese, C. R. 1990. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains
Archaea, Bacteria and Eucharya. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87: 4576-4579.