Presentación del grupo 5035 - 2007-2.

Profesor de la parte teórica: Alfredo Torres Larios

e-mail: torres@ifc.unam.mx

http://www.xtalloifc.com

Metodología de la enseñanza:

Curso teórico-práctico.

Evaluación del curso:

Ponderaciones: laboratorio 45%, teoría 45% y Examen departamental 10%. 

Para acreditar la materia todas las calificaciones tendrán que ser aprobatorias.

Parte teórica:

Para aprobar se requiere la asistencia mínima del 80%,

Numero de exámenes parciales: 5 (ver el programa).

Todos los exámenes parciales contarán con un componente que se resolverá en salón (70%) y otro que se resolverá en casa (30%).

La calificación final se basará en los siguientes términos:

Exámenes 80%

Exámenes cortos semanales 10%

Participación en clase 5%

Tareas: 5%

Reposiciones de exámenes: 1 sola reposición obligatoria en caso de tener algun exámen parcial reprobado. Este exámen abarcará el contenido de todo el curso.

Escala de calificaciones:

0 - 5.99 = 5

6 - 6.5 = 6

6.6 - 7.5 = 7

7.6 - 8.5 = 8

8.6 - 9.5 = 9

9.6 - 10 = 10

Temario:

I. INTRODUCCIÓN AL ESTUDIO DE LA CELULA10 h.

Se presenta el contexto general del estudio de la célula y de la organización celular de los sistemas biológicos.

I.1.Antecedentes y generalidades

I.1.1. Teoría celular.

I.1.2.Origen y evolución celular. Arquea, eubacteria y eucaria.

I.2.Organización y estructura general de los sistemas biológicos a nivel celular.

I.2.1. Procariontes

I.2.2. Eucariontes

I.2.3. Sistemas virales

II. ANALISIS ESTRUCTURAL Y FUNCIÓNAL DE MACROMOLECULAS INFORMACIÓNALES EN LOS SISTEMAS BIOLOGICOS.54 h.

El alumno aprenderá la importancia de las diversas macromoléculas presentes en los seres vivos, así como la estructura y funcioNes que desempeñan los ácidos nucléicos en la vida.

II.1. El agua

II.2. Conceptos de pH y pI. Amortiguadores.

PRIMER EXAMEN PARCIAL

II.3. La relación estructura-función a nivel de las proteínas.

II.3.1. Propiedades fisicoquímicas y clasificación de los aminoácidos.

II.3.2. Estructuras primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.

II.3.3. Métodos de purificación y análisis de proteínas.

II.3.4. Proteínas estructurales: queratinas, colágena.

II.3.5. Proteínas de transporte: mioglobina y hemoglobinas.

II.3.6. Autoensamble y polimerización de proteínas.

II.4. Enzimas

II.4.1. Equilibrio químico

II.4.2. Energía libre de activación y mecanismo de catálisis.

II.4.3. Cofactores y coenzimas

II.4.4. Concepto y estructura del sitio activo

II.4.5. Cinética enzimática. Inhibidores de la actividad enzimática. Regulación de la actividad enzimática. Alosterismo, modificaCIÓNes covalentes y activación de zimógenos

SEGUNDO EXAMEN PARCIAL 

II.5. Estructura de los acidos nucleícos

II.5.1. Nucleótidos y polinucleótidos. DNA y RNA.

II.5.2. El modelo de la doble hélice de Watson y Crick. ConformaCIÓNes A, B y Z.

II.5.3. InteracCIÓNes de los ácidos nucléicos con proteínas

II.6. Organización y características del material genético en los sistemas biológicos.

               II.6.1. Contenido de DNA en los organismos. La paradoja C.

II.6.2. DNA y RNA virales.

II.6.3. DNA bacteriano

II.6.4. Elementos genéticos móviles: transposones, plásmidos. ImplicaCIÓNes evolutivas: transferencia genética horizontal.

II.6.5. El genoma eucarionte: DNA alta y medianamente repetido, DNA de copia única. Genes partidos: exones e intrones.

II.6.6. Estructura molecular del cromosoma eucarionte. Nucleosomas.

II.6.7. DNA en organelos.

TERCER EXAMEN PARCIAL 

II.7. Los flujos de información en los sistemas biológicos

               II.7.1. El dogma central de la biología molecular

II.7.2. Características generales del código genético

II.7.3. Clasificación de las mutaCIÓNes: puntuales y no puntuales.

II.7.4. Clasificación de las mutaCIÓNes puntuales: deleCIÓNes, inserCIÓNes, transiCIÓNes y transversiones.

II.7.5. Clasificación de las mutaCIÓNes con respecto al código genético: silenciosas, de sentido equivicado, sin sentido. Teoría neutralista de la evolución.

               II.7.6. Comparación de secuencias de proteínas y ácidos nucléicos a lo largo de la escala filogenética. Homología y similitud a nivel molecular; genes ortólogos y parálogos.

               II.7.7. Replicación, reparación del DNA y recombinación.

II.7.8. Transcripción. Procesamiento postranscripCIÓNal del RNA

II.7.9. Traducción

CUARTO EXAMEN PARCIAL 

II.8. Regulación de la expresión génica

II.8.1. El paradigma del modelo del operón en bacterias.

II.8.2. Eucariontes. Sistemas unicelulares y pluricelulares, totipotencialidad, genes de diferenciación y genes de rutina, niveles de expresión, genes de segmentación y genes homeóticos.

II.9. Tecnología de DNA recombinante.

II.9.1. Clonación de DNA. Endonucleasas de restricción. Vectores de clonación.

II.9.2. Hibridación de secuencias específicas en ácidos nucléicos.

II.9.3. Amplificación de secuencias específicas. PCR.

II.9.4. Secuenciación de ácidos nucléicos.

II.9.5. Expresión de los productos de clonación.

QUINTO EXAMEN PARCIAL

Bibliografía básica:

Horton, Robert H., et. al. Principles of Biochemistry. Neil Patterson, Englewood Cliffs, N. J., 1993.

Lehninger, Albert L., et. al. Principles of Biochemistry. 2nd ed., Worth Pubs. New York, 1993.

Mathews, Christopher K. y K. E. van Holde. Biochemistry. Benjamin/Cummings, Redwood City, California, 1990.

Rawn, J. David. Biochemistry. Neil Patterson, Englewood Cliffs, N. J., 1989.

Stryer, Lubert. Biochemistry, 3rd ed., W. H. Freeman, New York, 1988.

Voet, Donald y Judith G. Voet. Biochemistry. John Wiley, New York, 1990.

Bibliografía complementaria:

 	Se mencionara la bibliografia complementaria a lo largo del curso.