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Presentación del grupo 5240 - 2008-1.

El contenido del curso está orientado a presentar una perspectiva global de las rutas metabólicas fundamentales de manera comparada. Para lograr esto, el estudiante desarrollará habilidades analíticas que le permitan comprender y explicar las transformaciones de materia y de energía que ocurren el los seres vivos.

A lo largo del curso, el temario será cubierto según la secuencia detallada que será entregada el primer día de clases.

La evaluación en teoría estará basada en los resultados de 4 exámenes parciales (80%), la entrega de tareas obligatorias (10%) y la presentación de un trabajo final (10%).

El alumno tendrá derecho a presentar reposición de no más de un examen y para presentar el examen final deberá haber entregado todas las tareas y presentar el trabajo final.

La calificación final estará dividida por partes iguales entre Teoría y Laboratorio, siendo requisito para aprobar la materia tener ambas calificaciones mayores o iguales a 6.

Las fechas de los exámenes serán indicadas en la primera semana de clases.

BIBLIOGRAFÍA PARA EL CURSO

BIOLOGÍA MOLECULAR DE LA CÉLULA II

Felipe Alcántara Sánchez, M. en C.

Las lecturas obligatorias están numeradas y con este número está indicado en el campo de Observaciones del Temario, la fecha en la cual el alumno deberá haber leído y hecho el análisis de la lectura indicada.

LECTURAS OBLIGATORIAS

L1.Lehninger AL, DL Nelson & MM Cox (1993) Cáp. 1 “La lógica molecular de la vida” Principios de Bioquímica, 2ª ed. Omega, Barcelona, p. 3-20

L2.Srere P (1994) Complexities of metabolic regulation, Trends in Biological Sciences 19, Editorial, Dec. 1994.

L3.Lee A (2000) Membrane lipids: It’s only a phase, Current Biology 10:R377-R380.

L4.Marx J (2001) Caveolae: A once-elusive structure gets some respect, Science 294:1862-1865.

L5.León Cázares JM & MTE Flores Rodríguez (1995) Origen y evolución de las membranas celulares, Boletín de Educación Bioquímica 14(4):140-149.

L6.Mitchell P (1962) Metabolism, transport, and morphogenesis: Which drives which?, Journal of General Microbiology 29:25-37.

L7.Remize R, JL Roustan, JM Sablayrolles, P Barre & S Dequin (1999) Glycerol overproduction by engineered Saccharomyces cerevisiae wine yeast strains leads to substantial changes in by-product formation and to a stimulation of fermentation rate in stationary phase, Applied and Environmental Microbiology 65(1):143-149.

L8.Zárate A, R Saucedo & L Basurto (2007), El tejido adiposo: una nueva glándula del sistema endocrino, Ciencia 58(1):69-76

L9.Saier Jr MH. Peter Mitchell and his chemiosmotic theories. ASM News 63(1):13-21.

L10.Blankenship RE, (2002) Ch. 1 “The basic principles of photosynthetic energy storage”, Molecular mechanisms of photosynthesis, Blackwell Science, p. 1-10

L11.Sato TK, M Overduin &SD Emr (2001) Location, location, location: Membrane targeting directed by PX domains, Science 294:1881-1885.

L12.Linka M & APM Weber (2005) Shuffling ammonia between plastids and mitochondria during photorespiration, Trends in Plant Science 10(10):461-465.

BIBLIOGRAFÍA BÁSICA

·Lehninger AL, DL Nelson & MM Cox (1993) Principios de Bioquímica, 2ª ed. Omega, Barcelona.

·Mathews CK, KE van Holde & KG Ahern (2002) Bioquímica 3ª ed. Pearson Educación, Madrid, España.

·Nicholls DG & SJ Ferguson. 2002. Bioenergetics 3. Academic Press. London, UK.

Blankenship RE. 2002. Molecular mechanisms of photosynthesis. Blackwell Science. Oxford, UK.

TEMARIO DE CLASES DE TEORÍA. BMC2, FELIPE ALCÁNTARA SÁNCHEZ
TEMA CONTENIDO Fecha propuesta Fecha de realización Observaciones
Introducción Objetivos de la Bioquímica. Habilidades para el aprendizaje y métodos bioquímicos 17-ago
II.1.1 Conceptos básicos y diseño del metabolismo. Transferencia de energía de autótrofos a heterótrofos. 17-ago L1
Tipos de rutas metabólicas.
II.1.2 Conceptos de anabolismo y catabolismo y su interrelación.
Mecanismos de regulación metabólica 24-ago L2
II.2.1 El papel del ATP como moneda energética de la célula. Conceptos termodinámicos básicos.
II.2.2 El ciclo del ATP y la bioenergética de la célula. 31-ago
II.2.3 Reacciones de óxido-reducción.
II.2.4 El poder reductor y el control del metabolismo energético en la célula. 7-sep Problemas 1
Repaso sobre biomoléculas Grupos funcionales y propiedades. Estructura y funciones de carbohidratos, lípidos y proteínas. Propiedades físicas de las biomoléculas 7-sep Investigación del alumno
PRIMER EXAMEN PARCIAL 14-sep
I LA MEMBRANA PLASMÁTICA
I.1.1 Bicapas de lípidos Estructura de los lípidos polares y composición de las membranas biológicas. Micelas, monocapas, bicapas. 21-sep L3, L4
I.2 Proteínas y carbohidratos membranales. Proteínas intrínsecas y extrínsecas de membrana. Dominios transmembranales de las proteínas.Determinantes antigénicos membranales.
I.3.1 La Membrana del eritrocito La membrana del eritrocito como sistema modelo. 28-sep L5
I.3.2 Anclaje del citoesqueleto. El esqueleto de membrana 28-sep
I.4.1 Mecanismos de transporte a través de las membranas plasmáticas Ósmosis. Movimiento del agua y regulación del volumen celular.
I.4.2 Transporte pasivo de solutos.
I.4.3 Transporte activo de iones. Canales iónicos.
I.4.4 Cotransporte: symport y antiport.
I.4.5 Transporte de macromoléculas y partículas: endo y exocitosis. 5-oct L6
I.4.6 Fusión de membranas, entrada de virus a las células.
SEGUNDO EXAMEN PARCIAL 5-oct
II.3.1 Estructura química y función de los carbohidratos Monosacáridos, disacáridos, polisacáridos. 12-oct Investigación del alumno
II.4.1 Glicólisis y fermentación. La glicólisis.
II.4.2 Metabolismo fermentativo en bacterias. Fermentaciones láctica, etanólica, acética, mixta 12-oct
II.4.3 La importancia de distintos tipos de fermentación en los procesos biotecnológicos. 26-oct L7
II.7.1 Vía colateral de las pentosas La generación de poder reductor para reacciones biosintéticas. 26-oct
II.8.1 Gluconeogénesis y metabolismo del glucógeno. Gluconeogénesis.
II.8.2 Síntesis y degradación del glucógeno. Regulación hormonal. 31-ago
II.5.1 Ciclo de Krebs. La descarboxilación del piruvato.
II.5.2 El ciclo de los ácidos tricarboxílicos. 31-oct Problemas 2
II.9.1 Metabolismo de los ácidos grasos. Estructura de los ácidos grasos. Triglicéridos, almacenamiento de energía.
II.9.2 Beta oxidación.
II.9.3 Biosíntesis de los ácidos grasos. 9-nov L8
TERCER EXAMEN PARCIAL 16-nov Examen a casa
II MITOCONDRIAS Y CLOROPLASTOS. GENERACIÓN Y ALMACENAMIENTO DE ENERGÍA METABÓLICA.
II.6.1 Estructura mitocondrial y bioenergética Estructura y compartimentación de las mitocondrias. Investigación del alumno
II.6.2 Estructura y composición de la membrana interna. Investigación del alumno
II.6.3 La hipótesis del acoplamiento quimiosmótico 16-nov L9
II.6.4 Transporte de electrones.
II.6.5 Fosforilación oxidativa. 16-nov
II.10.1 Estructura de los cloroplastos y fotosíntesis. Estructura y compartimentación de los cloroplastos. 23-nov Investigación del alumno
II.10.2 Las clorofilas y los pigmentos accesorios. Interacción con la luz. 23-nov L10
II.10.3 Las fases luminosa y oscura de la fotosíntesis.
II.10.4 El flujo de electrones y la fosforilación del ADP.
II.10.5 La fijación del CO2. Ciclo de Calvin.
II.10.6 Fotorrespiración. Plantas C3 y C4. 23-nov
II.11 El transporte de proteínas a las mitocondrias y cloroplastos. 30-nov L11
II.12.1 Metabolismo del nitrógeno Ciclo del nitrógeno en la biosfera.
II.12.2 Fijación biológica del nitrógeno.
II.12.3 Ciclo de la urea. Transaminación y desaminación. 30-nov L12
CUARTO EXAMEN PARCIAL 30-nov
II.13.1 Perspectiva evolutiva del metabolismo. Las posibles relaciones evolutivas entre distintas vías metabólicas. Exposiciones
II.14 Integración del metabolismo energético en animales. Exposiciones
PRIMERA VUELTA (REPOSICIÓN)
SEGUNDA VUELTA (FINAL)

 


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