El contenido del curso está orientado a presentar una perspectiva global de las rutas metabólicas fundamentales de manera comparada. Para lograr esto, el estudiante desarrollará habilidades analíticas que le permitan comprender y explicar las transformaciones de materia y de energía que ocurren el los seres vivos.
A lo largo del curso, el temario será cubierto según la secuencia detallada que será entregada el primer día de clases.
La evaluación en teoría estará basada en los resultados de 4 exámenes parciales (80%), la entrega de tareas obligatorias (10%) y la presentación de un trabajo final (10%).
El alumno tendrá derecho a presentar reposición de no más de un examen y para presentar el examen final deberá haber entregado todas las tareas y presentar el trabajo final.
La calificación final estará dividida por partes iguales entre Teoría y Laboratorio, siendo requisito para aprobar la materia tener ambas calificaciones mayores o iguales a 6.
BIBLIOGRAFÍA PARA EL CURSO
BIOLOGÍA MOLECULAR DE LA CÉLULA II
Felipe Alcántara Sánchez, M. en C.
Las lecturas obligatorias están numeradas y con este número está indicado en el campo de Observaciones del Temario, la fecha en la cual el alumno deberá haber leído y hecho el análisis de la lectura indicada.
LECTURAS OBLIGATORIAS
L1.Lehninger AL, DL Nelson & MM Cox (1993) Cáp. 1 “La lógica molecular de la vida” Principios de Bioquímica, 2ª ed. Omega, Barcelona, p. 3-20
L2.Srere P (1994) Complexities of metabolic regulation, Trends in Biological Sciences 19, Editorial, Dec. 1994.
L3.Lee A (2000) Membrane lipids: It’s only a phase, Current Biology 10:R377-R380.
L4.Marx J (2001) Caveolae: A once-elusive structure gets some respect, Science 294:1862-1865.
L5.León Cázares JM & MTE Flores Rodríguez (1995) Origen y evolución de las membranas celulares, Boletín de Educación Bioquímica 14(4):140-149.
L6.Mitchell P (1962) Metabolism, transport, and morphogenesis: Which drives which?, Journal of General Microbiology 29:25-37.
L7.Remize R, JL Roustan, JM Sablayrolles, P Barre & S Dequin (1999) Glycerol overproduction by engineered Saccharomyces cerevisiae wine yeast strains leads to substantial changes in by-product formation and to a stimulation of fermentation rate in stationary phase, Applied and Environmental Microbiology 65(1):143-149.
L8.Zárate A, R Saucedo & L Basurto (2007), El tejido adiposo: una nueva glándula del sistema endocrino, Ciencia 58(1):69-76
L9.Saier Jr MH. Peter Mitchell and his chemiosmotic theories. ASM News 63(1):13-21.
L10.Blankenship RE, (2002) Ch. 1 “The basic principles of photosynthetic energy storage”, Molecular mechanisms of photosynthesis, Blackwell Science, p. 1-10
L11.Sato TK, M Overduin &SD Emr (2001) Location, location, location: Membrane targeting directed by PX domains, Science 294:1881-1885.
L12.Linka M & APM Weber (2005) Shuffling ammonia between plastids and mitochondria during photorespiration, Trends in Plant Science 10(10):461-465.
BIBLIOGRAFÍA BÁSICA
·Lehninger AL, DL Nelson & MM Cox (1993) Principios de Bioquímica, 2ª ed. Omega, Barcelona.
·Mathews CK, KE van Holde & KG Ahern (2002) Bioquímica 3ª ed. Pearson Educación, Madrid, España.
·Nicholls DG & SJ Ferguson. 2002. Bioenergetics 3. Academic Press. London, UK.
Blankenship RE. 2002. Molecular mechanisms of photosynthesis. Blackwell Science. Oxford, UK.
TEMARIO DE CLASES DE TEORÍA. BMC2, FELIPE ALCÁNTARA SÁNCHEZ | |||||
TEMA | CONTENIDO | Fecha propuesta | Fecha de realización | Observaciones | |
Introducción | Objetivos de la Bioquímica. Habilidades para el aprendizaje y métodos bioquímicos | 17-ago | |||
II.1.1 | Conceptos básicos y diseño del metabolismo. | Transferencia de energía de autótrofos a heterótrofos. | 17-ago | L1 | |
Tipos de rutas metabólicas. | |||||
II.1.2 | Conceptos de anabolismo y catabolismo y su interrelación. | ||||
Mecanismos de regulación metabólica | 24-ago | L2 | |||
II.2.1 | El papel del ATP como moneda energética de la célula. | Conceptos termodinámicos básicos. | |||
II.2.2 | El ciclo del ATP y la bioenergética de la célula. | 31-ago | |||
II.2.3 | Reacciones de óxido-reducción. | ||||
II.2.4 | El poder reductor y el control del metabolismo energético en la célula. | 7-sep | Problemas 1 | ||
Repaso sobre biomoléculas | Grupos funcionales y propiedades. Estructura y funciones de carbohidratos, lípidos y proteínas. Propiedades físicas de las biomoléculas | 7-sep | Investigación del alumno | ||
PRIMER EXAMEN PARCIAL | 14-sep | ||||
I | LA MEMBRANA PLASMÁTICA | ||||
I.1.1 | Bicapas de lípidos | Estructura de los lípidos polares y composición de las membranas biológicas. Micelas, monocapas, bicapas. | 21-sep | L3, L4 | |
I.2 | Proteínas y carbohidratos membranales. | Proteínas intrínsecas y extrínsecas de membrana. Dominios transmembranales de las proteínas.Determinantes antigénicos membranales. | |||
I.3.1 | La Membrana del eritrocito | La membrana del eritrocito como sistema modelo. | 28-sep | L5 | |
I.3.2 | Anclaje del citoesqueleto. El esqueleto de membrana | 28-sep | |||
I.4.1 | Mecanismos de transporte a través de las membranas plasmáticas | Ósmosis. Movimiento del agua y regulación del volumen celular. | |||
I.4.2 | Transporte pasivo de solutos. | ||||
I.4.3 | Transporte activo de iones. Canales iónicos. | ||||
I.4.4 | Cotransporte: symport y antiport. | ||||
I.4.5 | Transporte de macromoléculas y partículas: endo y exocitosis. | 5-oct | L6 | ||
I.4.6 | Fusión de membranas, entrada de virus a las células. | ||||
SEGUNDO EXAMEN PARCIAL | 5-oct | ||||
II.3.1 | Estructura química y función de los carbohidratos | Monosacáridos, disacáridos, polisacáridos. | 12-oct | Investigación del alumno | |
II.4.1 | Glicólisis y fermentación. | La glicólisis. | |||
II.4.2 | Metabolismo fermentativo en bacterias. Fermentaciones láctica, etanólica, acética, mixta | 12-oct | |||
II.4.3 | La importancia de distintos tipos de fermentación en los procesos biotecnológicos. | 26-oct | L7 | ||
II.7.1 | Vía colateral de las pentosas | La generación de poder reductor para reacciones biosintéticas. | 26-oct | ||
II.8.1 | Gluconeogénesis y metabolismo del glucógeno. | Gluconeogénesis. | |||
II.8.2 | Síntesis y degradación del glucógeno. Regulación hormonal. | 31-ago | |||
II.5.1 | Ciclo de Krebs. | La descarboxilación del piruvato. | |||
II.5.2 | El ciclo de los ácidos tricarboxílicos. | 31-oct | Problemas 2 | ||
II.9.1 | Metabolismo de los ácidos grasos. | Estructura de los ácidos grasos. Triglicéridos, almacenamiento de energía. | |||
II.9.2 | Beta oxidación. | ||||
II.9.3 | Biosíntesis de los ácidos grasos. | 9-nov | L8 | ||
TERCER EXAMEN PARCIAL | 16-nov | Examen a casa | |||
II | MITOCONDRIAS Y CLOROPLASTOS. GENERACIÓN Y ALMACENAMIENTO DE ENERGÍA METABÓLICA. | ||||
II.6.1 | Estructura mitocondrial y bioenergética | Estructura y compartimentación de las mitocondrias. | Investigación del alumno | ||
II.6.2 | Estructura y composición de la membrana interna. | Investigación del alumno | |||
II.6.3 | La hipótesis del acoplamiento quimiosmótico | 16-nov | L9 | ||
II.6.4 | Transporte de electrones. | ||||
II.6.5 | Fosforilación oxidativa. | 16-nov | |||
II.10.1 | Estructura de los cloroplastos y fotosíntesis. | Estructura y compartimentación de los cloroplastos. | 23-nov | Investigación del alumno | |
II.10.2 | Las clorofilas y los pigmentos accesorios. Interacción con la luz. | 23-nov | L10 | ||
II.10.3 | Las fases luminosa y oscura de la fotosíntesis. | ||||
II.10.4 | El flujo de electrones y la fosforilación del ADP. | ||||
II.10.5 | La fijación del CO2. Ciclo de Calvin. | ||||
II.10.6 | Fotorrespiración. Plantas C3 y C4. | 23-nov | |||
II.11 | El transporte de proteínas a las mitocondrias y cloroplastos. | 30-nov | L11 | ||
II.12.1 | Metabolismo del nitrógeno | Ciclo del nitrógeno en la biosfera. | |||
II.12.2 | Fijación biológica del nitrógeno. | ||||
II.12.3 | Ciclo de la urea. Transaminación y desaminación. | 30-nov | L12 | ||
CUARTO EXAMEN PARCIAL | 30-nov | ||||
II.13.1 | Perspectiva evolutiva del metabolismo. | Las posibles relaciones evolutivas entre distintas vías metabólicas. | Exposiciones | ||
II.14 | Integración del metabolismo energético en animales. | Exposiciones | |||
PRIMERA VUELTA (REPOSICIÓN) | |||||
SEGUNDA VUELTA (FINAL) |