Presentación del grupo 5109 - 2007-2.

TEMARIO DE BIOGEOGRAFÍA I.

SEMESTRE 2007-2

PROFESORES

LEONOR OÑATE OCAÑA

VICENTE RODRÍGUEZ

OBJETIVO:Ofrecer al alumno un panorama general y actualizado de los estudios de la distribución geográfica de los organismos. Éste será ofrecido desde un punto de vista histórico del desarrollo de la ciencia y las ideas y métodos que la han sustentado. Se pretende que el alumno conozca:a) El desarrollo histórico de la biogeografía hasta la actualidad.b) La terminología y conceptos básicos en la biogeografíac) Las principales corrientes de pensamiento dentro de la biogeografía moderna.d) Los métodos de análisis biogeográfico más usuales, incluyendo los paquetes de software más usados.e) Se familiarice con la literatura de esta disciplina

EVALUACION

Asistencia (mínimo 80%)Participación (lecturas y prácticas): 30%Exámenes: Examen 1(Temas 1 a 5) y Examen 2 (Temas 6 a 8) con valor del 30% Examen departamental, 10%Trabajo semestral a entregar en tres etapas, 30%IMPORTANTE: EL ALUMNO INSCRITO EN EL GRUPO DEBERÁ DARSE DE BAJA ANTES DEL LÍMITE QUE ESTABLECE LA FACULTAD PARA BAJAS, PUES TODO ESTUDIANTE INSCRITO EN ACTAS RECIBIRÁ UNA CALIFICACIÓN.MÉTODO:El desarrollo teórico de la clase se compone de exposiciones sobre el tema y discusiones por cuenta del profesor y de los estudiantes. Los alumnos elegirán uno de los artículos señalados en el calendario adjunto y entregarán el día señalado un trabajo impreso sobre la lectura realizada. Durante la clase de laboratorio se elaborará una base con datos obtenidos por cada estudiante de acuerdo a su preferencia. Los alumnos procesarán esos datos durante el curso para desarrollar un trabajo semestral que se entregará durante la parte final del semestre.

TRABAJO SEMESTRAL:

Deberá ser una investigación totalmente original. El alumno elegirá un grupo (familia, orden) de seres vivos y/o una región para describir y explicar su distribución aplicando la metodología de la Biogeografía.En la primera fecha de entrega, el alumno deberá exponer su proyecto en un grado de avance suficiente para determinar qué se conoce del grupo y/o región y qué preguntas básicas se pueden plantear con sus datos. El Proyecto se entregará por escrito y se expondrá. Deberá incluir:

En la segunda entrega se expondrán los trabajos con un avance del 80%. Esto implica el desarrollo de la metodología para el análisis de los datos y los resultados con una discusión. Además de la exposición, deberá entregarse por escrito incluyendo: Título, autor, resumen breve, introducción, objetivos, método, resultados, discusión y bibliografía.Se evaluará el avance para que hagan sus correcciones finales y entreguen en la tercera fecha de entrega el trabajo final. Los tres mejores trabajos serán publicados en la nueva serie de publicaciones de la Facultad sobre trabajos de los estudiantes. Los autores de estos tres trabajos serán merecedores de un punto extra sobre la calificación final.

TEMARIO:

1. INTRODUCCIÓN A LA BIOGEOGRAFÍA.Breve exposición sobre el concepto dedistribución de seres vivos y el campo de estudio de la biogeografía.

1.1 Definición de Biogeografía y su campo de estudio.

1.1.1 Subdivisiones de la Biogeografía según distintos puntos de vista

1.1.2Relación con otras Ciencias.

1.1.3Panorama general de la Biogeografía en la actualidad.

2. HISTORIA DE LA BIOGEOGRAFÍA.

Breve exposición sobre el desarrollo de esta disciplina en los periodos de la historia y la época moderna

2.1 El período pre-darwiniano

2.1.1 Las primeras explicacionesde la distribución geográfica

2.1.2 Linneo y el concepto de centro de origen

2.1.3 Ley de Buffon

2.1.4 Contribuciones de de Candolle y otros pre-darwinianos

2.2Influencia de la teoría evolutiva por selección natural.

2.2.1 Contribuciones de Darwin y Wallace

2.2.2 Desarrollo de las teorías holarticistas y el papel de la dispersión en las escuelas tradicionales

2.3El período moderno

2.3.1 La teoría de la Tectónica de placas y sus efectos en la distribución de la biota

2.3.2 El papel de la Sistemática en la reconstrucción biogeográfica

2.3.3 El desarrollo de la biogeografía de islasy teoría de refugios

3. AREOGRAFÍA

3.1 Áreas de distribución

3.2 Áreas de endemismo

3.3 Clasificación biogeográfica, regionalización y provincias bióticas

4. BIOGEOGRAFÍA ECOLÓGICA

4.1 Fundamentos y métodos de la biogeografía del equilibrio insular

4.2 Teoría de Refugios pleistocénicos

4.3 Métodos de ordenación y clasificación: índices de similitud biótica, análisis de agrupamientos, análisis de componentes principales.

4.4 NTSYS

4.5 La Biogeografía de islas en la conservación de áreas naturales

5. BIOGEOGRAFÍA.DISPERSIONISTA

5.1 Conceptos de extinción, colonización, inmigración y su repercusión en biogeografía

5.2 El concepto de barrera, filtro “sweepstake”, corredores y dispersión

5.3 Endemismo y cosmopolitarismo, dauna, flora, horofauna y cenocrón

5.4. Criterios para la determinación de centros de origen

5.5Los patrones de especiación en la biogeografía dispersionista. Contribuciones de Matthew, Mayr, Simpson y Darlington, métodos de la biogeografía dispersionista

6. BIOGEOGRAFÍA FILOGENÉTICA

6.1 La importancia de la reconstrucción filogenética en Biogeografía

6.2La escuela de Hennig-Brundin. Reglas de progresión corológica y regla de desviación

7.PANBIOGEOGRAFÍA

7.1 Conceptos básicos: trazo individual, generalizado, línea de base, centro de masa y nodo

7.2 Método de Page y Craw. Teoría de grafos y compatibilidad de trazos

7.3 Prácticas en PHYLIP y PAUP

7.4 La Panbiogeografía y la conservación

8. BIOGEOGRAFÍA CLADÍSTICA

8.1 Conceptos básicos: cladograma taxonómico de áreas, cladograma resuelto de áreas y cladograma general de áreas

8.2 Análisis de componentes: supuestos 1 y 2

8.3 Análisis de parsimonia de Brooks: supuesto 0

8.4 Component y Hennig868.5 PAE8.6 La Biogeografía cladística y la conservación

CALENDARIO DE ACTIVIDADES:

Lunes: 12 de febrero. CITA: Laboratorio de Biogeografía a las 8.00 de la mañana

Confirmación de Inscripciones, firma de tiras, presentación de los profesores. Breve descripción del temario y modo de evaluación.Tarea: Traer en una hoja : 1.foto infantil con nombre, número de cuenta y correo electrónico, 2. Área de la Biología a la que te gustaría dedicarte profesionalmente y 3. Grupo y región que elegirás para el trabajo semestral.Daremos tiempo para que se regularicen las inscripciones: bajas, altas, etc. Nos veremos el lunes 19 para iniciar formalmente el curso. IMPORTANTE: si estás inscrito en actas, recibirás una calificación. Por favor, si no vas a cursar la materia date de baja a tiempo y evita que otros estudiantes que quieran ingresar al curso queden fuera.

Lunes 19 de febrero

Traer este temario y calendario. Introducción a la Biogeografía. Breve exposición sobre el concepto de distribución de seres vivos y el campo de estudio de la biogeografía. Definición de Biogeografía y su campo de estudio. Subdivisiones de la Biogeografía según distintos puntos de vista. Relación con otras Ciencias. Panorama general de la Biogeografía en la actualidad.Tarea: Elegir entre las lecturas propuestas una y entregar resumen:Espinosa, D. y J. Llorente B. , 1993. Capítulo 1. En: Fundamentos de Biogeografías Filogenéticas. UNAM-CONABIO. P 5-22Zunino y Zullini, 2003. Introducción , págs 1-7. Capítulo1: En: Biogeografía. La dimensión espacial de la evolución. Fondo de cultura económica. 359 pp.

Jueves 22

Historia de la biogeografía. Breve exposición sobre el desarrollo de esta disciplina en los periodos de la historia y la época moderna. El período pre-darwiniano. Las primeras explicacionesde la distribución geográfica. Linneo y el concepto de centro de origen. Ley de Buffon. Contribuciones de de Candolle y otros pre-darwinianosTarea: Elegir entre las lecturas propuestas una, entregar resumen y dibujar el mapa de las Regiones Zoogeográficas de Wallace.Espinosa, D. y J. Llorente B. , 1993. Capítulo 2. En: Fundamentos de Biogeografías Filogenéticas. UNAM-CONABIO. P. 23-38Llorente et al. 2001. Síntesis histórica de la Biogeografía. En: Introducción a la Biogeografía en Latinoamérica , teorías, conceptos métodos y aplicaciones. Llorente et al (Eds). P 1-14.Espinosa, Morrone, Llorente y Flores. 2002. Capítulo 1: Introducción. En:Introducción al análisis de patrones en biogeografía histórica. p 1-20Nelson, G y N. Platnick. 1984. Biogeography no. 119. Carolina Biology Readers, 16pp.

Lunes 26

Influencia de la teoría evolutiva por selección natural. Contribuciones de Darwin y Wallace. Desarrollo de las teorías holarticistas y el papel de la dispersión en las escuelas tradicionalesTarea: Revisar las siguientes lecturas para ir preparando un cuadro comparativo sobre los períodos de la historia de la Biogeografía que se entregará al final de la siguiente clase Traer los datos que tengan y un disquete ](o envíenlos a su correo para bajarlos en el laboratorio). Empezaremos a trabajar en bases de datos.Espinosa, D. y J. Llorente B. , 1993. Capítulo 2. En: Fundamentos de Biogeografías Filogenéticas. UNAM-CONABIO. P 38-49Espinosa, Morrone, Llorente y Flores. 2002. Capítulo 1: Introducción. En:Introducción al análisis de patrones en biogeografía histórica. p 20-28Zunino y Zullini, 2003.Capítulo 1:páginas 7-15.En: Biogeografía. La dimensión espacial de la evolución. Fondo de cultura económica. 359 pp.

Jueves 1 de marzo

El período moderno. La teoría de la Tectónica de placas y sus efectos en la distribución de la biota. El papel de la Sistemática en la reconstrucción biogeográfica. El desarrollo de la biogeografía de islasy teoría de refugiosPráctica:Iniciaremos el trabajo en Access. Ejercicio 1: Bajar bases de datos.Tarea: Elegir una de las lecturas siguientes y elaborar un resumen sobre la tectónica de placasCox, B.C. y P. D. Moore. 1993. Cap 7. Patterns in the past. In Biogeography. Blackweel Sci. Pub. London. 170-201Tectónica de placasAlmeida, Pérez y Vizcaíno. 2001. La teoría de Wegener acerca del desplazamiento horizontal de los continentes. En: Introducción a la Biogeografía en Latinoamérica , teorías, conceptos métodos y aplicaciones. Llorente et al (Eds).p. 171-180

Lunes 5

Tectónica de placasTarea: Traer sus datos y Leer:

Escalante, T. et al, 2000. Bases de datos y Sistemas de información: aplicaciones en Biogeografía. Rev. Acad. Colom. Cienc. 24(92): 325-341

Morrone, et al 2000. “Cómo planificar un análisis Biogeográfico” Dugesiana 7(2): 1-8Práctica: trabajo en Access

Jueves 8

Trabajo con las bases de datos en ACCESS traer datos (enviarlos a su cuenta de correo). Los datos que bajaron de internet o que traigan de otras fuentes, ingresarán en una base de datos.

Discutiremos sobre la manera de elaborar el trabajo semestral, cómo van, dudas...etcTarea: Elegir entre las siguientes lecturas y preparar un resumen.Espinosa, Aguilar y Escalante. 2001. Endemismo, Área de endemismo y regionalización biogeográfica. En: Introducción a la Biogeografía en Latinoamérica , teorías, conceptos métodos y aplicaciones. Llorente et al (Eds). 31-38Espinosa, Morrone, Llorente y Flores. 2002. Capítulo 3:Patrones corológicos. En:Introducción al análisis de patrones en biogeografía histórica.p 39-52Rapoport y Monjeau. 2001. Aerografía. En: Introducción a la Biogeografía en Latinoamérica , teorías, conceptos métodos y aplicaciones. Llorente et al (Eds).23-30Zunino y Zullini, 2003.Capítulo 3: El Área de distribución. páginas 45-64.En: Biogeografía. La dimensión espacial de la evolución. Fondo de cultura económica

Lunes12 de marzo

Areografía. Áreas de distribución, Áreas de endemismoTarea: Elegir entre las lecturas y preparar un resumen.

Espinosa et al. 2000. Regionalización biogeográfica de México: Provincias bióticas. En: Biodiversidad, Taxonomía y Biogeografía de Artrópodos de México. Hacia una síntesis de su conocimiento.Volumen II.Llorente et al (Eds).p 61-94

Zunino y Zullini, 2003.Capítulo 4: Biogeografía Sistemática.p. 65-91 En: Biogeografía. La dimensión espacial de la evolución. Fondo de cultura económicaJueves 15Clasificación biogeográfica, regionalización y provincias bióticasEjercicio: introducción al NTSYS (demostración, en tres clases veremos con detalle) Aprenderán a elaborar sus matrices, es necesario traerlas a clase el día 9 de junio para prácticaTarea: LeerPozo et al, 2001. Teoría del equilibrio insular en Biogeografía y Conservación. En: Introducción a la Biogeografía en Latinoamérica , teorías, conceptos métodos y aplicaciones. Llorente et al (Eds).Lunes 19: suspensión de labores (21 de marzo, suspensión por ley)

Jueves 22 de marzo

Biogeografía ecológica. Fundamentos y métodos de la biogeografía del equilibrio insular. La Biogeografía de islas en la conservación de áreas naturalesTarea: Elegir entre las lecturas y hacer resumen. No olvidar sus matrices para trabajar en NTSYSConnor, E: F: 1986. The role of Pleistocene forest refugia in the evolution and biogeography of tropical biotas. TREE 1(6): 165-168Haffer, J. 1982. General aspects of the refuge theory. In G. T: Prance (ed) Biological diversification in the tropics. Cap. 2 ColumbiaUniversity Press. 6-24

Lunes 26 de marzo

Teoría de Refugios pleistocénicos. Práctica: Métodos de ordenación y clasificación: índices de similitud biótica, análisis de agrupamientos, análisis de componentes principales.. traer sus matrices. NTSYSTarea: Investigar el significado de: extinción, colonización, inmigración, barrera, filtro, corredor, dispersión, endemismo, cosmopolitarismo, fauna, flora, horofauna, cenocrón y los criterios para determinar el centro de origen. Traer Fotocopias del ejercicio 13 del Manual de Biogeografía, página 41 y leer los 13criterios de Cain para determinar Centro de origen(pág 40)Morrone, Espinosa y Llorente 1996. Manual de Biogeografía Histórica. P 40 y 41Jueves 29Biogeografía.dispersionista.Conceptos de extinción, colonización, inmigración y su repercusión en biogeografía. Barrera, filtro “sweepstake”, corredores y dispersiónEndemismo y cosmopolitarismo, fauna, flora, horofauna y cenocrón. Criterios para la determinación de centros de origenLos patrones de especiación en la biogeografía dispersionista. Contribuciones de Matthew, Mayr, Simpson y Darlington, métodos de la biogeografía dispersionistaLunes 9 de abrilEXAMEN ITemas 1 a 5Jueves 12 de abrilBIOGEOGRAFÍA FILOGENÉTICA. la reconstrucción filogenética en BiogeografíaLunes 16 La escuela de Hennig-Brundin. Reglas de progresión corológica y regla de desviaciónJueves 19PANBIOGEOGRAFÍA. Conceptos básicos: trazo individual, generalizado, línea de base, centro de masa y nodo. Tarea: Ejercicio de PanbiogeografíaLunes 23Método de Page y Craw. Teoría de grafos y compatibilidad de trazos.Jueves 26Primera entrega: Exposición de trabajos. Entregar original y copia para señalar correcciones.Lunes 30 de abril: suspensión de labores por puente La Panbiogeografía y la conservaciónJueves 3 de mayoBIOGEOGRAFÍA CLADÍSTICA. Conceptos básicos: cladograma taxonómico de áreas, cladograma resuelto de áreas y cladograma general de áreas. Lunes 7 de mayoElaboración de cladogramas:Análisis de componentes: supuestos 1 y 2; Análisis de parsimonia de Brooks: supuesto 0Jueves 10 de mayo: suspensión por SindicatoLunes 14 de mayo: suspensión por sucesión de días inhábilesJueves 17 de mayoEjercicio: Análisis de componentes principales, análisis de parsimoniaComponent y Hennig86Lunes 21 de mayoPAE, la Biogeografía cladística y la conservaciónJueves 24 de mayoExamen Lunes 28 de mayoExposición de trabajos: Segunda entrega. Entregar original y copia para correcciones.Jueves 31 mayoTiempo de trabajo y asesoría en máquinasLunes 4 de junioExposición final de trabajos. Límite para entrega de correcciones.Jueves 7 de junioCalificaciones finalesBIBLIOGRAFÍA BÁSICAAlmeida, Pérez y Vizcaíno. 2001. La teoría de Wegener acerca del desplazamiento horizontal de los continentes. En: Introducción a la Biogeografía en Latinoamérica , teorías, conceptos métodos y aplicaciones. Llorente et al (Eds).p. 171-180Cox, B.C. y P. D. Moore. 1993. Cap 7. Patterns in the past. In Biogeography. Blackweel Sci. Pub. London. 170-201.

Escalante, T. et al, 2000. Bases de datos y Sistemas de información: aplicaciones en Biogeografía. Rev. Acad. Colom. Cienc. 24(92): 325-341

Espinosa et al. 2000. Regionalización biogeográfica de México: Provincias bióticas. En: Biodiversidad, Taxonomía y Biogeografía de Artrópodos de México. Hacia una síntesis de su conocimiento.Volumen II.Llorente et al (Eds).p 61-94

Pozo et al, 2001. Teoría del equilibrio insular en Biogeografía y Conservación. En: Introducción a la Biogeografía en Latinoamérica , teorías, conceptos métodos y aplicaciones. Llorente et al (Eds).